基于PCR DGGE的小鼠肠道菌群基因组提取方法的建立

通过比较4种小鼠粪便细菌总DNA提取方法对基于PCR-DGGE检测的肠道菌群多样性分析的影响,旨在建立适于PCR—DGGE的小鼠肠道微生物宏基因组提取的稳定、经济、快捷的方法。采用SDS裂解法、某国产市售粪便DNA提取试剂盒、改进的化学裂解法、改进的溶菌酶法4种方法提取小鼠粪便细菌总DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、细菌16S rRNAV3区PCR扩增结合DGGE对提取结果进行比较分析。SDS裂解法和国产市售试剂盒2种方法提取粪便细菌总DNA均未得到理想结果,另2种方法均能够检测到粪便中20种左右的细菌。改进的化学裂解法和改进的溶菌酶提取法的建立为基于PCR—DGGE进行肠道菌群结构的定量及定性分析提供了可靠的前提基础和实验保障。     

水稻谷胱甘肽过氧化物酶基因OsGPX3 和OsGPX4的分子特性研究

植物谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)是清除体内活性氧的一种关键酶,在植物抗逆反应中发挥重要作用.本研究从水稻中克隆到2个GPX基因,分别为OsGPX3和OsGPX4.OsGPX3和OsGPX4分别编码238和234个氨基酸组成的蛋白质,预测分子量分别是25.84 kD和25.07 kD.两个基因都包含5个内含子,但是两个基因所对应的内含子长度具有较大变异.组织表达谱分析发现这2个基因在根、茎、叶和叶鞘中均表达,是组成型表达基因.在大肠杆菌中表达并纯化了这2个基因的重组蛋白,酶活性分析显示OsGPX3和OsGPX4蛋白对底物H₂O₂、tBOOH和COOH具有较高活性,但是OsGPX3对3种底物的活性均高于OsGPX4,蛋白质酶活性的差异预示着这2个基因可能存在功能上的分化.     

小切口微创手术治疗新鲜跟腱断裂的临床价值

目的：探讨小切口微创手术治疗新鲜跟腱断裂的一晦床价值。方法：选取我院新鲜闭合性跟腱断裂患者50例,随机分为实验组和对照组各25例。实验组行小切口手术,对照组行常规切口手术。术后对患者进行随访,采用美国足踝协会（AOFAS）推荐的评分标准对患者术后功能恢复情况进行评价,观察并记录完全恢复患者例数、完全恢复时间、小腿最大周长差和术后并发症发生情况。结果：实验组AOFAS评分为（98．6±9．7）分,痊愈率96．00％,痊愈时间（20．2±3．2）周,两侧小腿最大周长差为（0．79＋0．68）cm,共有1例患者出现并发症,并发症发生率8％;而对照组的AOFAS评分为（91．4±11．5）分,痊愈率92．00％,痊愈时间（22．4±3．8）周,两侧小腿最大周长差为（0．91~0．76）cm;共有6例患者出现并发症,并发症的发生率为24％。两组患者的痊愈率、两侧小腿最大周长差比较差异无统计学意义（痊愈率：x2=-0．355,P=0．552;侧小腿最大周长差：t=O．588,P=0．559）;而与对照组比较,实验组AOFAS评分明显升高,完全恢复时间明显缩短,术后并发症的发生率显著降低,差异均有统计学意义（AOFAS评：t=2．393,P=0．021;恢复时间：t=2．150,P=0．037;并发症发生率：xⅫ．153,P=0．042）。结论：小切口手术与常规切口手术治疗新鲜跟腱断裂的疗效相当,但小切口手术术后恢童时间曼短．并发症更少．临床价值相对更高．     

