GMP and AMP as methyl radical traps in the reaction with pentaamminemethylcobalt(III)

C8 methylation of the title purine nucleotides was achieved in near neutral aqueous solution by reaction with (13)C enriched [Co(NH(3))(5)(CH(3))](2+). This cation decomposes upon dissolution in water by release of a methyl radical. The latter was identified by electron spin resonance (ESR) spectroscopy as the PBN/(13)C(.-)H(3) adduct (PBN=phenyl-N-tert-butylnitrone). When the purine nucleotide was used in large excess, the efficiency of the trapping by the C8 atom was determined by integration of the (13)C NMR signals to be 20-25% for GMP and 15-20% for AMP, respectively, at 37 degrees C.     

Structure of the polyketide cyclase SnoaL reveals a novel mechanism for enzymatic aldol condensation

SnoaL belongs to a family of small polyketide cyclases, which catalyse ring closure steps in the biosynthesis of polyketide antibiotics produced in Streptomyces. Several of these antibiotics are among the most used anti-cancer drugs currently in use. The crystal structure of SnoaL, involved in nogalamycin biosynthesis, with a bound product, has been determined to 1.35 A resolution. The fold of the subunit can be described as a distorted alpha+beta barrel, and the ligand is bound in the hydrophobic interior of the barrel. The 3D structure and site-directed mutagenesis experiments reveal that the mechanism of the intramolecular aldol condensation catalysed by SnoaL is different from that of the classical aldolases, which employ covalent Schiff base formation or a metal ion cofactor. The invariant residue Asp121 acts as an acid/base catalyst during the reaction. Stabilisation of the enol(ate) intermediate is mainly achieved by the delocalisation of the electron pair over the extended pi system of the substrate. These polyketide cyclases thus form of family of enzymes with a unique catalytic strategy for aldol condensation.     

1株芘降解酵母菌HXY-5的筛选鉴定及对芘的降解研究

以长期被石油污染的沈抚污灌渠底泥为菌源,富集筛选出以芘为唯一碳源能够生长的菌株HXY-5,采用形态学和分子生物学鉴定相结合的方法进行菌株鉴定,运用光电比浊法测定其对芘的降解效果,通过单因素实验和正交实验确定其最佳发酵和培养条件。结果表明:HXY-5菌株为间型假丝酵母(Candida intermedia);其最适发酵和培养条件为蔗糖20 g,酵母浸粉2 g,MgSO_4·7H_2O 0.5 g,CaCl_2 0.01 g,KH_2PO_4 0.5 g,溶于1 000 mL蒸馏水中,初始pH 6.0,培养温度为25℃,175 r/min发酵24 h;在初始芘浓度为100 mg/L的液体无机盐培养基中,15 d时,HXY-5菌株对芘的降解率可达63%。结果表明,HXY-5菌株可以对芘环境污染进行修复。     

人LOXL2启动子的鉴定与初步分析

LOXL2（lysyl oxidase like 2）是赖氨酰氧化酶（LOX）家族的一个重要成员,不仅可促进细胞外基质中胶原蛋白和弹性蛋白的交联,而且在转录调控、细胞信号转导以及细胞粘附等生物学过程中也有重要作用。多篇研究表明,LOXL2在多种肿瘤中高表达,且与多种肿瘤细胞的增殖迁移等生物学行为密切相关。LOXL2的表达调控机制目前仍不清楚。为了进一步研究LOXL2的转录调控机制,本研究克隆鉴定了LOXL2的启动子。首先通过数据库对LOXL2基因结构及潜在启动子区域进行了分析,进而以人的基因组DNA为模板,通过PCR定向克隆策略,构建了5个长度不同并覆盖LOXL2基因转录起始位点附近约1.7 kb的LOXL2基因启动子荧光素酶报告基因重组体。启动子活性分析结果表明,与对照组相比,5个重组体均具有启动子活性(P<0.05),提示LOXL2基因核心启动子定位于转录起始位点附近约185 bp的区域内。转录因子结合位点分析结果表明,LOXL2基因启动子缺乏典型的TATA盒,但含有GC盒以及Sp1、NFkB等潜在的转录因子结合位点。外源转染Sp1表达质粒能显著增强LOXL2基因启动子的活性（P<0.05）,提示Sp1能直接激活LOXL2的转录。     

