Deletion of the gene encoding the ubiquitously expressed glucose-6-phosphatase catalytic subunit-related protein (UGRP)/glucose-6-phosphatase catalytic subunit-beta results in lowered plasma cholesterol and elevated glucagon

In liver, glucose-6-phosphatase catalyzes the hydrolysis of glucose-6-phosphate (G6P) to glucose and inorganic phosphate, the final step in the gluconeogenic and glycogenolytic pathways. Mutations in the glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6Pase) give rise to glycogen storage disease (GSD) type 1a, which is characterized in part by hypoglycemia, growth retardation, hypertriglyceridemia, hypercholesterolemia, and hepatic glycogen accumulation. Recently, a novel G6Pase isoform was identified, designated UGRP/G6Pase-beta. The activity of UGRP relative to G6Pase in vitro is disputed, raising the question as to whether G6P is a physiologically important substrate for this protein. To address this issue we have characterized the phenotype of UGRP knock-out mice. G6P hydrolytic activity was decreased by approximately 50% in homogenates of UGRP(-/-) mouse brain relative to wild type tissue, consistent with the ability of UGRP to hydrolyze G6P. In addition, female, but not male, UGRP(-/-) mice exhibit growth retardation as do G6Pase(-/-) mice and patients with GSD type 1a. However, in contrast to G6Pase(-/-) mice and patients with GSD type 1a, UGRP(-/-) mice exhibit no change in hepatic glycogen content, blood glucose, or triglyceride levels. Although UGRP(-/-) mice are not hypoglycemic, female UGRP(-/-) mice have elevated ( approximately 60%) plasma glucagon and reduced ( approximately 20%) plasma cholesterol. We hypothesize that the hyperglucagonemia prevents hypoglycemia and that the hypocholesterolemia is secondary to the hyperglucagonemia. As such, the phenotype of UGRP(-/-) mice is mild, indicating that G6Pase is the major glucose-6-phosphatase of physiological importance for glucose homeostasis in vivo.     

云南乌骨绵羊乌质性状与TYR基因多态性的相关分析

乌骨乌肉是乌骨绵羊的主要乌质性状。本文测定了乌骨绵羊、兰坪本地羊和罗姆尼羊血液TYR活性并分析了乌骨绵羊与乌骨鸡组织器官黑色素结构,结果表明：乌骨绵羊TYR活性显著高于兰坪本地绵羊和罗姆尼羊（P<0.05）;乌骨绵羊黑色素与乌骨鸡黑色素的IR光谱基本一致,黑色物质主要是真黑色素。首次克隆了绵羊TYR基因第一外显子长667 bp序列,并检测了乌骨绵羊和非乌骨绵羊TYR基因多态性。结果发现,检测的乌骨绵羊TYR基因第一外显子有两个变异位点,分别位于第64和154号编码氨基酸上,但都属于同义突变。通过对64号位置设计酶切位点检测TYR基因多态性,结果发现,该突变与乌质性状有关基因紧密连锁,TYR基因上可能存在乌质性状相关功能突变位点。另外,TYR基因多态性与毛色的表型相关极显著（P<0.01）,该基因可能也是毛色功能基因。     

Efficient parameterized algorithms for biopolymer structure-sequence alignment

Computational alignment of a biopolymer sequence (e.g., an RNA or a protein) to a structure is an effective approach to predict and search for the structure of new sequences. To identify the structure of remote homologs, the structure-sequence alignment has to consider not only sequence similarity, but also spatially conserved conformations caused by residue interactions and, consequently, is computationally intractable. It is difficult to cope with the inefficiency without compromising alignment accuracy, especially for structure search in genomes or large databases. This paper introduces a novel method and a parameterized algorithm for structure-sequence alignment. Both the structure and the sequence are represented as graphs, where, in general, the graph for a biopolymer structure has a naturally small tree width. The algorithm constructs an optimal alignment by finding in the sequence graph the maximum valued subgraph isomorphic to the structure graph. It has the computational time complexity O(k³N²) for the structure of N residues and its tree decomposition of width t. Parameter k, small in nature, is determined by a statistical cutoff for the correspondence between the structure and the sequence. This paper demonstrates a successful application of the algorithm to RNA structure search used for noncoding RNA identification. An application to protein threading is also discussed     

云南亚春蜓属一新种(蜻蜓目,春蜓科)

记述亚春蜓属1新种,贡山亚春蜓Asiagomphus gongshanensis sp.nov.,模式标本存放云南大理学院生命科学与化学学院.     

