PCR筛选阳性克隆方法的改进

ＰＣＲ筛选阳性克隆具有简便、快速的优点,但常发生假阳性错误。用与载体匹配的引物和目的的基因引物组合进行ＰＣＲ,可以消除假阳性,同时可以判断插入目的基因的方向。     

中国酸藻属(酸藻科)一新记录

报道大连产舌状酸藻的分类研究,该种是中国的新记录。     

mRNA靶点筛选方法研究进展

mRNA靶点筛选问题是反义核酸领域的一个难题。近年来出现了多种筛选mRNA上可接近位点以确定靶位点的方法,包括mRNA实测分析法和计算机模拟分析两大类。其中mRNA实测分析法又包括多种针对自然折叠mRNA的实验分析技术;即基因walk技术,RNaseH作图技术、寡核苷酸微阵列技术,酶作图法确定二级结构技术,核酶导向型随机RNA库位点筛选技术和随机寡核苷酸库结合逆转录位点筛选技术。这些方法在鉴定RNA可接近位点及反义核酸的设计方面均有重要作用。     

通过原位反转录研究MADS盒基因M79的时空表达模式

通过设计可以引发特定mRNA进行转录的特异引物,采用了一种新的原位反转录的方法检测mRNA,这种原位反转录的方法是把原位杂交和反转录进行有机结合的结果,其实用性能和关键步骤都已进行优化.研究表明,只要设立合适的对照原位反转录方法,检测mRNA的灵敏度高、假阴性和假阳性率低.用这种方法对一个属于AGL2亚组的水稻(Oryza sativa L.)的MADS-盒基因M79的表达进行了分析,结果表明,在水稻从营养到生殖的各个发育阶段,M79均有表达,与平行进行的传统原位杂交的方法得到的结果类似.相对而言,原位反转录法耗时短、容易操作,可以成为一种可靠的原位定位mRNA的基本技术.     

塔里木河下游不同退化区地表植被和土壤种子库特征

对塔里木河下游不同退化程度的4个典型断面进行了植被和土壤种子库的取样调查,采用种子萌发试验研究了不同退化区植被和土壤种子库的特征,结果表明:(1)塔里木河下游地表植被表现为严重的逆行演替,具体体现为胡杨林都为过熟林,几乎没有胸径在10cm以下的幼林;植被盖度、密度和多样性指数均维持在一个较低的水平上;随退化程度不断加重,地表植被中草本植物的相对密度、相对盖度和相对频度逐渐降低,而灌木和乔木的相对密度、相对盖度和相对频度逐渐增加;(2)研究区土壤种子库的基本特征是:土壤种子库种类贫乏、密度低、多样性指数和相似性系数不高;(3) 随退化程度的加重,土壤种子库物种数不断减少、密度明显下降、优势种组成趋于单一、表层种子库比例升高、1年生草本植物占优势逐渐向多年生草本植物和灌木植物转变及土壤种子库物种组成与地上植被物种组成上差异显著.     

Bone marrow mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles containing miR-181d protect rats against renal fibrosis by inhibiting KLF6 and the NF-κB signaling pathway

Recent studies have investigated the ability of extracellular vesicles (EVs) in regulating neighboring cells by transferring signaling molecules, such as microRNAs (miRs) in renal fibrosis. EVs released by bone marrow mesenchymal stem cells (BMSCs) contain miR-181d, which may represent a potential therapy for renal fibrosis. miR-181d has been speculated to regulate Krüppel-like factor 6 (KLF6), which activates the nuclear factor-kappa B (NF-κB) signaling pathway. Luciferase assays were performed to confirm the relationship between miR-181d and KLF6. Gain- and loss-of-function studies in vivo and in vitro were performed to assess the effect of BMSC-derived EVs (BMSC-EVs), which contained miR-181d, on KLF6, NF-κB, and renal fibrosis. Transforming growth factor-β (TGF-β)-induced renal tubular epithelial HK-2 cells were treated with EVs derived from BMSCs followed by evaluation of collagen type IV α1 (Col4α1), Collagen I and α-smooth muscle actin (α-SMA) as indicators of the extent of renal fibrosis. Renal fibrosis was induced in rats by unilateral ureteral obstruction (UUO) followed by the subsequent analysis of fibrotic markers. BMSC-EVs had higher miR-181d expression. Overexpression of miR-181d correlated with a decrease in KLF6 expression as well as the levels of IκBα phosphorylation, α-SMA, Col4α1, TGF-βR1 and collagen I in HK-2 cells. In vivo, treatment with miR-181d-containing BMSC-derived EVs was able to restrict the progression of fibrosis in UUO-induced rats. Together, BMSC-EVs suppress fibrosis in vitro and in vivo by delivering miR-181d to neighboring cells, where it targets KLF6 and inhibits the NF-κB signaling pathway.Subject terms: Cell biology, Biotechnology     

能量标签技术及其在红树林生态系统能流研究中的应用

传统上认为红树林输出的有机质产生巨大的能流,支持了巨大的河口和近岸水域生态系统的次级生产。但能量标签技术的研究结果却显示红树林输出的有机质的作用并没有如此巨大。用红树碎屑难消化特性来解释此现象,此外数学模型模拟分析发现潮汐的稀释作用也可以解释这种现象。但这两者都不能解释,在其他初级生产者稀少时,红树材输出的有机质可以被大量利用的现象。在有红树林的河口和近海岸水域生态系统中,藻类等非红树初级生产者具有比红树植物更高的初级生产力,而且更容易被动物获得和消化。可以认为是藻类等巨大初级生产力的竞争作用导致红树初级生产在消费者组织中很难被发现,如此上面提到的难题就能得到很好的解决。此外能量标签技术检测出的是红树的初级生产在消费者组织中的相对比率,不是绝对数量值,从此角度看,能量标签技术的结果与传统观点不是矛盾而是互相补充的关系。由此推测红树的初级生产应该还是被消费者所利用,只是它们在消费者初级营养来源组成中占的比例并不大,但其绝对数量并不少。这与传统观点认为的红树的初级生产被大量利用,支撑了具有巨大的次级生产稍有不同。此外,能量标签技术在红树林生态系统中的适用性尚未检验;计算食物组成的数学工具不是很完善;实验设计上考虑的不够全面;对定量研究有一定的影响。