泥鳅多糖清除活性氧和保护DNA链的作用

采用化学发光法和分光光度法在多种化学模拟体系中研究了泥鳅多糖清除活性氧的作用 ,并用化学发光法观察了泥鳅多糖对·OH导致DNA链损伤的抑制作用。结果表明 ,泥鳅多糖能够有效地清除O·-2 、·OH、H2 O2 等活性氧 ,对DNA链具有良好的保护作用     

口臭症口腔微生态学的研究

目的 :研究口臭症患者口腔菌群分布。方法 :选择 3 0例口臭患者和 3 0例健康人 ,分别采集舌背舌苔和牙周袋菌斑作细菌的需氧、微需氧和厌氧菌的定量培养 ,并对牙龈卟啉单胞菌及衣氏放线菌做抑菌试验。结果 :口臭组舌背厌氧菌及微需氧菌总数 (12 .2± 1.3 2 )与健康对照组 (9.5± 1.2 4)差异有非常显著性 (P<0 .0 1) ,口臭组需氧菌总数与健康组差异有显著性 (P<0 .0 5) ;口臭组牙周袋厌氧菌及微需氧菌总数 (13 .12± 1.2 6)明显高于健康对照组 (11.3± 1.82 ) ,两者差异有非常显著性 (P<0 .0 1) ,而需氧菌差异无显著性 ;口臭症舌背以小韦荣菌为主 ,其次是黑色普氏菌 ;牙周袋菌斑以牙龈卟啉单胞菌和黑色普氏菌为主 ,其次是衣氏放线菌。并筛选出两类抗菌漱口水和一种中外合资抗口臭牙膏 ,对舌背及牙周袋菌斑的主要细菌牙龈卟啉单胞菌和衣氏放线菌有明显的抑制作用。结论 :口臭症患者口腔菌群分布和总数与正常人群存在显著的差异 ,与牙周病有关的致病菌数量明显高于正常人群 ,据抑菌试验结果采用有效的漱口液及牙膏可明显降低口腔内致病菌和改善口臭症状。     

The high expression of Aspergillus pseudoglaucus protease in Escherichia coli for hydrolysis of soy protein and milk protein

Abstract

The hydrolysates of soy protein and milk protein are nutritional and functional food ingredients. Aspergillus pseudoglaucus aspergillopepsin I (App) is an acidic protease, including signal peptide, propeptide, and catalytic domain. Here, we cloned the catalytic domain App with or without propeptide in Escherichia coli. The results showed that the App without propeptide was not expressed or did not exhibit activity and App with propeptide (proApp) was highly expressed with a specific activity of 903?U/mg. Moreover, the denaturation temperature of proApp was 4.1?°C higher than App’s. The proApp showed 104?U/mg and 252?U/mg hydrolysis activities towards soy protein and milk protein under acidic conditions. By RP-HPLC analysis, the peptides obtained from the hydrolysates of soy protein and milk protein were hydrophilic peptides. This work first demonstrates efficient proteolysis of soy protein and milk protein through the functional expression of full-length proApp, which will likely have valuable industrial applications.     

