PCR-SSCP分析方法的优化

目的：优化PCR-SSCP分析方法。方法：选择野生型Kir2．3质粒和突变型Kir2．3（2123L）质粒为样本,其PCR结果的鉴定采用2％的琼脂糖凝胶EB显色,SSCP分析采用12％的非变性聚丙烯酰胺凝胶DNA银染显色。PCR产物变性比较了三种方法：即碱变性、SDS变性、直接变性。聚丙烯酰胺凝胶根据丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺及甘油的比例设计了六个实验组,每组采用两种条件电泳,即：30mA恒流快速电泳和100V恒流过夜电泳。结果：选择直接变性的PCR产物作为变性上样液,并确定了三种凝胶配及该条件下适用的电泳条件。即：丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺的比例为49比1,凝胶中含1％甘油,4℃,500V高压电泳3min接着30mA恒流快速电泳3h;丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺的比例为49比1,凝胶中含5％甘油,4℃,500V高压电泳3min接着30mA恒流快速电泳3h;丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺的比例为29比1,凝胶中不合甘油,4℃,500V高压电泳3min接着100V恒流过夜电泳12h。结论：条件优化的PCR-SSCP是一种筛查基因突变简便、有效的实验方法。     

p53和VEGF蛋白表达与子宫内膜癌的关系

目的：检测子宫内膜癌组织中血管内皮生长因子与突变型抑癌基因p53的表达情况,以探讨其在子宫内膜癌发生转移中的作用。方法：应用免疫组化S．P法检测45例子宫内膜癌及10例正常子宫内膜组织中VEGF和突变型p53的表达及其相关性,分析其与各临床病理参数之间的关系。结果：子宫内膜癌组织中VEGF及突变型p53蛋白表达阳性率均高于正常子宫内膜,两者呈显著正相关（P〈0．01）。两者阳性表达率均与临床分期、组织分化程度、淋巴结转移（P〈0．05）有关,VEGF阳性表达率与肌层浸润深度无明显相关性（P〉0．05）,而突变型p53表达则与肌层浸润深度有关（P〈0.05）。结论：VEGF和突变型p53与子宫内膜癌的发生、侵袭、转移和预后相关。     

异源蛋白质相互作用数据整合算法的进展

蛋白质相互作用在生物学过程和细胞功能行使中起核心作用。高通量技术的应用结合计算机预测方法的发展,使得直接和间接来源的蛋白质相互作用数据得到了大规模的增加。如何系统地整合这些数据并从中提取有用的信息是一项挑战,这也促使了许多整合算法应运而生。本文综述了八种整合蛋白质相互作用数据源的方法：投票、支持向量机、朴素贝叶斯、逻辑斯蒂回归、决策树、随机森林、基于随机森林的k-近邻法以及混合属性分类等方法。