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Modern genetic analyses rely on efficient genotyping of single-nucleotide polymorphisms (SNP) or insertion/deletion length polymorphisms (InDel) in genomes. Methods available to genotype these polymorphisms include sequencing, cleaved amplified polymorphic sequence, high-resolution DNA melting, and microarray analyses, which are all rather tedious or expensive to set up for daily use. Here, we report a simplified label-free CELI endonuclease (CELI)-based protocol that enables us to detect both SNPs and InDels for fragment lengths between 500 and 6 kb. PCR-amplified target DNA fragments were annealed, cleaved by CELI, and analyzed either cost-effectively by agarose gel electrophoresis or automatically by capillary electrophoresis. The optimal amplification sizes, potential blind ends, and the maximum pooling capacities were examined for both electrophoresis protocols. We believe that the CELI-based genotyping protocol can be used in the detection of mutations, marker-assisted breeding, map-based cloning, and genome-wide association studies. 相似文献
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芒果老叶在增强UV-B辐射处理下的损伤和保护反应 总被引:1,自引:0,他引:1
以‘台衣一号’芒果盆栽苗离体老叶为试材,研究增强UV—B辐射条件下芒果老叶的损伤和保护反应。结果表明:UV—B辐射处理使芒果叶片MDA含量和相对电导率升高、叶绿素含量和叶绿素a/b降低,表明叶片受到损伤,且随处理时间延长叶片损伤加重。UV—B辐射处理叶片可溶性蛋白含量、抗氧化酶(SOD、CAT、POD)活性、保护色素(类胡萝卜素、类黄酮)和还原型GSH含量显著高于对照叶片,UV—B辐射处理叶片维生素C含量显著低于对照叶片,表明增强UV—B辐射可诱导叶片细胞通过提高活性氧清除能力和积累保护色素而直接吸收部分UV—B辐射来提高抗增强UV—B辐射损伤的能力。 相似文献
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尼罗鳄线粒体基因组全序列分析及鳄类系统发生关系的探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
大多数脊椎动物的线粒体基因组(约16—18kb)的组成是相对较稳定的,但在不同类群中,线粒体基因组在基因结构和基因排列方式等方面均显示了极大的多样性,这种多样性可能反映了真核细胞不同的进化路线(Saccone et al.,1999)。就目前的研究而言,线粒体基因组是惟一一个能够从基因组水平上来分析动物系统发生的分子标记,可以从线粒体基因组序列信息、基因组成及基因排列方式等进行多方位的分子进化研究,因而线粒体基因组全序列将成为动物分子系统发生最有力的证据(Saccone et al.,1999)。 相似文献
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目的:通过比较添加不同浓度的无血清培养添加剂N2、B27对神经干细胞增殖的影响,探讨一种最优的体外培养大鼠胚胎神经干细胞的方法。方法:分离培养胚胎13.5dSD大鼠的神经干细胞,采用CCK-8细胞计数、BrdU掺入、测量神经球直径的方法,比较不同浓度N2、B27对神经干细胞增殖的影响。结果:N2与B27合用对神经干细胞增殖和成球的作用最为明显,单独添加2%B27的作用优于1%B27和N2组。结论:1%N2和1%B27同时添加更有利于神经干细胞的增殖和自我更新,此方法为神经干细胞的应用提供了实验依据。 相似文献
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中国香菇自然种质的rDNA遗传多样性分析 总被引:11,自引:0,他引:11
测定了全国范围内的59个野生香菇菌株rDNA的ITS区域的序列。所得序列的总长度在723-727个碱基之间,G+C含量也基本稳定在57.5%左右。用Phylip3.6软件包对59个ITS序列进行DNA数据分析。结果表明59个菌株被划分到3个不同的谱系中,其中谱系Ⅰ包括11个菌株,分布较为均衡,涉及东北、西北、西南和东部沿海等地区的8个省份;谱系Ⅱ包括14菌株,以西北、西南的4个省份为主;谱系Ⅲ包括34个菌株,覆盖范围最广,除东北和西北高原地区外,其它均有涉及。地缘关系分析表明以陕、甘为主的西北高原地区的菌株涉及Ⅰ、Ⅱ两个谱系;以闽、浙、赣和台湾为主的东部沿海地区的菌株涉及Ⅰ、Ⅲ两个谱系;而以云、贵、川为主的西南地区的菌株则覆盖到了所有的3个谱系。这三个地区的香菇遗传多样性最丰富,西南地区尤为突出,是香菇种质资源保护与利用的重点区域。 相似文献