长潭水库铁锰含量与环境因子的季节性变化相关性分析及铁锰氧化菌群的富集培养

【背景】目前对水库水体污染原因的研究往往专注于水体的富营养化、pH值、溶解氧、氨氮、菌落总数指标的变化,而重金属含量与环境因子的季节性变化相关性分析研究较少,同时对于典型季节原位微生物种群的多样性差异研究尚未见报道。【目的】研究浙江省台州市长潭水库底部水中正二价金属离子(二价锰离子Mn²⁺;二价铁离子Fe²⁺)浓度与不同环境因子的季节性变化规律,并对其相关性进行分析;富集平水期(2月)和丰水期(8月)水库底部水体中功能微生物菌群,分析其种类和丰度的差异。【方法】分别检测12个月的水库水Mn²⁺和Fe²⁺浓度及多种环境因子(水体溶解氧浓度、pH值、总磷浓度、浊度、水库环境温度及降水量),过滤并富集培养水库底部水体的功能微生物菌群,对其16S rRNA基因V3-V4区测序并分析其菌群结构。【结果】长潭水库水中Mn²⁺和Fe²⁺浓度呈季节性变化,每年的春夏交替季节水体中铁锰含量从零开始慢慢升高,至夏秋高温季节水体中Mn²⁺和Fe²⁺浓度达到最高值,然后慢慢降低,至秋末冬初检测不到含量。在检测的多种环境因子中,水体溶解氧浓度、水库环境温度及降水量呈明显的季节性规律变化。Mn²⁺和Fe²⁺浓度与温度、降水量和浊度有正相关性,与溶解氧浓度、pH值和总磷浓度有负相关性,其中在正负相关性分析中两种金属离子的浓度与溶解氧浓度的相关性最强,其次是环境温度及降水量。丰水期和平水期中富集获得的功能微生物菌群的种类和丰度差异很大,从属水平上分类,丰水期时菌群只包含不动杆菌(Acinetobacter)和鲑色沉积物杆状菌(Sediminibacterium)这2个属的菌株,含量各占约50%;平水期时菌群则主要由杆菌属(Bacillariophyta) (47.62%)和Limnohabitans(9.52%)等9个属的菌株构成。富集获得的平水期和丰水期的两个可培养的菌群均具有去除水库水中Mn²⁺的功能,去除率分别约为35.9%和11.4%。【结论】长潭水库底部水体中Mn²⁺和Fe²⁺浓度与不同环境因子均呈季节性规律变化,它们之间呈现不同的正负相关性,丰水期和平水期的功能微生物菌群结构差异很大。本研究为利用微生物进行重金属污染水体的治理储备了微生物资源,为实现国家“美丽乡村”的建设目标提供一定的参考价值。     

Construct optimization for protein NMR structure analysis using amide hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry

Disordered or unstructured regions of proteins, while often very important biologically, can pose significant challenges for resonance assignment and three‐dimensional structure determination of the ordered regions of proteins by NMR methods. In this article, we demonstrate the application of ¹H/²H exchange mass spectrometry (DXMS) for the rapid identification of disordered segments of proteins and design of protein constructs that are more suitable for structural analysis by NMR. In this benchmark study, DXMS is applied to five NMR protein targets chosen from the Northeast Structural Genomics project. These data were then used to design optimized constructs for three partially disordered proteins. Truncated proteins obtained by deletion of disordered N‐ and C‐terminal tails were evaluated using ¹H‐¹⁵N HSQC and ¹H‐¹⁵N heteronuclear NOE NMR experiments to assess their structural integrity. These constructs provide significantly improved NMR spectra, with minimal structural perturbations to the ordered regions of the protein structure. As a representative example, we compare the solution structures of the full length and DXMS‐based truncated construct for a 77‐residue partially disordered DUF896 family protein YnzC from Bacillus subtilis, where deletion of the disordered residues (ca. 40% of the protein) does not affect the native structure. In addition, we demonstrate that throughput of the DXMS process can be increased by analyzing mixtures of up to four proteins without reducing the sequence coverage for each protein. Our results demonstrate that DXMS can serve as a central component of a process for optimizing protein constructs for NMR structure determination. Proteins 2009. © 2009 Wiley‐Liss, Inc.     

西双版纳区域气候变化对植物生长趋势的影响

目前全球变暖已经致使地球上生物群系的格局发生了显著的变化。高纬度地区的植物生长由此变得更加活跃,而热带地区植物生长的趋势仍然是一个具有争论的问题。西双版纳热带植物园地处中国西南地区,20世纪70年代以来,这里气候发生了显著的变化,其气温以每10年0.18℃的速度上升。本研究利用西双版纳热带植物园中的48种热带植物（28科）的株高生长数据（1974～2003年）来分析其对西双版纳区域气候变化的长期变化响应,通过对株高与气候因子的相关分析选出对植物株高生长影响最大的气候因子。结果表明,植物在研究期间的株高生长年间波动比较强烈,但没有表现出明显的趋势;植物的株高生长主要受到干热季（3、4月份）的日照时数（负）与月均最低气温（正）所影响,而干热季正是这些植物每年开始萌叶的时期;另外,降雨并没有对引种植物株高生长产生显著的影响;从2个关键因子的长期变化趋势来看,西双版纳气候变化将有利于保护植物的生长,进而将有利于植物园内热带植物的保护与保存。     

