葡萄醛酮还原酶(AKR)基因家族的鉴定与表达分析

为明确AKR基因在葡萄非生物胁迫中的作用,利用生物信息学方法对葡萄AKR基因家族(VvAKRs)进行了全基因组鉴定,并验证其在非生物胁迫下的表达规律。结果表明：(1)该基因家族在葡萄基因组中有9个成员,主要分布在5条染色体上;氨基酸残基在275~2 686 aa之间,理论等电点在5.1~9.1之间。(2)系统进化分析表明,该基因家族分为6个亚族,第6亚族VvAKR家族成员最多。(3)密码子偏好性分析结果表明,葡萄AKR基因家族密码子偏好性较弱。(4)共线性分析表明,葡萄9个AKR基因中只有VvAKR8和VvAKR9之间存在共线性关系。(5)qRT PCR分析结果显示,葡萄AKR家族基因在根、茎、叶不同组织中对激素和非生物胁迫的响应程度有差异。非生物胁迫下,VvAKR1、VvAKR3、VvAKR8和VvAKR9基因在葡萄根、茎、叶组织中表达量较高;激素处理下,根组织中VvAKR3、VvAKR6和VvAKR8基因在ABA、MeJA、SA处理下表达量较高;茎组织中VvAKR3基因在NAA、GA₃处理下表达量较高;叶组织中VvAKR1基因在各激素处理下表达量都较高。研究认为,葡萄AKR基因家族在响应葡萄非生物胁迫时发挥着不同的作用,为葡萄抗逆性研究提供了一定的理论依据。     

肺炎克雷伯菌Hfq蛋白特性及对耐药的影响

Hfq(host factor for RNA phage QB replicase)蛋白是一个全局性调节因子,广泛参与细菌生长、趋化、毒力、耐药及应对外界选择压力等方面的调节,但在肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)中的功能尚不清楚。本研究从临床病例中分离到59株KP,将其hfq基因与11例常见临床感染菌株hfq基因〔从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)数据库下载〕进行了比较。所有hfq基因经EMBOSS Transeq翻译成氨基酸序列,用MAFFT软件进行多序列比对,并通过NCBI数据库中的保守结构域预测Hfq蛋白结构域。分别采用ESPript3.0、Phyre2分析Hfq蛋白的二、三级结构。59株KP中仅3株hfq基因的5个密码子位点存在差异,而其蛋白质氨基酸序列完全一致。KP与大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、痢疾志贺菌之间,Hfq蛋白的氨基酸序列相似度较高,主要区别在C末端上;与金黄色葡萄球菌、产单核细胞李斯特菌相比,KP Hfq蛋白在N末端和C末端上差别较大;所有菌株C末端均呈酸性。三级结构预测提示68(66.67%)个氨基酸与模板序列一致, 较为保守的功能结构为54-VYKHAI-59序列。采用CRISPR/Cas9同源重组技术敲除KP的hfq基因,并对其进行药物敏感性测试,结果显示,基因敲除菌株对抗生素的耐药性较野生株有显著下降(P<0.05),差异有统计学意义,提示KP的Hfq蛋白氨基酸序列非常保守,可能参与了KP的耐药调节。     

沙米表型可塑性对土壤养分、水分和种群密度变化的响应

研究了土壤营养、土壤水分和种群密度等环境因素对沙米表型可塑性的影响.结果表明：土壤营养、土壤水分和种群密度对沙米的形态特性和生物量具有显著影响;随着土壤营养的增加,沙米的根冠比从0.135减小到0.073,但与土壤水分和种群密度无显著相关关系.对土壤营养和土壤水分变化响应的沙米繁殖分配可塑性是“真正的可塑性”; 沙米繁殖分配与土壤营养呈负相关,与土壤水分呈正相关; 在高土壤营养或低土壤水分条件下,沙米的繁殖分配随个体大小变化的速率较大;种群密度对沙米的繁殖分配无影响,其繁殖分配主要受个体大小的制约.在3个环境因素中,土壤营养对沙米形态特性和生物量特性的可塑性影响最大.     

