荒山绿化对野生新疆郁金香传粉昆虫多样性的影响

为探究荒山绿化模式下对野生新疆郁金香Tulipa sinkiangensis传粉昆虫多样性的影响,选取乌鲁木齐市雅玛里克山设置长期绿化区、短期绿化区和自然生境3个环境梯度,采取样线和样方调查等方法进行新疆郁金香传粉昆虫多样性的研究。共收集传粉昆虫共316头,隶属17科23属36种,优势种为黑腹膝芒寄蝇Gonia picea。不同绿化梯度下物种丰富度指数相似,但随着荒山绿化进程的推进传粉昆虫多样性指数、均匀度指数呈下降趋势,自然生境最高(2.719;0.941),长期绿化区最低(1.299±0.311;0.553±0.076)。长期绿化区和短期绿化区之间物种组成极不相似;长期绿化区和自然生境以及短期绿化区和自然生境之间物种组成均为中等不相似。同时发现,树木胸径对传粉昆虫多样性具有显著负面影响(P=0.047)。研究表明,未来荒山绿化工程应提高生态异质性,避免大片纯林的单一种植模式。     

甜菜属厚皮菜SWTY-1细胞质VNTRs多态性分析

利用数目可变串联重复序列(Variable Number of Tandem Repeats,VNTRs)微卫星标记方法,对重庆厚皮菜甜菜材料SWTY-1群体中100个单株的细胞质线粒体DNA片段中TR2位点VNTRs片段多态性进行分析。结果显示97个单株线粒体TR2位点微卫星串联重复序列均为3拷贝,与普通糖甜菜一致;3个单株线粒体TR2位点微卫星串联重复序列为6拷贝,发现甜菜属厚皮菜细胞质TR2位点VNTRs存在多态性,在该群体中发现了不同于甜菜栽培种新的细胞质单株。对该群体材料100个单株的抽薹及结籽进行观测,结果显示微卫星串联重复序列为6拷贝的变异植株中2个单株花期未抽苔开花,1株抽苔晚未形成正常种子;细胞质TR2位点VNTRs片段拷贝数为3的植株中2个单株未能正常抽薹,其他植株均正常抽薹结籽。     

ACSBAIA方法及其在烯丙胺类抗真菌药物设计中的应用

根据活性类似物活性基团在能量补偿许可范围内能够到达受体活性部位与各作用位点结合 ,而无 (低 )活性类似物的活性基团由于构象限制因素等不能与之结合的原理 ,建立一种新的搜寻药物分子的活性构象程序ACSBAIA .该程序包括 4个子系统 :构象抽样、活性构象限定、无活性构象排除、活性预测 .用此方法搜寻了烯丙胺类抗真菌药物的活性构象 ,并对 2个高活性和无活性的类似物进行了预测和检验 ,证明该方法较科学实用 .该方法的应用不受受体三维结构知识多少的限制 ,对目前绝大多数受体三维结构未知的情况尤其适用     

鼎湖山黄果厚壳桂粗死木质残体的分解

通过建立时间序列法、测定粗死木质残体的密度变化,研究鼎湖山黄果厚壳桂粗死木质残体三个直径(5~10cm、10~20cm和20~30cm)的分解过程,探讨粗死木分解过程中C、N元素及其C/N比值与分解速率的关系。结果表明粗死木质残体的分解常数K值随直径的增加从0.2225a-1呈指数降低到0.1257a-1,由粗死木质残体在分解过程中密度变化得出三个直径从小到大分解95%所需的时间分别为13a、19a和24a;黄果厚壳桂粗死木质残体在分解过程中不存在时滞效应,其树皮和心材的分解速度也相近,用单因素数指数方程能准确反映黄果厚壳桂的分解过程;与高纬度地区比较,鼎湖山黄果厚壳桂粗死木残体的分解速率常数K值显著高于前者。还就粗死木残体基质组成和性质、气候与环境条件、生物等因素对粗死木分解速率的影响进行了详细的讨论。     

水稻害虫绿色防控技术应用研究现状及展望

发展绿色防控技术是当前现代农业发展的必然要求,对保障我国粮食安全、生态安全等方面起着十分重要的作用.本文从农业和生态调控、理化诱控、生物防治、精准施药等4个方面回顾和梳理了我国水稻害虫绿色防控技术应用研究的发展和现状,并对未来的发展提出了建议和展望.本综述可为水稻害虫绿色防控技术的研究和应用提供参考.     

