利用癌功能类从癌基因组突变谱中识别癌基因

从大规模癌样本基因突变扫查数据中识别癌基因具有重要的意义. 一些重要功能的改变对于癌的发生发展是必需的, 因此将它们定义为癌功能类, 并从GO(Gene Ontology)中选择一组显著富集已知癌基因的细致功能类来代表它们. 为了评价以癌相关功能类作为特征识别癌基因的效果, 将已知的蛋白激酶癌基因定义为阳性金标准, 而将其他的蛋白激酶基因定义为阴性金标准. 结果表明, 与利用选择压力作为特征的方法比较, 利用癌相关功能类作为特征的方法可以更有效地识别癌基因. 进一步结合癌相关功能类与基因非同义突变个数可以产生更可靠的预测结果. 最后, 将46个注释到癌相关功能类并且其非同义突变个数至少为3的蛋白激酶基因预测为癌基因, 预测精确率达到0.42.     

iQPR法处理水对SD鼠生物安全性的研究

iQPR技术处理污水是一项新型尖端的技术,此技术可以成功降低污水乃至受到污染的地下水中的各种污染指标。但是,iQPR技术处理污水尤其是地下水是否存在潜在的生物安全性问题有待于进一步研究。因此,为评估iQPR技术对生物安全性的影响,本研究首先分析了三种不同iQPR法处理水的水质成分;其次系统研究了iQPR水对SD鼠在个体水平、组织水平和病理形态学损伤的研究。研究表明:iQPR处理的水质成分较对照组普通饮用水好,在个体组织水平检测未见异常,尽管其中一组iQPR处理水造成了SD鼠的脾小体增大,但是可能的原因是水处理环节存在微生物污染现象,因此,初步认定此技术未造成SD大鼠的个体损伤。本研究为揭示iQPR处理的水对生物体的安全性评价提供一个理论依据。     

A combined A431 cell membrane chromatography and online high performance liquid chromatography/mass spectrometry method for screening compounds from total alkaloid of Radix Caulophylli acting on the human EGFR

We have developed an online analytical method that combines A431 cell membrane chromatography (A431/CMC) with high performance liquid chromatography and mass spectrometry (LC/MS) for identifying active components from Radix Caulophylli acting on human EGFR. Retention fractions on A431/CMC model were captured onto an enrichment column and the components were directly analyzed by combining a 10-port column switcher with an LC/MS system for separation and preliminary identification. Using Sorafenib tosylate as a positive control, taspine and caulophine from Radix Caulophylli were identified as the active molecules which could act on the EGFR. This A431/CMC-online-LC/MS method can be applied for screening active components acting on EGFR from traditional Chinese medicines exemplified by Radix Caulophylli and will be of great utility in drug discovery using natural medicinal herbs as a source of novel compounds.     

The laboratory evaluation of repellent effect of camouflage face paint mixed with DEET to Aedes albopictus

参照中华人民共和国国家标准GB/T 17322.10-1998和《军队特需药品研发勤务技术指导原则(试行)》规定的测试方法,测试了避蚊胺和水溶性二氧化钛处理迷彩油(CFP)对白纹伊蚊Aedes albopictus的驱避效果,为研发我军专用的防蚊虫迷彩油提供依据.结果表明:在3种颜色迷彩油中加入DEET后,不影响DEET的驱蚊效果;添加不同浓度DEET对蚊虫的驱避效果差异显著,20％dEET和25％dEET+迷彩油对白纹伊蚊的平均防护时间均达到或超过10h,达到《军队特需药品研发勤务技术指导原则(试行)》规定的标准,15％dEET+迷彩油平均防护时间不足10h,未达《军队特需药品研发勤务技术指导原则(试行)》规定的标准.研究表明:将适量DEET与迷彩油混合涂抹于皮肤可能作为演习或战时的伪装和防蚊的一种有效的综合保护措施.     

Genome-wide analysis of the Chinese sturgeon sox gene family: identification,characterisation and expression profiles of different tissues

The sox family is assumed to be responsible for a number of developmental systems. Genome sequencing technology makes it possible to scan sox genes and conduct characteristic analyses of different species. In fish, full characterisation of sox genes at the genome-wide level has been reported for pufferfish Takifugu rubripes, medaka Oryzias latipes, tilapia Oreochromis niloticus and channel catfish Ictalurus punctatus. However, no systematic investigation of the sox family in sturgeons (Acipenseridae) has been reported to date. This study conducted genome-wide identification of the sox genes in the Chinese sturgeon Acipenser sinensis and profiled their tissue distribution between male and female individuals. In total, 19 sox genes were identified, including soxb1, b2, c, d, e, f and h, in the Chinese sturgeon. Genomic structure analysis indicated relatively conserved exon–intron structures in each sox group and phylogenetic analysis supported the previous classification of the sox family. Most of the sox genes showed a tissue-specific expression pattern, indicating the possible involvement of Chinese sturgeon sox genes at different developmental processes such as cardiac and gonadal development. This study provides a comprehensive resource of Chinese sturgeon sox genes and enables a better understanding of the evolution and function of the sox family.     

