Molecular detection of fungal communities in the Hawaiian marine sponges Suberites zeteki and Mycale armata

Symbiotic microbes play a variety of fundamental roles in the health and habitat ranges of their hosts. While prokaryotes in marine sponges have been broadly characterized, the diversity of sponge-inhabiting fungi has barely been explored using molecular approaches. Fungi are an important component of many marine and terrestrial ecosystems, and they may be an ecologically significant group in sponge-microbe interactions. This study tested the feasibility of using existing fungal primers for molecular analysis of sponge-associated fungal communities. None of the eight selected primer pairs yielded satisfactory results in fungal rRNA gene or internal transcribed spacer (ITS) clone library constructions. However, 3 of 10 denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) primer sets, which were designed to preferentially amplify fungal rRNA gene or ITS regions from terrestrial environmental samples, were successfully amplified from fungal targets in marine sponges. DGGE analysis indicated that fungal communities differ among different sponge species (Suberites zeteki and Mycale armata) and also vary between sponges and seawater. Sequence analysis of DGGE bands identified 23 and 21 fungal species from each of the two sponge species S. zeteki and M. armata, respectively. These species were representatives of 11 taxonomic orders and belonged to the phyla of Ascomycota (seven orders) and Basidiomycota (four orders). Five of these taxonomic orders (Malasseziales, Corticiales, Polyporales, Agaricales, and Dothideomycetes et Chaetothyriomcetes incertae sedis) have now been identified for the first time in marine sponges. Seven and six fungal species from S. zeteki and M. armata, respectively, are potentially new species because of their low sequence identity (< or =98%) with their references in GenBank. Phylogenetic analysis indicated sponge-derived sequences were clustered into "marine fungus clades" with those from other marine habitats. This is the first report of molecular analysis of fungal communities in marine sponges, adding depth and dimension to our understanding of sponge-associated microbial communities.     

核基质蛋白Ciz1与肿瘤

核基质蛋白Ciz1（Cdkn1A-interacting zinc finger protein 1）是在酵母双杂交系统中寻找能与p21 ^Cip1/Waf1结合并调节其细胞核定位时发现的锌指蛋白。当分别过表达Ciz1和p21 ^Cip1/Waf1时,它们均主要定位于细胞核,而当共转染时,则均从细胞核转位到细胞质。在小鼠3T3 细胞中,Ciz1可以协同CDK2、细胞周期蛋白E和细胞周期蛋白 A启动DNA的复制,并促进细胞由G1期进入S期。此外,Ciz1还具有结合DNA的能力并参与对转录因子的活性调控,同时,Ciz1还可能作为蛋白激酶ATM的底物参与DNA的损伤修复。近年来研究发现,Ciz1除与阿尔茨海默病和肌张力失常等疾病相关以外,还在肺癌、结肠癌和乳腺癌等多种肿瘤组织中呈现高表达,参与肿瘤的发生和发展过程。本文主要就Ciz1的结构功能及与肿瘤的关系作一综述。     

单增李斯特菌prsA1基因的截短表达、纯化及多克隆抗体的制备

单增李斯特菌（Listeria monocytogenes）是一种常见的食源性致病菌,能够引发李斯特菌病,对食品安全构成巨大威胁。prsA1具有保守性和特异性,利用SignalP 4.1 Server程序、TMHMM Server V.2.0程序和SEPPA 2.0程序预测了PrsA1的信号肽段、跨膜区域及空间抗原表位,预测结果显示PrsA1的N端含有信号肽段及跨膜区且该蛋白具有良好抗原表位结构,因而可作为检测靶标。在此基础上,采用PCR法获得prsA1的非跨膜区序列即Δ84prsA1,构建重组质粒pET30a-Δ84prsA1并转入到大肠杆菌中诱导表达Δ28PrsA1,Ni-IDA柱亲和纯化重组蛋白Δ28PrsA1,以纯化的Δ28PrsA1为抗原制备多克隆抗体。间接ELISA检测多克隆抗体的效价,高达1∶128 000。Western blotting分析结果显示该多克隆抗体能够识别从单增李斯特菌中提取的PrsA1蛋白。利用生物信息学筛选检测靶标并分析抗原表位结构,最后成功制备了多克隆抗体,为单增李斯特菌检测靶标的筛选和免疫学检测提供了实践基础。     

类黄酮化合物在植物胁迫反应中作用的研究进展

植物胁迫发生时,一个明显的特征是在植物器官中积累红色与紫色类黄酮化合物。文章讨论了类黄酮化合物在植物胁迫保护中作用,如类黄酮化合物在抗植物UV—B辐射、抗病性以及铝毒害耐性等多方面的作用,也讨论了植物受胁迫时类黄酮积累的分子基础。     