鲤鱼乳酸脱氢酶活性的QTL检测

利用SSR分子标记结合“拟测交”策略, 以荷包红鲤抗寒品系和柏氏鲤远缘杂交所产生F1代为亲本及其F2代为作图群体, 应用Windows Map Manager 2.0软件的标记回归法进行乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase, LDH)活性数量性状基因座单标记定位分析。在乳酸脱氢酶性状的标记回归研究中, 共发现12个标记与LDH性状关联, 对性状的贡献率为4.00%~10.00%, 其中HLJE222达到极显著水平(P<0.01)。为了进一步验证, 利用已有的生物信息学工具, 将与性状连锁的EST序列与公共数据库中的核酸序列进行同源搜索分析, 发现标记HLJE222的EST序列与斑马鱼DAZ associated protein 1的mRNA序列相匹配(相似性为94%), 与公共数据库中的已知蛋白序列进行相似性比较, 同样发现HLJE222的EST与斑马鱼DAZ associated protein 1相匹配(相似性为97%)。结果表明HLJE222位点与影响乳酸脱氢酶活性相关的基因连锁。     

2009年大连市疟疾监测点监测报告

目的报告2009年大连市大连湾镇疟疾监测点监测结果,为今后疟疾防治工作提供理论依据和建议。方法监测人群疟原虫抗体（IFA）,对监测点发热患者进行病原学监测,采用通宵室外人饵诱捕法监测按蚊密度。结果3名学生间接荧光抗体（IFA）阳性,阳性率为0．97％,血涂片镜检阴性;病原学监测均为阴性;共捕到按蚊4只,占捕蚊总数的1．08％。结论大连市外来人口流动频繁,来自疟区的人员较多,结合疟疾传播媒介的分布及水平,今后存在发生本地病例的隐患,出现暴发疫情的可能性很小,但疟疾防治工作力度仍需加强。     

汉坦病毒东方田鼠分离株ZT10的M基因序列的特性分析

分析东方田鼠分离汉坦病毒ZT10株M基因分子特征.提取汉坦病毒ZT10株感染细胞的总RNA,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增ZT10株M片段全基因,克隆于T载体并测序,对其进行序列分析.结果显示汉坦病毒ZT10株的基因组M片段长度为3651个核苷酸,编码1133个氨基酸.序列分析表明其为Seoul型汉坦病毒.与八株Seoul型汉坦病毒的M片段同源性为84.0%～96.3%,而与HTN型汉坦病毒的同源性则较低,与从田鼠分离的汉坦病毒(Prospect Hill virus, Tula virus, Khabarovsk virus, Isla vista virus)核苷酸同源性仅为57.5%～60.9%,且与浙江省Seoul型分离株Guo3同源性较低,表明浙江省可能存在着另一Seoul亚型的汉坦病毒.     

双链抗体--一种新型基因工程抗体

双链抗体（Ｄｉａｂｏｄｙ）,是一种新型基因工程抗体。“Ｄｉａｂｏｄｙ”一词最早由Ｈｏｌｉｇｅｒ等于１９９３年提出［１］,他们的解释是,双链抗体乃是一种小分子的双价双特异性抗体片段。我们将“Ｄｉａｂｏｄｙ”试译为“双链抗体”的理由有二：（１）前缀“Ｄｉ...     

基于近20年遥感数据的藏北草地分类及其动态变化

利用1982—2000年NOAA/AVHRR的旬合成归一化植被指数(NDVI)资料,采用主成分分析和非监督分类方法对藏北那曲地区植被进行分类,分析不同草地类型代表像元的NDVI年内和年际变化特征;定义那曲地区牧草主要生长期平均NDVI≥0.1的地区为植被区,NDVI<0.1的地区为植被稀少区,进一步分析植被区每个像元NDVI的时空变化特征.结果表明:该地区草地类型可分为高寒草甸、高寒草甸草原、高寒草原和高寒荒漠,分类结果与实际情况相符.4种草地类型的NDVI年内变化均呈单峰型,年最大值出现在8月;近20年来那曲地区植被区7—8月平均NDVI由东南向西北逐渐减少,约在0.1~0.6之间变化,变异系数在0.05~0.40之间.NDVI高的地区,变异系数相对较小;NDVI低的地区,变异系数相对较大,年变率的范围在-0.005~0.008之间.近20年来那曲地区植被变化不明显,约20%地区(主要分布在西部的尼玛和东部的嘉黎、比如、索县和巴青等县)的植被活动在减弱.     

滇西苍山蝗总科昆虫垂直分布的最优分割(英文)

利用对有序样本元素的最优分割方法 ,把滇西苍山蝗总科昆虫的垂直分布划分为四段 :(1) 150 0～190 0m之间的干热河谷灌丛草坡带 ;(2 ) 190 0～ 2 30 0m之间的山地亚热带常绿阔叶林带 ;(3) 2 30 0～2 50 0m之间的山地温带针叶和阔叶林混交林带 ;和 (4 ) 2 50 0～ 2 90 0m之间的中山温性针阔混交林带。按这样的分法 ,每一个带内的差异最小 ,且每个带都具有自己的植被、气候和蝗总科昆虫特点。