参松养心胶囊对缺血性心力衰竭患者心率变异性的影响

目的：评价参松养心胶囊对缺血性心力衰竭患者心率变异性的影响。方法：选择缺血性心肌病心衰患者40例,在常规抗心衰治疗（利尿剂、血管紧张素转换酶抑制剂／血管紧张素受体抑制剂、B受体组滞剂、醛固酮拮抗剂及洋地黄制剂）基础上加服参松养心胶囊1．2g,每日3次,连用8周。以超声心动图和24小时动态心电图分别观察治疗前、治疗后8周患者的心脏功能和心率变异性的变化情况。结果：参松养心胶囊治疗8周后,患者左室射血分数较治疗前显著增加（33．5±5．2％vs42．6±5．7％,P〈0．001）,正常R-R间期标准差（SDNN）和连续5分钟正常R-R间期均值的标准差（SDANN）均显著增加（P〈0．05）,分别为（97．4±40．6vs110．6±29-3msecs）和（80．5±29．4vs98．4±30．6msecs）。结论：常规抗心衰治疗基础上给予参松养心胶囊治疗能够有效改善缺血性心肌病心衰患者心率变异性和心脏功能。     

磁共振体素内不相干运动扩散加权成像在肺癌所致肺不张影像诊断中的初步应用

目的:探讨磁共振体素内不相干运动扩散加权成像(intravoxel incoherent motion diffusion weighted MR Imaging,IVIM-DWI)在肺癌所致肺不张的影像诊断中的初步应用。方法:选取独立肺段肺不张病变患者43例,其中肺癌致肺不张31例(肺癌组),局部炎症致肺不张12例(炎症组)。所有患者在药物治疗或手术前均行3.0T磁共振IVIM-DWI检查,b值取0、50、100、200、400、600、800、1000 s/mm~2,分别测量灌注分数(perfusion fraction,f)、真实扩散系数(diffusion coefficient,D)以及关注相关扩散系数(diffusion coefficient from the perfused compartment,D*),对上述参数值进行相关统计学分析,并依据受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic,ROC)对各参数的评价效能进行分析。结果:肺癌组的D值、D*值以及f值分别为(0.64±0.16)×10~(-3)mm~2/s、(19.77±6.16)×10~(-3)mm~2/s以及(29.62±9.74)%,而炎症组的D值、D*值以及f值分别为(0.67±0.14)×10~(-3) mm~2/s、(21.14±8.32)×10~(-3)mm~2/s以及(47.62±11.46)%;经比较,肺癌组D值、D*值与炎症组无统计学差异(P0.05),而二者f值差异显著,有统计学意义(P0.01)。f值最佳阈值为38.42%,此时曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为0.94,诊断肺癌的特异度为0.89,敏感度为0.93,阳性预测值为0.92,阴性预测值为0.89。结论:磁共振IVIM-DWI技术在肺癌所致肺不张的影像诊断中具有一定的应用价值。     

Conservation genetics of rare trees restricted to subtropical montane cloud forests in southern China: a case study from <Emphasis Type="Italic">Quercus arbutifolia</Emphasis> (Fagaceae)

Montane cloud forests (MCFs), with their isolated nature, offer excellent opportunities to study the long-term effects of habitat fragmentation and the impacts of climate change. Quercus arbutifolia is a rare oak in MCFs of southern China and Vietnam. Its isolated populations, small population size and unique ecological niche make this species vulnerable to climate change and habitat loss. In this study, we used chloroplast (cpDNA) and nuclear (ITS) DNA sequences to investigate genetic divergence patterns and demographic history of five of the six known populations of Q. arbutifolia. Considering its small population size and fragmentation, Q. arbutifolia has unexpectedly high genetic diversity. The time since the most recent common ancestor of all cpDNA haplotypes was c. 10.25 Ma, and the rapid diversification of haplotypes occurred during the Quaternary. The maximum clade credibility chronogram of cpDNA haplotypes suggests that the DM population (Daming Mountain, Guangxi province) diverged early and rapidly became isolated from other populations. The Pearl River drainage system may have been the main geographic barrier between DM and other populations since the late Miocene. ITS data suggests that population expansion occurred during the last interglacial of the Quaternary. The combined effects of pre-Quaternary and Quaternary climatic and geological changes were the main drivers to the current genetic diversity and distribution pattern of Q. arbutifolia. Because of the high between-population genetic differentiation and high within-population genetic diversity of Q. arbutifolia, conservation efforts should be implemented for all populations, but if conservation resources are limited, populations DM, YZ (Mang Mountain, Hunan province) and ZZ (Daqin Mountain, Fujian province) should have priority.     