国外生态旅游对当地社区生计的影响研究综述

生态旅游因具备实现生物多样性保护和减轻贫困双重目标的潜力,成为全球学术界关注的焦点。鉴于生态旅游在影响社区生计方面的研究争议,论文综览国外大量相关文献,在界定生态旅游内涵的基础上,从经济影响、社区参与、能力建设、社会文化和公共设施4个方面系统梳理国外生态旅游对目的地社区生计的影响。研究发现旅游发展对目的地生计的影响存在不确定性,社区资源控制权、旅游收益规模、地方介入旅游产业供应链能力、自身能力、旅游管理等因素对旅游扶贫效应起着关键性作用。最后,对当前研究展开评述并对未来研究提出三点展望,以期为中国未来生态旅游影响研究和生态旅游开发提供借鉴和指导。     

福州鼓山季风常绿阔叶林及其林缘几种植物叶热值和营养成分

研究了福州鼓山次生的南亚热带季风常绿阔叶要及其林缘不同层次１３种植物叶热值、灰分含是及营养成分。结果表明：群落的不同层次平均灰分含量从低到高依次是乔木层（６．８％）,草本层（８．５％）、灌木层（１０％）;平均含灰分热值（ＧＣＶ）从低到高低次是草本层（１６．８９ＫＪ／ｇ）、灌木层（１７．７５ＫＪ／ｇ）、乔木层（１９．７９ＫＪ／ｇ）;平均不含灰分热值（ＡＦＣＶ）从低到高依次是草本层（１８．５５ＫＪ／ｇ     

视皮层反馈对猫外膝体神经元方位调制特性的影响

以扫描正弦光栅作为刺激,用冰冻法毁损皮层17、18、19区和外侧上雪氏回(LS区)来阻断皮层对外膝体的反馈投射,记录并描绘了猫外膝体597个细胞的方位调制特性.去视皮层猫外膝体神经元的平均方位选择性强度(Bias)为0.154,与正常猫(0.155)几乎相同,其最优方位偏向于水平方位.与正常猫外膝体不同的是,去视皮层猫外膝体失去了最优方位的切向分布规律,用GABA或KCl压抑皮层活动得到了相近的实验结果.结果说明正常外膝体的最优方位切向分布规律来自皮层反馈投射.     

血管内皮细胞生长因子受体Flt-1结合小肽的融合表达及活性鉴定

血管内皮细胞生长因子 (VEGF)通过结合其酪氨酸激酶受体KDR、fms样酪氨酸激酶 1(Flt 1)调节新生血管形成 ;筛选能封闭VEGF结合Flt 1的小肽 ,可以通过阻断肿瘤血管形成 ,抑制实体瘤生长 .将从噬菌体 12肽库中筛选获得的 2个能与Flt 1结合的阳性噬菌体克隆 (F5 6和F90 )十二肽DNA(36bp)克隆到表达载体pQE4 2中 ,在大肠杆菌M15中稳定表达二氢叶酸还原酶融合蛋白(DHFR F5 6 F90 ) ,经变性、复性后得到纯度达 90 %的可溶性蛋白 .ELISA检测表明 ,DHFR F5 6 F90能结合可溶性受体sFlt 1和血管内皮细胞 ;12 5I VEGF竞争抑制实验显示 ,DHFR F5 6能竞争抑制VEGF同可溶性受体sFlt 1结合 .结果提示 ,F5 6可能是VEGF受体Flt 1的有效拮抗剂 ,具有抗肿瘤新生血管形成的潜在应用前景     

三亚岩相潮间带底栖海藻群落结构及其季节变化

为了解三亚潮间带大型海藻生态现状,布设6条岩相断面,于2008年1—11月进行了四季野外的调查,并使用物种多样性指数与聚类分析研究了潮间带大型海藻四季的群落结构和多样性变化。调查共鉴定出大型底栖藻类130种,隶属于4门75属,其中红藻门41属67种、褐藻门16属31种、绿藻门15属29种、蓝藻门3属3种。潮间带海藻种类数季节变化不大,并呈低潮带>中潮带>高潮带的垂直分布特征,且中低潮带有共同分布种,夏季尤为普遍。潮间带海藻夏冬两季平均生物量高于春秋两季,但并无显著差异。优势种季节变化明显:春季有波利团扇藻Padina boryana、日本仙菜Ceramium japonicum、半叶马尾藻Sargassum hemiphyllum、海柏Polyopes polyideoides,夏季有波状软凹藻Chondrophycus undulates、冠叶马尾藻Sargassum cristaefolium、宽扁叉节藻Amphiroa dilatata、石花菜Gelidium amansii,秋季有冠叶马尾藻、波状软凹藻、叶状铁钉菜Ishige foliacea,冬季有瓦氏马尾藻Sargassum vachellianum、苔状鸭毛藻Symphyocladia marchantioides、珊瑚藻Corallina officinalis、波利团扇藻、日本仙菜。群落多样性冬高夏低:Shannon多样性和Margalef丰富度指数最大值出现在冬季,Shannon多样性和Pielou均匀度指数最低值出现在夏季。区域底栖藻类以暖水性热带-亚热带种为主,其次为温水性的暖温带种类,基本符合南海南区暖水区系特点。研究表明,尽管三亚潮间带底栖海藻种类数与生物量上并无显著的季节差异,但群落结构与多样性均显示出一定的季节变化。