串联质谱图谱从头测序算法研究进展

近年来,基于质谱技术的高通量蛋白质组学研究发展迅速,利用串联质谱图谱鉴定蛋白质是其数据处理中一个基础而又重要的环节．由于不需要利用蛋白质序列数据库,从头测序方法能够分析新物种或者基因组未测序物种的串联质谱数据,具有数据库搜索方法不可替代的优势．简要介绍高通量串联质谱图谱从头测序问题及其研究现状．归纳出几种典型的计算策略并分析了各种策略的优缺点．总结常用的从头测序算法和软件,介绍算法评估的各种指标和常用评估数据集,概括各种算法的特点,展望未来研究可能的发展方向．     

唐古特大黄五个居群的核型

报道了唐古特大黄(Rheum tanguticum)5个居群的染色体数目和核型,结果如下:大武、柯曲、达卡三个居群均为2n=2x=22=2sm 20m;吉卡居群为2n=2x=22=20m 2M;松潘居群为2n=2x=22=2sm 18m 2M。大武,柯曲和吉卡居群核型类型属于1A型,达卡和松潘居群属于2A型。Q型聚类分析结果表明,5个居群在核型上存在一定分化,这可能是由不同的生境造成的。     

中国硅藻化石新种和新记录种

在对江汉平原钻孔中的化石硅藻进行鉴定时,发现1个新种类：江汉异极藻（新种）Gomphonema jianghanensis sp.nov.,该种的主要特征为：壳面狭披针形或线性披针形,端部和基部圆形,中轴区窄。中心区宽呈横矩形,在紧靠中心区的一侧具1条很短的线纹,另一侧有时有1条很短的线纹,有时没有线纹,无孤点。壳缝呈直线,在中央区附近略弯向一侧,在极节处折向另一侧。线纹轻微放射状,中部略弯曲,在近顶端处没有线纹,在10μm内,中部具6—13条。长20—30μm,宽4—7μm。4个中国新记录属：楔异极藻属Gomphosphenia Lange-Bertalot、楔月藻属（新记录属）Cymbopleura Krammer、优美藻属Delicata Krammer、尖月藻属Encyonopsis Krammer,8个中国新记录种：微小异极藻Gomphonema minutiforme Lange-Bertalot＆Reichardt、较细楔异极藻Gomphosphenia tenerrima（Hustedt）Reichardt、舌状楔异极藻Gomphosphenia lingulatiforme（Hustedt）Lange-Bertalot、瑞克舟形藻Navicula rakowskae Lange-Bertalot、北方羽纹藻岛屿变种Pinnularia borealis var.islandica Lange-Bertalot,舟形盖斯勒藻Geissleria tectissima（Lange-Bertalot）Lange-Bertalot＆Metaeltin、岩生楔月藻小变种Cymbopleura rupicola var.minor Krammer和法国尖月藻Encyonopsis falaisensis（Grunow）Krammer,1个种的补充说明：中华优美藻Delicata sinensis Krammer ＆ Metzetin。     

大菱鲆肌肉组织中的基因差异表达与体长性状的相关性研究

为了揭示出一些影响鱼类生长发育速度方面的遗传信息,本文应用mRNA差异显示技术,以同一批受精卵孵化的同池养殖的两组大菱鲆鱼为试验材料,检测了在相同生长发育条件下两组体长相差悬殊的3月龄大菱鲆肌肉组织的基因差异表达。结果：18对引物组合共显示出723条带,其中有527条带能够重现,差异显示条带的重现率为72.89%;在527条稳定的条带中有21条为差异带,其余506条为共有带（96.02%）。21条差异表达条带中有16条（3.04%）为阳性差异表达cDNA片段。这些差异表达cDNA片段的存在,说明体长差异悬殊的两组大菱鲆之间存在基因表达上的差异。试验结果对于进一步分析各种差异表达基因与大菱鲆的生长性状之间的相关关系奠定了基础;为深入研究大菱鲆的生长发育性状的分子遗传机制奠定了基础。     