贵州省首次发现合江棘蛙

2010年7和8月,采用样带法于贵州省习水国家级自然保护区进行两栖动物资源调查,在三叉河片区(28°30′43.67″N,106°25′03.72″E,海拔1 087 m)采集到25只形态相似的两栖动物标本,经过鉴定,该标本为无尾目(Anura)叉舌蛙科(Dicroglossidae)棘胸蛙属(Quasipaa)的合江棘蛙(Q.robertingeri),系贵州省两栖动物新纪录。标本现保存于贵阳学院生态研究中心标本室。     

“食品微生物学”微课的开发设计与制作

微课作为一种以学习者为中心设计的可视化学习资源,因其短小精悍的特点已逐渐受到移动学习者的欢迎。本文介绍"食品微生物学"微课设计开发与制作方面的心得与体会。首先应有独具匠心的教学设计,在此基础上再采用有效的微课制作方式。教学设计时应精心选题,力求快速有效切题,线索清晰,亮点突出,收尾干净利落,还应树立危机意识。微课制作时要根据主题选择合适的微课表现形式,制作有视觉美感的PPT,录制清晰稳定的图像,最后剪辑、美化、合成得到微课视频。     

家蝇溶菌酶MDLZM2基因的克隆、序列分析及原核表达

对家蝇溶菌酶(Musca domestica lysozyme,MDLZM2)基因进行克隆、序列分析,构建原核表达载体并在大肠杆菌中表达。从Gen Bank家蝇基因组中筛选获得MDLZM2基因。以该基因的序列设计引物,进行PCR扩增,测序分析获得该基因完整编码序列。运用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、二级结构、三级结构和保守结构域等方面进行预测和分析。构建p EASY-E1-MDLZM2重组质粒,转化到大肠杆菌BL21(DE3)p Lys S Chemically Competent Cell中进行诱导表达及纯化。结果表明MDLZM2基因ORF全长552 bp,编码183个氨基酸,理论分子量21.2 k Da;等电点为6.13,具有Lysozyme家族的蛋白保守结构域。成功构建重组原核表达p EASY-E1-MDLZM2并诱导表达、纯化重组蛋白,为进一步研究该蛋白的生物学及免疫学活性奠定了基础。     

生境异质性对鼎湖山常绿阔叶林群落功能多样性的影响

物种共存机制一直以来是群落生态学的研究热点。为了探讨异质生境条件下鼎湖山常绿阔叶林群落功能多样性变化,找到其变化的主要环境驱动因子,该研究利用位于鼎湖山20 hm~2监测样地第2次群落调查数据并选择代表不同生境(海拔和地形)的27个样方(20 m×20 m),于2013年夏季在样地内所选样方中测定所有胸径≥1 cm树种的叶片功能性状。所测性状包括形态学性状(比叶面积、叶片干物质含量、叶面积以及叶片长宽比)和化学计量学性状(叶片碳、氮、磷的含量),结合地形和土壤数据并通过分析功能多样性随环境梯度的变化,探讨了环境过滤和竞争在鼎湖山群落物种共存中的相对重要性。结果表明:功能分歧度和群落权重平均值与环境因素关系密切,尤其是海拔、凹凸度和土壤养分。环境条件较好区域(微尺度高海拔、高凹凸度和土壤养分含量)的植物采取统一的养分有效保存(低SLA,高LDMC)的适应策略(功能分歧度低),环境过滤所起作用更强;植物在相反的环境条件下,采取快速生长策略(高SLA,低LDMC),能够更好地适应环境的变化,且性状变化是多样的(功能分歧度高),在该条件下竞争作用更为显著。叶面积和叶片氮含量的分歧度在环境条件较好的区域增大,这与其他功能性状不一致,说明不同生态位轴(环境因素)影响不同性状的分歧度变化,并且在局域尺度上植物为了更好地适应环境变化采取了多样的适应策略。