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活细胞依赖其众多的转录调控模块来实现复杂的生物功能,识别转录调控模块对深入理解细胞的功能及其转录机制有着重要的意义。本文结合酵母基因表达数据和ChIP-chip数据,提出了一种转录调控模块识别算法。该算法通过采用不同的P值阈值分别得到了核心集和粗糙集,然后对核心集和粗糙集进行判别,最后对基因进行扩展之后得到基因转录调控模块。将该算法运用到两个酵母基因表达数据中,得到了一些具有显著生物学意义的基因转录调控模块。与其它算法相比,该算法不仅可以识别含有较多基因的转录调控模块,而且可以识别一些其它算法不能识别的基因转录调控模块。识别得到的基因转录调控模块有着不同的生物学功能,并且有助于进一步理解酵母的转录调控机制。 相似文献
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心型脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid binding protein, H-FABP)的水平与影响肉质性状的肌内脂肪含量有关,鱼类H-FABP的表达水平对其肌内脂肪含量是否相关仍未见报道.本研究获得齐口裂腹鱼和鲤鱼心脏型脂肪酸结合蛋白基因序列,利用半定量RT-PCR分析其表达特性并测定肌内脂肪含量,比较H-FABP基因在不同生活环境的2种鲤科鱼肌内脂肪沉积中的作用.结果显示,齐口裂腹鱼和鲤鱼H-FABP基因的ORF为402 bp,编码133个氨基酸,它们的氨基酸序列相同,与人、猪、小鼠、斑马鱼、大西洋鲑、虹鳟等的同源性为71.3%~ 90%;H-FABP基因在2种鲤科鱼的心、肌肉、脂肪、肝、脑、脾、肾和鳃等组织中均有表达,肝中的表达量显著高于其它组织(P<0.05),H-FABP基因的肌肉表达谱在齐口裂腹鱼和鲤鱼中存在明显差异:齐口裂腹鱼中的表达随生长发育呈上升趋势,在大体重鱼(500 g)中的表达显著高于小体重鱼(P<0.05),其表达与肌内脂肪含量呈显著正相关(R=0.370,P<0.05);H-FABP基因在鲤鱼生长发育中呈下降趋势,而小体重鱼(50~60 g)中的表达显著高于其它大体重鱼(P<0.05),其表达与肌内脂肪含量呈显著负相关(R=-7.083,P<0.01).据此推测,齐口裂腹鱼和鲤鱼肌肉组织H-FABP基因表达与肌内脂肪关联性的差异可能与2种鱼的生活环境不同有关. 相似文献
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人工方法合成基因可通过DNA化学合成,这也是基因获取的手段之一,是密码子优化、蛋白质工程、代谢工程及基因组工程等方面不可缺少的技术。本文从寡核苷酸的合成开始,对短片段DNA的合成、基因长度的DNA合成、基因组长度的DNA合成、长片段及基因组水平的DNA组装、基因组DNA的移植等方面的技术和问题进行了阐述。 相似文献
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过氧化物酶体增殖活化受体γ辅助活化因子1α(α subunit of peroxisome proliferators activated receptor γ coactivator 1,PGC-1α)是过氧化物酶体增殖活化受体γ辅助活化因子1 (PGC 1)的成员之一. PGC-1α是与能量代谢 关系密切的1个转录辅助活化因子,在线粒体合成、调节适应性产热、骨骼肌纤维类型转换等过程中发挥重要作用.同时,还 参与到糖代谢、脂代谢中,已成为治疗糖尿病、肥胖等代谢疾病的新靶点.近年来还发现, PGC-1α对治疗癌症发生及神经 变性疾病有一定作用.本文主要从PGC-1α调节适应性产热、促进线粒体合成、在骨骼肌中调节纤维类型转换及葡萄糖代谢 等方面对其生理功能进行阐述,并对 PGC-1α与相关代谢疾病的关系进行了总结. 相似文献
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淮南地区新元古代九里桥组叠层石成礁过程及其影响因素 总被引:1,自引:0,他引:1
淮南地区新元古代九里桥组中段灰岩中发育有形态多变的叠层石礁体,具有与显生宙生物礁相似的相分异特征,基底、礁核、盖层、礁前、礁后、礁翼等不同微相可以明确区分,定殖期、拓殖期、泛殖期和衰亡期等不同造礁阶段的叠层石柱体变化特征明显。该组叠层石礁体自下而上分别为分散分布的小型丘状礁体、连绵分布的大型丘状礁体和分散分布的小型丘状礁体或透镜状礁体,该变化趋势指示了九里桥组沉积时期海平面先升高后降低的变化趋势,结合该组沉积期沉积环境变化特征可将该组叠层石礁体划分为风暴环境型礁体、海进环境型礁体和海退环境型礁体三种类型。对九里桥组沉积学、古生物学等研究表明,该组沉积时期造叠层石生物与其它生物之间存在较强的生存竞争关系,但更能适应风暴沉积环境,叠层石在该组沉积晚期的消失很可能与以海平面变化为特征的沉积构造环境变化有关。 相似文献
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庙台槭(Acer miaotaienseTsoong)属槭树科槭属,是我国植物学家钟补求先生1954年发现并命名的,模式产地在陕西省留坝县庙台子,故命名为庙台槭.该种为落叶乔木,高10~20(25)m;树皮深灰色,纵裂或片状剥落;幼枝红褐色或紫褐色,老枝灰色,深纵裂.叶对生,纸质,常3~5裂;轮廓近阔卵形或卵状三角形,长(4~)7~9cm,宽6~8cm;上面深绿色,无毛;下面淡绿色,被褐色短柔毛,沿脉较密;叶柄长6~7cm.圆锥状聚伞花序长4~5cm,生于枝顶,由1顶花及6~9枚侧花枝和14~25朵花组成;含两性花、雄花和中性花,同株.花黄绿色,直径约1cm;萼片5枚,长4.5~6.5cm,矩圆形或倒卵状长圆形,上、下表面均被短纤毛,下面较多;花瓣5枚,长3.5~4.5mm,倒披针形,较萼片窄短,上、下表面均有短纤毛,下面稍多;雄蕊8枚,花药黄色,近球形,花丝着生在花盘上;花盘近圆形,边缘波状5浅裂;雌蕊2心皮,扁平,柱头2裂,向外反卷.小坚果扁平,近圆形,直径约8毫米,密被淡褐色或黄色绒毛;翅长圆形,宽0.8~0.9cm,连同小坚果长约2~2.5(3)cm,两翅水平开展,呈180°平角,或有的大于180°.... 相似文献
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Jianrao HU Mingfu CAO Jiong CHEN .Hangzhou Key Laboratory for Animal Science Technology College of Life Environmental Sciences Hangzhou Normal University Hangzhou China.Faculty of Life Science Biotechnology Ningbo University Ningbo Zhejiang China 《动物学报》2009,55(5)
Bactericidal/permeability-increasing protein(BPI)and LPS-binding protein(LBP)play an important role in host defence.Current evidence shows that BPI/LBP may be widely existed in different cells and tissue types of animals.A full-length cDNA clone encoding a BPI/LBP homologue(dBPI),1757 bp in size,was characterized in venom gland of the hundred-pace snake Deinagkistrodon acutus.Its deduced amino acid sequence of 417 residues had 13.8%-21.5% identity to BPI like 1(BPIL1)and BPI like 3(BPIL3)of other animals.Co... 相似文献