代谢、血液碱化和纯氧影响呼吸调控的人体实验研究III： 血液碱化后纯氧运动试验*

目的: 在急性血液碱化前、后空气吸入下完成症状限制性最大极限心肺运动试验(CPET)的基础上,本文探讨在血液碱化后吸入纯氧对呼吸调控的影响。方法: 正常志愿者5名在碱化血液后呼吸纯氧CPET,在静息、热身、运动及恢复期,连续测定肺通换气指标及每分钟动脉取样的血气指标,对CPET期间的呼吸气体交换和血气指标的动态变化进行分析,同时与急性碱化血液前、后空气CPET数据比较。结果: 碱化血液后吸入纯氧运动呼吸反应与急性碱化血液前、后空气CPET呼吸反应基本一致。CPET期间,各运动状态下的每分通气量均与对照组相似(P>0.05);仅静息每分通气量较血液碱化空气CPET略高(P<0.05),而其它状态和恢复2min时均相近(P>0.05)。潮气量仅峰值运动时较对照和血液碱化空气CPET略低(P<0.05);而运动过程和恢复2min时的潮气量均相近(P>0.05)。呼吸频率在各个时间与血液碱化前后CPET均无差异(P>0.05)。在碱化血液后吸入纯氧运动各个时期的PaO₂和SaO₂较碱化血液前后空气CPET时明显提高(P<0.001,P<0.05)。血红蛋白浓度虽然较急性血液碱化前后均低,但仅较血液碱化前显著降低(P<0.05),比血液碱化后差异不显著(P>0.05) ; 开始时的PaCO₂较碱化血液前后空气CPET时降低(P<0.05),无氧阈时相近(P>0.05),但到峰值及恢复2 min时明显增高(P<0.05);pH仅较对照增高(P<0.05),但与碱化血液空气试验时无差异;乳酸水平较对照略高,但仅在热身和恢复期有差异(P<0.05)。纯氧提高了两人无氧阈和三人峰值运动的功率和时间。结论: 虽然血液碱化给予纯氧, CPET呼吸反应与碱化血液前、后空气CPET呼吸反应模式相似,表明运动中呼吸反应主要取决于代谢变化,而非动脉血气平均值高低。     

GSK-3在阿尔茨海默病样细胞骨架蛋白过度磷酸化中的作用(英)

神经原纤维缠结是阿尔茨海默病（Alzheimer disease, AD）的特征性病理改变.蛋白激酶和蛋白磷酸酯酶失衡可导致骨架蛋白的异常过度磷酸化,而异常过度磷酸化的tau 和神经丝 (neurofilament, NF) 是神经原纤维缠结的组成部分.在众多激酶中,糖原合酶激酶-3（glycogen synthase kinase-3,GSK-3）可能是AD神经退行性变起重要作用.为深入探讨GSK-3在AD样神经退行性变中的作用,以磷酯酰肌醇三磷酸激酶（phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K）的特异性抑制剂渥曼青霉素（wortmannin,WT）处理野生型鼠成神经瘤细胞株（wild type mouse neuroblastoma cell lines, N2a wt）,系统观察WT处理N2a wt不同时间点（1 h、3 h、6 h）细胞代谢率、细胞形态、细胞骨架蛋白tau和NF的磷酸化状态改变以及细胞的命运,并分析了GSK-3活性与上述参数改变之间的相关性.结果发现：1 μmol/L WT处理细胞1 h,GSK-3活性与未经WT处理的对照组相比明显增高,并伴有Ser9磷酸化的GSK-3水平的降低; NF磷酸化程度增强,tau在Ser198/Ser199/Ser202位点的磷酸化增强. 1 μmol/L WT处理细胞3 h,GSK-3活性与对照组和处理1 h 组相比明显下降,NF磷酸化程度较1 h降低,但仍高于正常水平.1 μmol/L WT处理细胞6 h,细胞形态、GSK-3活性、Ser9磷酸化形式的GSK-3β的表达、NF磷酸化程度与对照组相比均无明显改变.WT呈剂量依赖性降低细胞代谢率.1 μmol/L WT处理细胞1 h和3 h导致细胞变圆,突起变短甚至消失.1 μmol/L WT处理细胞1 h,用TUNEL法和电子显微镜技术未观察到细胞凋亡.研究结果提示：在N2a细胞中过度激活GSK-3可导致神经细丝和tau蛋白的AD样过度磷酸化,从而引起神经细胞的AD样退行性变.