利用序列保守模体和局部构象信息预测转录因子结合位点

转录因子结合位点的计算预测是研究基因转录调控的重要环节,但常用的位置特异得分矩阵方法预测特异性偏低.通过深入分析结合位点的生物特征,提出了一种综合利用序列保守模体和局部构象信息的结合位点预测方法,以极大相关得分矩阵作为保守模体的描述模型,并根据二苷参数模型计算位点序列的局部构象,将两类信息得分组合为多维特征向量,在二次判别分析的框架下进行训练和滑动预测.预测过程中还引入了位置信息量以优化似然得分和过滤备选结果.针对大肠杆菌CRP和Fis结合位点数据的留一法测试结果表明,描述模型的改进和多种信息的融合能有效地改善预测方法的性能,大幅度提高特异性.     

The Influence of Arginine-specific Reagents on Nitrate Uptake by Corn Seedlings

The effects of three arginine-specific reagents on uptake were studied using corn seedlings (Zea mays L., GoldenCross Bantam). In the presence of borate, 0.25 mM 2, 3-butanedione(BD) and 1.0 mM 1, 2-cyclohexanedione (CHD) inhibited uptake by 76% and 68%, respectively, compared tothe controls. However, in the absence of borate, only 18% and38% inhibition was observed for 0.25 mM BD and 1.0 mM CHD, respectively.Similarly, 0.5 mM phenylglyoxal (PGO) resulted in 75% inhibition.The degree of inhibition of nitrate uptake exhibited a concentration-dependencewith respect to the reagents. Corn seedlings are 2- or 3-foldmore sensitive to BD than to PGO and CHD, respectively, presumablydue to the unfavourable steric effects of the benzal ring. Uptakeof was partially restored after removal of BD, CHD, and PGO from the uptake medium. No significant differenceswere observed for the ATPase and plasma membrane-associatedvanadate-sensitive H⁺-ATPase or K⁺-stimulated ATPase activityin homogenates and microsomal fractions prepared from corn seedlingswhich had been incubated for 2 h in the presence or absenceof 0.5 mM BD or 1.0 mM PGO. This suggests that inhibition ofnitrate uptake by the arginine-specific reagents was not causedby the indirect effect of their binding and inhibiting H⁺-ATPase.The fact that the arginine-specific reagents strongly inhibit uptake indicates that the transport system has arginine residues at or near the activesite. Key words: Arginine-specific reagents, borate effect, nitrate uptake, reversibility     

江豚的小肾结构指数和尿浓缩能力

对江豚的六项小肾结构指数的测定发现,黄海沿岸江豚的小肾结构指数明显高于长江江豚的。提示前者具有较高的尿浓缩能力。对尿的分析所获结论相同,反映出二者对所栖水域的不同渗透浓度的适应。     

花生幼苗下胚轴质膜氧化还原系统

花生幼苗下胚轴细胞膜制剂具有氧化NAD(P)H,还原Fe(CN)_6~(3-)与EDTA-Fe~(3 )的能力,当Fe(CN)_6~(3-)浓度为1mmol/L时,膜制剂氧化NADH和NAD(P)H的K_m分别为100和110μmol/L;V_(max)为1400和710nmol mg~(-1) proteinmin~(-1),最适pH为8.0。NADH 0.25 mmol/L浓度下,膜制剂还原Fe(CN)_6~(3-)的K_m为40,V_(max)为1300;还原EDTA-Fe~(3 )的K_m为125,V_(max)为180,最适pH分别为8.0与7.0。氧为该系统天然受体,鱼藤酮、抗霉素A与CN~-对其活性无影响,10μmol/L的DCCD抑制其活性约20％,10μmol/L的SHAM抑制近50％活性。     

家兔油酸型呼吸窘迫综合征呼吸运动变化的机制

本文介绍家兔实验性呼吸窘迫综合征时呼吸功能的变化。静脉注射油酸后呼吸频率迅速增加,肺通气量则经历三个时相的变化,依次为最初通气增大期、延迟通气增大期和通气不足期。胸廓呼吸运动的幅度随着时间的延长逐渐加大而潮气量则逐渐减少。O_2吸收率及 CO_2排出率在通气不足期显著减少。血气分析提示,在通气增大期有呼吸性碱中毒,至通气不足期出现酸中毒。动脉血 PO_2在注射油酸后20min 时尚能维持在80mmHg 左右,以后则明显下降。切断双侧迷走神经后再注射油酸,呼吸不再增快,最初通气增大期显著减弱,而延迟通气增大期和通气不足期照常发生。切断双侧窦神经后再注射油酸,仍见呼吸加快和最初通气增大期,但延迟通气增大期消失。上述结果表明:动物注射油酸后,呼吸加快和最初通气增大期是通过迷走神经实现的,而延迟通气增大期则是由于缺 O_2,刺激外周化学感受器所致。     

