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141.
2008年至2009年间,在湖南和湖北两省的活禽市场中分离到了14株H6亚型禽流感病毒,为了解这14株病毒之间的分子特征和差异,我们运用PCR和测序鉴定对这14株病毒的NA基因进行了分型,并对其表面基因HA和NA进行序列测定及序列分析.14株H6亚型病毒中,H6N2亚型12株,H6N6亚型2株.序列测定和进化分析结果显示:DK/HN/284的HA基因与其它13株的HA差异性较大,差异性达到19.4%~20.2%,其余13株毒同源性在94.2%~99.9%;N2亚型NA基因的同源性在91.1%~99.9%,差异性比较大;两株N6亚型NA基因同源性为89.5%,差异明显.这些数据表明:不同毒株呈现一定的地域性差异.与我国周边其它地区的H6亚型禽流感毒株序列进行比较发现,只有DK/HN/284的HA基因与香港早期的毒株可能有着共同的来源,其余都与香港和韩国等的毒株有着较大的差异性,并且各个毒株的HA基因上潜在的糖基化位点和受体结合位点也有所不同,这些数据表明,这些毒株表现出明显的异源性. 相似文献
143.
继基因组学之后,针对各种代谢物的组学研究蓬勃兴起,鸟枪脂组学(shotgun lipidom ics)作为脂类研究的重要新兴手段,在创立和初期发展的过程中便已经展示出惊人的潜力,随着相关技术的进一步完善和发展,必将成为系统生物学的组成部分,在生物医学的研究和应用中发挥难以替代的重要作用。鸟枪脂组学利用质谱技术对全部或单一脂类及其相关分子进行系统分析,研究其改变对生物体所产生的作用并探讨其作用机制。传统脂类分析中的瓶颈问题在以电喷射离子质谱为基础的脂组学方法出现后获得了突破,使脂类分析进入高通量、高精度和高效能的时代。脂类在生物体内分布广泛、种类众多,并且与人类疾病密切相关。将脂组学分析方法运用于疾病相关的特异脂类标志物的发现并揭示其在疾病发生发展等复杂过程中的作用,可能为疾病的诊断治疗提供新的思路和策略。 相似文献
144.
New species of alderfly genus Sialis (Megaloptera: Sialidae) from China and Vietnam,with a key to species of Sialis from Asia
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The alderfly genus Sialis is the most species‐rich group of the family Sialidae. However, discovery of new Sialis species is becoming difficult because of previous good faunal exploration. In this paper, we describe two new Sialis species from the southern part of East Asia, S. australis and S. jiyuni, based on materials from historical and recent collections. These two species are closely related to the insular species S. kumejimae and are among the early diverged species within Sialis. Presently, 32 species of Sialis are recorded from Asia. A key to all the Sialis species from Asia is provided. 相似文献
145.
Multi-class protein fold recognition using support vector machines and neural networks 总被引:25,自引:0,他引:25
MOTIVATION: Protein fold recognition is an important approach to structure discovery without relying on sequence similarity. We study this approach with new multi-class classification methods and examined many issues important for a practical recognition system. RESULTS: Most current discriminative methods for protein fold prediction use the one-against-others method, which has the well-known 'False Positives' problem. We investigated two new methods: the unique one-against-others and the all-against-all methods. Both improve prediction accuracy by 14-110% on a dataset containing 27 SCOP folds. We used the Support Vector Machine (SVM) and the Neural Network (NN) learning methods as base classifiers. SVMs converges fast and leads to high accuracy. When scores of multiple parameter datasets are combined, majority voting reduces noise and increases recognition accuracy. We examined many issues involved with large number of classes, including dependencies of prediction accuracy on the number of folds and on the number of representatives in a fold. Overall, recognition systems achieve 56% fold prediction accuracy on a protein test dataset, where most of the proteins have below 25% sequence identity with the proteins used in training. 相似文献
146.