Annotating functional effects of non-coding variants in neuropsychiatric cell types by deep transfer learning

Genomewide association studies (GWAS) have identified a large number of loci associated with neuropsychiatric traits, however, understanding the molecular mechanisms underlying these loci remains difficult. To help prioritize causal variants and interpret their functions, computational methods have been developed to predict regulatory effects of non-coding variants. An emerging approach to variant annotation is deep learning models that predict regulatory functions from DNA sequences alone. While such models have been trained on large publicly available dataset such as ENCODE, neuropsychiatric trait-related cell types are under-represented in these datasets, thus there is an urgent need of better tools and resources to annotate variant functions in such cellular contexts. To fill this gap, we collected a large collection of neurodevelopment-related cell/tissue types, and trained deep Convolutional Neural Networks (ResNet) using such data. Furthermore, our model, called MetaChrom, borrows information from public epigenomic consortium to improve the accuracy via transfer learning. We show that MetaChrom is substantially better in predicting experimentally determined chromatin accessibility variants than popular variant annotation tools such as CADD and delta-SVM. By combining GWAS data with MetaChrom predictions, we prioritized 31 SNPs for Schizophrenia, suggesting potential risk genes and the biological contexts where they act. In summary, MetaChrom provides functional annotations of any DNA variants in the neuro-development context and the general method of MetaChrom can also be extended to other disease-related cell or tissue types.     

海南三亚滨海雨林、半落叶季雨林到落叶季雨林的植物群落多样性及种间联结研究

为探索三亚沿海地区(自东向西)从滨海雨林过渡到半落叶季雨林、落叶季雨林的物种多样性及种间关系的变化趋势.该文采用植物群落学调查方法对三种植被类型进行群落调查,进一步使用物种丰富度指数(dGL)、Shannon-Wiener指数(H)、Simpson指数(P)和Pielou均匀度指数(E)来表征各植被类型的物种多样性水平...     

杆状病毒表面展示系统研究进展

杆状病毒表面展示系统是近年发展起来的一种新的真核生物表面展示系统.通过与病毒衣壳或囊膜蛋白融合表达,可以将外源肽展示在杆状病毒表面,形成刺猬状"伪病毒".该文结合作者本人的实际工作,简要介绍此系统的原理、特点,并综述其在单抗制备、新型疫苗研制、基因转导与基因治疗等领域的最新研究进展.相信经过改进与优化,其可展现出更广阔的应用前景.     

Rhizobium sp. N613胞外多糖的抗氧化活性

以铁氰化钾和铁离子为检测系统测定了Rhizobium sp.N613胞外多糖(REPS)对氧化物的还原力;H2O2和Fe2+为羟自由基生成系统检测了REPS对羟自由基的清除作用;邻苯三酚自氧化法检测了REPS对超氧阴离子的清除作用;并体外检测了REPS对H2O2引起的氧化溶血现象的抑制作用及对小鼠肝组织脂质过氧化损伤的保护作用。结果显示,REPS对氧化物具有明显的还原力,其对羟自由基的清除作用达到35.46%(多糖浓度为2mg/mL),对超氧阴离子的清除作用达到36.84%(多糖浓度为0.78mg/mL),对H2O2引起的氧化溶血现象的抑制作用达到43.84%(多糖浓度为1.14mg/mL),对小鼠肝组织脂质过氧化的保护作用达到34.46%(多糖浓度为1.14mg/mL),表明REPS具有良好的抗氧化作用,有着重要的应用价值。     

叶面喷水影响芒果叶片午休的转录组分析

【目的】通过组学技术对持续喷水处理的芒果叶片产生的影响进行研究,揭示喷水处理打破“午休”的分子机制,为进一步优化喷水处理条件以实现最佳效果提供科学依据,并对提高芒果产量和品质以及响应国家减肥增效政策具有理论意义。【方法】以元江“台农一号”芒果品种为试验材料,对坐果期芒果在“午休”时段(12:30—14:10)喷水3次,每次喷水20 min,间隔20 min,以不喷水为对照,并以2组3个不同时期叶片进行Illumina Hi SeqTM 62000高通量转录组测序分析,利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库分析“午休”时段喷水与不喷水处理的差异表达基因(DEGs)。采用DESeq对基因表达进行差异分析,以|log2αFC|>1,P<0.05为筛选差异表达基因的条件。【结果】3个时期分别获得3 789,2 885,1 667个差异表达基因。GO分析发现差异基因与细胞组分分类中的膜、膜的固有成分、膜的组成成分等条目密切相关,KEGG分析差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、植物MAPK信号通路、植物昼夜节律、氨基糖和核苷酸糖的代谢、类黄酮生物合成、光合生物碳固定、角质和亚硫酸盐及蜡的生物合成、卟啉和叶绿素的代谢、淀粉和蔗糖代谢以及甘油酯质代谢等代谢途径。根据富集结果筛选8个差异表达基因表达分析,经实时荧光定量验证,基因表达趋势与转录组测序结果相符。【结论】CAO和POR基因表达延后,推测喷水处理可以延长叶绿素的合成时间;FBPase和SBPase的基因表达略微降低,推测叶面喷水调控基因的表达量降至缓解芒果午休的最适范围内,有利于树体积累碳同化物,从而提高光合效率。