重庆大巴山国家级自然保护区森林植物多样性垂直格局

以重庆大巴山国家级自然保护区西南方向沿海拔梯度选择的20个样地为研究对象,通过等级聚类分析,结合物种重要值、物种丰富度、区系分化强度和α、β多样性指数等方面的分析,以揭示其森林植物多样性沿海拔梯度的分布特征。结果表明:(1)在20个样方中,共记录到维管植物97科226属335种;随着海拔上升,各样地植物科、属、种总数大体上呈先增加后降低的趋势。(2)植物群落在垂直梯度上差异显著;综合群落生长型和等级聚类分析结果,将群落沿海拔梯度划分为4个类型:海拔1 000m以下为常绿阔叶林和偏暖性针阔混交林,1 000~1 600m为常绿落叶阔叶混交林,1 600~2 100m为偏暖湿性针阔混交林,海拔2 100m以上为暗针叶林。(3)α多样性指数具有垂直变化规律;Simpson优势度和Pielou均匀度随海拔变化较小,乔木层Shannon-Wiener指数随海拔升高有明显降低的趋势,混交林类型的物种多样性和区系分化强度较高。(4)β多样性指数在低海拔区段起伏较大;随着海拔升高,乔木层Cody指数的变化格局总体上呈逐渐降低的趋势,相邻群落间物种异质性逐渐减小,物种的替代速率下降,最终达到相对稳定的状态。     

栓皮栎叶片δ13C和δ15N的纬向趋势及其影响因子

以东亚广布种栓皮栎为例,通过对南北样带(26°-40° N)上7个群体的调查取样,并结合2个生活史阶段,探讨栓皮栎碳氮同位素比值随纬度环境的变异规律.结果表明: 在纬向梯度上,栓皮栎叶片δ¹³C和δ¹⁵N随纬度的增加分别呈现非线性的增加和下降趋势,且成年树叶片δ¹³C和δ¹⁵N均显著高于幼树;同时,树龄和纬度对叶片δ¹⁵N和δ¹³C均无显著交互作用,表明栓皮栎幼树和成年树纬向环境变化的响应较为一致.随机森林模型结果显示,栓皮栎叶片δ¹⁵N主要受土壤养分,如土壤有机质、磷和氮含量的影响,而叶片δ¹³C主要受水分因子,如空气相对湿度、降水量等的影响.     

枯草芽胞杆菌降解毒死蜱特性研究

研究生物量、pH、毒死蜱浓度和温度对枯草芽胞杆菌3374菌株(编号为GU086422)在水溶液中降解毒死蜱特性,考察该菌株对白菜上毒死蜱残留的降解特性。结果表明,在毒死蜱质量浓度为240 mg/L、pH7.0、温度30℃的适宜条件下,枯草芽胞杆菌3374菌株对毒死蜱的降解率达到92.48%。该菌株能够有效提高白菜叶面上毒死蜱残留的降解速度,表明其在白菜上具有有效降解毒死蜱的能力,在无公害农产品生产中具有广阔的应用潜力。     

Human chromosome pellicle antibody recognizing centromere protein-C (CENP-C), the main component of the kinetochore

INTRODUCTIONDuringnormalcelldivision,thechromosomesplitsevenly,givingthesamegeneticmaterialtoeachdaughtercell.Theaccuracyofsuchcelldivisiondependsontheinteractionbetweenthespindleapparatusandtheets--actingregionofeachchromosomeknownasthecentromere.Manyessentialmitoticfunctionsoccuratorarecontrolledbythecentromere.Capturingspindlemicrotubules,thegrowthanddisassemblyofmicrotubules,theliningupofchromosomesonthemetaphaseplate,andthesplittingoffofthesisterchromatidsduringmitosisareallsomehowre…     

麝腓腺生长发育与化学通讯机能的探讨

本文对麝的腓腺进行了生长发育与组织化学观察。腓腺由丰富的顶泌汗腺组成,分泌混合性粘多糖成分的信息素。出生８０日龄幼麝的腓腺开始有分泌功能,成体时其分泌功能旺盛。麝以直接和间接方式释放信息素。