植物种子二形性（多形性）研究进展

植物种子的二形性（多形性）是指在同一棵植株上生长有形态结构、生理、生态学特性等方面有很大差异的两种（多种）种子。这种现象在自然界中比较普遍,特别是菊科、藜科、禾本科、十字花科中最为常见。二形性种子可分为有扩散结构和没有扩散结构（如冠毛和表皮毛状体）两种。如菊科的边花种子一般不具有扩散结构、个体较大,具有休眠特性和对光、温度、水、盐分等环境因子的敏感特性;而中间花种子一般具有扩散结构,个体较小,不具有休眠特性。具有休眠特性和对环境因子比较敏感的种子是形成土壤种子库的主要成分。二形性种子产生的幼苗在前期形态大小上都有差异,但生长后期有些差异不显著（70 days old for Hedypnois cretica）,有些仍很显著（Atriplex Sagittata）。这二形性幼苗所产生的后代同样也具有二形性现象。二形性种子产生的比例受环境因素的影响,例如：水、盐、养分和密度胁迫等。遗传因素也影响二形性种子的比例,其遗传率一般在0．2～0．5之间,是一种数量遗传性状,受多个基因控制。为了解释二形性种子产生的原因,从生态学和个体发育的角度提出了两个模型：生态进化模型（两面下注策略或高,低风险策略）和个体发育模型。不同植物的二形性（多形性）种子在结构、发芽,休眠特性、对环境因子的反应、幼苗特性、两者的比例受遗传和环境因素的影响不尽相同。种子二形性（多形性）是植物本身的遗传特性和环境因素共同作用产生的现象,是植物适应环境的一种生理、生态机制,是植物长期进化的结果。总之,二形性种子的形成机理非常复杂,目前还不是很清楚。对以下4个方面的研究进行了展望：采用生物技术的手段研究种子二形性的遗传机制;二形性种子激素等化学物质含量的差异;目前各种环境因素对植物生长的生理生态学意义;二形性植物生活史的系统研究。     

Tir细胞骨架偶联蛋白:大肠杆菌O157：H7的一种新的毒力因子

肠出血性大肠杆菌O157:H7是一种重要的传染性病原菌,可引起多种致死性疾病的爆发流行。Tir细胞骨架偶联蛋白(TccP)是近年来发现的O157:H7的一种新的重要的毒力因子,在O157:H7黏附宿主细胞造成黏附擦拭(A/E)损伤过程中起重要作用,TccP相关研究对阐明O157:H7致病机制具有重要意义。     

广东省香蕉与荔枝寒害致灾因子和综合气候指标研究

根据广东86个站点1951~2004年的气候资料、1955~2004年的寒害灾情资料以及已有的成果,对香蕉、荔枝寒害的致灾因子和寒害综合气候指标进行了研究。结果表明,香蕉、荔枝寒害的临界温度可以定为5.0℃,其致灾因子包括寒害的极端最低气温、最大降温幅度、持续日数和有害积寒,它们之间相关性明显。利用主成分分析对4个致灾因子进行综合简化,得到了一个物理意义清晰,且方差占总方差大部分的寒害综合气候指标。采用广州4个致灾因子的权重计算了全省86个站点历年的寒害综合气候指标。寒害综合气候指标数值的大小与香蕉、荔枝单产具有显著的负相关关系,可以用来分析香蕉、荔枝寒害的轻重。     

基于蛋白质-DNA复合物晶体结构的DNA结构动力学特性研究

依据最新NDB数据库中蛋白质-DNA复合物晶体结构数据,考虑DNA结构的序列依赖特性,对10个二联体和36个约化的四联体计算了DNA动力学结构模型中的关键参数——力常数矩阵,矩阵中的非对角项反映了结构参数间的关联。利用改进的DNA结构动力学模型,可以方便地计算给定序列的结构动力学特性。     

河流生态系统服务功能及水坝对其影响

河流生态系统服务功能是指河流生态系统与河流生态过程所形成及所维持的人类赖以生存的自然环境条件与效用,包括河流生态系统产品与河流生态系统服务两个方面。文中分析了河流生态系统的15项服务功能,其中包括供水、水产品生产、内陆航运、水力发电、休闲娱乐和文化美学等6项河流生态系统产品与调蓄洪水、河流输送、蓄积水分、土壤持留、净化环境、固定CO2、养分循环、提供生境和维持生物多样性等9项河流生态系统服务;同时又分析了修建水坝对这此服务功能的影响。研究表明,使河流生态系统服务功能得到正常发挥,是水坝建设决策中应考虑的必要因素。     

两种白斑小鼠突变基因的染色体定位

以本中心ENU诱变获得的两种白斑突变小鼠W-4Bao与Kitl-1Bao为研究对象[均为C57BL/6J(B6)背景],遗传试验表明它们都为单基因显性遗传,W-4Bao及Kitl-1Bao突变基因纯合子小鼠的表型分别为全白色及“黑头白”;将白斑杂合子小鼠与DBA/2(D2)交配获得具有白斑表型的F1小鼠,F1小鼠再回交D2繁殖[(B6×D2)F1×D2]F2小鼠,利用微卫星标记对F2代小鼠进行连锁分析。结果发现W-4Bao与微卫星D5Mit356、D5Mit308之间的LOD值分别为56.82、51.50,从而把该突变基因定位于第5号染色体D5Mit356与D5Mit308之间;Kitl-1Bao与微卫星D10Mit70、D10Mit68之间的LOD值分别为27.37、21.20,从而把该突变基因定位于第10号染色体上D10Mit70与D10Mit68之间。经过检索小鼠基因组数据库确认它们的候选基因分别为kit及kitl。