地衣芽胞杆菌有效的基因编辑工具有限,为了拓展和丰富其基因编辑手段,在地衣芽胞杆菌中构建一个抗性标记可重复使用的FLP/FRT基因编辑系统,并通过敲除α-淀粉酶基因amyL、蛋白酶基因aprE及敲入外源透明颤菌血红蛋白基因vgb对该系统进行初步验证。首先以温敏质粒pNZT1为载体分别构建amyL和aprE基因敲除质粒pNZTT-AFKF和pNZTT-EFKF,两个敲除质粒各自包含针对目标基因的同源臂、抗性基因及同向的FRT位点;将敲除质粒转化地衣芽胞杆菌并经过两次同源交换过程实现目标基因的敲除;最后导入一个FLP重组酶表达质粒通过FLP/FRT系统的重组作用介导抗性基因的回收。为进一步验证本系统的实用性及编辑效率,构建了包含透明颤菌血红蛋白编码基因vgb表达盒及基因组丙酮酸甲酸裂解酶编码基因pflB敲除盒的重组质粒pNZTK-PFTF-vgb,并以此进行外源基因vgb在基因组上的定向敲入。结果显示,成功敲除amyL及aprE并回收了抗性标记卡那霉素基因,敲除后淀粉酶活和蛋白酶活分别减少95.3%和80.4%;vgb基因成功整合入基因组pflB位点并回收了抗性标记四环素基因,并利用荧光定量PCR技术检测到vgb的整合表达。文中首次建立了一个适用于地衣芽胞杆菌的、抗性标记可重复使用的FLP/FRT基因编辑系统,并进行了基因敲除及基因敲入验证,为地衣芽胞杆菌遗传改造提供了良好的方法参考。 相似文献
147.
青藏高原的格桑花是什么植物或者说是什么植物的花,存在广泛争议,困扰着想一探究竟的人们。格桑花作为一种精神存在于藏族百姓心中,是他们追求幸福吉祥和美好生活的情感象征,是重要的雪域文化标识,认识熟知并开发利用好它,将有助于推动藏区生态、文化和产业振兴。金露梅是青藏高原分布最广的树木,按集生羽状复叶小叶数可分为5叶金露梅和7叶金露梅,《中国植物志》对它们的记载分别是金露梅(Potentilla fruticosa L.)和小叶金露梅(P.parvifolia Fisch.)。通过对青藏高原植被和历史文化景观考察,结合当地藏民描述及地方传说,本研究认为格桑花就是金露梅,其分布海拔可以拓展到5200 m的高寒恶劣环境。金露梅生性强健,耐寒、耐旱、耐瘠薄、耐强光,象征着藏族同胞刚毅、坚强、勤劳质朴、不畏严寒、生命力顽强的品格。 相似文献
148.
Three new species of Nepalomyia henanensis species group are described from China, N. damingshanus sp. nov., N. dongae sp. nov., and N. shennongjiaensis sp. nov. A key to known species of this species group is presented. 相似文献
149.
天鹅洲迁地保护江豚群体的遗传评估与发展预测 总被引:2,自引:0,他引:2
文章以2008年春季遭受严重雪灾的天鹅洲白鱀豚国家级自然保护区迁地保护江豚群体为研究对象,利用物种特异性微卫星遗传标记对该群体的遗传多样性进行了评估,并通过软件对其发展趋势进行了模拟和预测。研究结果表明,虽然2008年春季雪灾并未导致该群体遗传多样性的严重损失,灾后群体依然表现出中等水平的微卫星遗传多样性(18个座位的平均等位基因数为4.780,平均观察杂合度和期望杂合度分别为0.748和0.674);但模拟结果显示,该迁地保护江豚群体的遗传多样性将快速下降,100年后仅能保留约79%的等位基因和约84%的遗传杂合度。此外,模拟结果表明,通过增加群体数量和调整群体性比可有效减缓该群体遗传多样性的下降速度。根据研究结果,并结合长江江豚自然种群快速下降的现状,作者提出天鹅洲迁地保护江豚群体当前最重要的保护策略应该是尽早补充一定数量的、合适的野生个体,在加强遗传多样性保护的同时使其群体数量快速增长并形成一个更大规模的有效繁殖群体。 相似文献
150.
17个新的C2H2型锌指基因片段的分离与克隆 总被引:4,自引:0,他引:4
按照C2H2型锌指基因保守结构域的DNA序列设计一对简并引物,以人基因组DNA为模板进行PCR同源扩增,将由此获得的锌指基因片段为探针,从人胎肾、骨骼肌、骨骼组织的cDNA分子库中筛选到22个C2H2型锌指蛋白cDNA片段,经国际NCBI数据库查询检索,其中17个为新的锌指基因片段。对从胎肾cDNA分子库中分离到的K3-4和K5-12克隆进行了表达谱分析,发现K3-4在肾脏中的表达量明显高于其他几 相似文献