NaCl对轮枝链霉菌产谷氨酰胺转胺酶的促进作用研究

为了提高轮枝链霉菌发酵生产谷氨酰胺转胺酶的产量,研究了3种无机盐(NaCl、MgCl₂、KCl)对发酵产酶的影响。研究表明0.5%MgCl₂、0.5%NaCl均可促进菌体产酶,其中添加NaCl后谷氨酰胺转胺酶酶活提高最为显著。SDS-PAGE图谱分析显示,在各取样点实验组谷氨酰胺转胺酶酶原和成熟酶的总量高于对照,而且实验组成熟酶的增加也比对照快,从而显示NaCl是通过促进酶原的分泌和谷氨酰胺转胺酶的成熟,从而提高酶活、提早产酶。对NaCl的添加量进行优化,表明NaCl的最适添加量为0.5%,在此条件下,与对照相比,酶活水平提高了12%以上,发酵终点提前了约15h。     

大麦氮敏感基因型苗期对氮饥饿的生理响应

以大田试验获得的大麦氮敏感基因型BI-45为材料,利用溶液培养方法,测定了苗期株高、根长、叶绿素含量、含氮量、谷氨酰胺合成酶和硝酸还原酶活性,以及与氮代谢相关的基因（GSI-GSl-2、GSI-3、GS2、Narl、NRT2．J、NRT2-2、NRT2-3和NRT2-4）的表达。结果表明：相对于正常供氮,氮饥饿胁迫下,BI-45根和叶中的氮素利用率提高,含氮量降低,叶绿素含量减少,根冠比增加;叶片中的谷氨酰胺合成酶活性和硝酸还原酶的活性高于根,但是,与叶中的相比,根中的谷氨酰胺合成酶活性升高及硝酸还原酶活性降低的差异性更显著;与正常供氮相比,氮饥饿处理下,根中基因傩家族,基Narl和硝酸盐转运蛋白基因NRT2家族的相对表达量皆达到显著性差异,其中GSl-I、GSl-2和NRT2-2在苗期大麦氮饥饿处理下表现尤为突出,并且在6h都有上调表达。     

二维电泳和质谱技术鉴定肝癌血清差异表达的N-连接糖蛋白

缺乏有效的早期诊断方法是导致肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)预后极差的主要原因之一.蛋白质异常糖基化与恶性肿瘤细胞侵袭、转移等生物学过程关系密切,人体内至少有50%的蛋白质发生了糖基化修饰.本实验采用IgY12去除血清高丰度蛋白、多植物凝集素亲和层析技术分别从20例肝癌和年龄、性别匹配的20例非癌慢性肝病患者血清中纯化N 连接糖蛋白、二维电泳分析差异表达的蛋白质斑点,质谱检测、生物信息学等技术鉴定了18个差异表达的糖蛋白和/或其异质体（12种高表达和6种低表达）.ExPASy数据库比对结果表明,本实验鉴定的糖蛋白质分子含有至少1个已报道的N 糖基化位点.这些差异表达的糖蛋白属于急性期反应蛋白,分别具有蛋白酶抑制、生物转运、凝血和纤溶等功能,表明肝癌的发生发展过程中机体产生的急性期反应物可能是潜在的肝癌血清标志物.     

DDR2基因缺失小鼠的繁育及子代基因型的鉴定

目的：探讨盘状结构域受体2（DDR2）基因缺失小鼠的优化繁殖方法与子代小鼠DDR2基因型的鉴定方法,建立DDR2基因缺失小鼠模型,为进一步研究DDR2分子在肿瘤、肺纤维化、类风湿性关节炎等复杂疾病中的功能以及作用机制奠定基础。方法：将从美国JAX实验室引进的三对杂合子小鼠进行饲养并交配繁殖,繁殖成功后其子代中将会出现野生型、杂合子以及纯合子3种基因型。用基因组提取试剂盒试剂盒提取子鼠鼠尾的基因组DNA,经紫外分光光度计定量后,采用Taqman qPCR的方法准确鉴定出小鼠的基因型,同时观察子代小鼠各基因型的比例,并通过小鼠体态观察,进一步证实Taqman qPCR鉴定方法的可靠性。结果：DDR2基因杂合子小鼠互交繁殖可得到DDR2野生型小鼠、DDR2纯合子小鼠以及DDR2杂合子小鼠三种基因型小鼠,所得子代基本符合孟德尔遗传规律,且雌性和雄性DDR2纯合子小鼠体长均较DDR2野生型小鼠和DDR2杂合子小鼠小,鼻子也较其它基因型小鼠明显变短,无繁殖能力。依据Taqman qPCR的结果所得出的纯合子小鼠体貌特征与文献报道一致,证实了Taqman qPCR结果的可靠性。结论：雌、雄性DDR2杂合子小鼠交配可有效获得DDR2基因缺失小鼠;实验所用Taqman qPCR方法能够准确鉴定子代小鼠的基因型,DDR2纯合子小鼠的获得为后续实验的提供了较理想的动物模型。