中国紫金牛属圆齿组果实微形态特征研究

对国产紫金牛科紫金牛属圆齿组(Ardisia Sect. Crispardisia)16种植物的果实表面进行了扫描电镜观察。经观察果实为球形,表面多无毛,稀有柔毛。多数种具腺点,极少数无腺点或不明显,腺点疣状、粒状或横棒状,腺点常与果实表面突起具对应关系。果实表面纹饰大致可分为3种:基本平滑、多皱、波状网纹。某些种不同部位的纹饰差异较为明显。本研究结果对种间鉴别具有重要意义,并且不支持将珍珠伞A. maculosa归并入钮子果A. polysticta中。     

应用热扩散法测定香蕉树蒸腾速率

香蕉树植株高大,一般采用间接方法确定耗水量,但所得结果受土壤、大气和农艺措施等因素的影响较大.本文于2005年11月15日—12月5日在温室内采用热扩散法（即Granier法）测定香蕉树的茎液流,并与用数字天平（称重法）测定的香蕉树蒸腾速率进行对比试验. 结果表明,Granier法测定的日茎液流量与称重法测定的日蒸腾量相差4％.Granier法测定的茎液流速率一般滞后于称重法确定的蒸腾速率1 h左右.当日蒸腾量小于0.05 L·m^-2（活性叶面积）时,Granier方法不能测定茎液流量.Granier传感器一般在安装2～3 d后即可正常工作,同时在多株植株上安装Granier传感器取其平均流速值计算蒸腾量可以明显减小测量误差.     

寒区生态系统中多年冻土研究进展

近地表面的多年冻土是陆地生态系统重要的组成部分,其研究是生态、水文和工程建设研究者关心的重要议题。气候是多年冻土重要的影响因子,国内外研究中,与气候变化相结合的多年冻土研究是当前研究的重要方面;同时,多年冻土的水文学、生态学意义研究也在广泛开展。我国的多年冻土研究一直与寒区经济建设和开发紧密联系,在冻土分布、类型、温度、冻土退化及冻土区开发利用等方面取得了丰硕的成果。未来还应注重高分辨率冻土分布制图、融深变化的研究,并建立长期的多年冻土变化监测机制,以便更好地研究气候变化下,陆地生态系统对全球变化的响应与反馈。     

HPLC法测定烟草不同部位、不同提取方法茄尼醇的含量

为了建立烟草不同部位、不同烟草原料中茄尼醇的含量测定方法,本文取烟草不同部位经甲醇超声提取及烟草不同提取方法的提取物,分别用高效液相色谱法测定茄尼醇的含量。结果显示,烟草茎及叶柄中茄尼醇含量极低,烤烟中的茄尼醇的含量：中部烟〉上部烟〉下部烟,烟叶档次越高茄尼醇含量越高。提取溶媒为石油醚〉丙酮〉乙醇。     

二氧化碳浓度增高对稻、麦品质影响研究进展

作物品质的形成是品种遗传特性和环境条件综合作用的结果.一般认为大气中CO₂浓度增高将对作物品质产生重要影响.本文分别从蛋白质与氮含量、微量元素以及其他品质性状等3个方面综述了国内外关于CO₂浓度增高对水稻、小麦品质影响的研究进展,强调了该领域研究的必要性和紧迫性,并提出了研究的重点内容及主要方向.主要包括：大气中CO₂浓度增高对水稻、小麦品质的直接影响及品种间的差异;大气中CO₂浓度增高及其与其它气候因子协同作用对水稻、小麦品质的综合影响及其指标量化;大气中CO₂浓度增高及气候变化对水稻、小麦品质形成过程的影响机理;适应CO₂浓度增高的水稻、小麦品质改良育种的方向与策略;适应CO₂浓度增高的水稻、小麦品质改良的综合生产技术体系和分子标记及转基因技术在水稻、小麦品质改良育种方面的应用.     

Complete Genomic Sequence Analysis of a New SV40 Isolate

The genome of a new SV40 strain (SV-IMB) isolated from a rhesus monkey was completely sequenced and compared with other isolates. The results showed that the whole genome contains 5246bp, and the average identity of SV-IMB was 98.1% as compared to other SV40 isolates. Its regulatory region is composed of a complete enhancer and a defective enhancer. Amino acid changes occurred to some extent in both the large T antigen (T-Ag) and VP1 region. The findings demonstrate that the SV-IMB is a new SV40 isolate.