桔核中柠檬苦素类物质消炎镇痛作用的研究

为探讨柑桔果实中柠檬苦素类物质对实验动物模型的抗炎镇痛作用,本文通过小鼠耳廓肿胀模型和角叉菜胶致大鼠足肿胀模型观察柠檬苦素的抗炎作用;采用小鼠福尔马林实验及扭体实验观察柠檬苦素的镇痛作用。结果表明：柑桔果实中柠檬苦素类物质能显著抑制二甲苯致小鼠耳廓肿胀和角叉菜胶致大鼠足肿胀程度;减少扭体次数;显著提高小鼠福尔马林实验中的痛域。因此,柑桔果实中柠檬苦素类物质对本实验中的动物模型具有显著的抗炎及镇痛作用。     

玉米农田土壤呼吸作用的空间异质性及其根系呼吸作用的贡献

基于4月底到9月底东北地区玉米农田土壤呼吸作用全生长季的观测,阐明了土壤呼吸作用的空间异质性特征,综合分析了水热因子、土壤性质、根系生物量及其测定位置对土壤呼吸作用空间异质性的影响,并对生长季中根系呼吸作用占土壤呼吸作用的比例进行了估算。结果表明,在植株尺度上,土壤呼吸作用存在着明显的空间异质性,较高的土壤呼吸速率通常出现在靠近玉米植株的地方。根系生物量的分布格局是影响土壤呼吸作用空间异质性的关键因素。在空间尺度上,土壤呼吸作用与根系生物量呈显著的线性关系,而土壤湿度、土壤有机质、全氮和碳氮比对土壤呼吸作用空间异质性的影响并不显著。通过建立土壤呼吸作用与玉米根系生物量的回归方程,对根系呼吸作用占土壤呼吸作用的比例进行了间接估算。玉米生长季中,根系呼吸作用占土壤呼吸作用的比例在43．1％～63．6％之间波动,均值为54．5％。     

塔里木河下游不同退化区地表植被和土壤种子库特征

对塔里木河下游不同退化程度的4个典型断面进行了植被和土壤种子库的取样调查,采用种子萌发试验研究了不同退化区植被和土壤种子库的特征,结果表明:(1)塔里木河下游地表植被表现为严重的逆行演替,具体体现为胡杨林都为过熟林,几乎没有胸径在10cm以下的幼林;植被盖度、密度和多样性指数均维持在一个较低的水平上;随退化程度不断加重,地表植被中草本植物的相对密度、相对盖度和相对频度逐渐降低,而灌木和乔木的相对密度、相对盖度和相对频度逐渐增加;(2)研究区土壤种子库的基本特征是:土壤种子库种类贫乏、密度低、多样性指数和相似性系数不高;(3) 随退化程度的加重,土壤种子库物种数不断减少、密度明显下降、优势种组成趋于单一、表层种子库比例升高、1年生草本植物占优势逐渐向多年生草本植物和灌木植物转变及土壤种子库物种组成与地上植被物种组成上差异显著.     

枯否细胞对大鼠再生肝细胞转录活性和LDH的影响

目的与方法 SD大鼠随机分成3组,即C组(切除2/3肝叶)、L组(切除2/3肝叶后注射LPS)和G组(GdCl3预处理后切除2/3肝叶),研究大鼠肝再生期间(0～144 h)再生肝重量比、AgNORs数量、乳酸脱氢酶的变化.结果 L组肝重量比在16～48 h低于C组(P<0.05),AgNORs的数量在48 h达到最大值(P<0.01,与正常对照组相比).G组再生肝重量比在16～36 h低于C组(P<0.05),AgNORs的数量在36 h即达到高峰,乳酸脱氢酶新增一条LDH4谱带,其平均密度在36 h达到最高值.结论 肝切除后注射LPS,抑制了早期的肝再生进程,注射GdCl3灭活枯否细胞后利于肝脏的早期再生.