甘蓝型油菜种子硫代葡萄糖苷含量的QTL定位及候选基因鉴定

【目的】为了解析油菜种子硫代葡萄糖苷性状的重要遗传位点及候选基因,【方法】本研究利用KN DH群体在冬性环境2015-2018连续4年的种子硫苷含量表型和KN 高密度SNP遗传连锁图谱,通过Wincart 2.5软件的符合区间作图法对甘蓝型油菜种子硫代葡萄糖苷含量进行QTL定位和潜在候选基因鉴定。【结果】共鉴定到47个硫苷含量QTL,单个QTL解释表型变异最大是qGC.16YL19-4(19.44%),解释表型变异最小的是qGC.15YL12-5(1.82%)。利用元分析的方法将初步鉴定的47个QTL整合为38个consensus QTL,其中7个consensus QTL(cqGC.A9-5、cqGC.A9-7、cqGC.A9-9、cqGC.C2-9、cqGC.C2-10、cqGC.C9-5和cqGC.C9-6)为环境稳定表达QTL,包括3个硫苷含量主效QTL(cqGC.A9-5、cqGC.C2-10和cqGC.C9-5)。在主效QTLcqGC.A9-5和cqGC.C9-5鉴定到3个候选基因BnaA09g05480D,BnaC09g05620D和BnaC09g05810D,其功能主要涉及了油菜硫苷生物合成途径中吲哚-3-乙醛肟(IAOx)的合成和将2-烷基-苹果酸异构化形成3-烷基-苹果酸酯,以及硫苷的转运与分配。【结论】本研究获得了油菜种子硫苷含量3个主效QTL及3个候选基因,该结果为硫苷含量相关基因的功能机械和优质油菜品种培育提供理论依据。     

不同身体质量指数人群肠道菌群结构及共存网络解析

[背景] 人体能量稳态失衡表现为体重过轻、超重和肥胖,肠道菌群与人体能量稳态的维持有关,但不同身体质量指数（Body Mass Index,BMI）人群的肠道菌群特征仍需进一步探究。[目的] 基于美国肠道计划公开数据库,解析4类BMI人群肠道菌群的特征,并探究4类BMI人群肠道菌群共存网络特征及差异,为基于肠道菌群来干预肥胖及体重过轻等不健康状态提供新的理论依据。[方法] 从美国肠道计划数据集中筛选具有BMI信息的肠道菌群样本,并根据世界卫生组织规定的BMI划分标准将筛选后的样本分为4类：体重过轻（BMI<18.5 kg/m²）,正常体重（18.5 kg/m²2）,超重（25 kg/m²2）,肥胖（BMI>30 kg/m²）;通过计算和比较肠道菌群的α多样性和β多样性探究4类BMI人群肠道菌群的整体结构特征及差异;通过多元线性回归模型对不同BMI分类与肠道菌群进行相关性分析,并且将地域、年龄、性别因素作为混杂因素加入到模型中进行校正;采用SparCC分别计算4类BMI人群肠道菌群中菌属相关性,并分别构建肠道菌群共存网络。[结果] 经过Wilcoxon秩和检验,发现体重过轻、超重、肥胖人群的肠道菌群α多样性都显著低于正常体重人群;β多样性分析结果表明4类BMI人群肠道菌群的整体结构存在显著差异;4类BMI人群肠道中厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）的相对含量无显著差异;通过MaAsLin分析,并且将地域、年龄、性别因素作为混杂因素加入到模型中进行校正,共得到49个与BMI类型显著相关的物种;4类BMI人群肠道菌群共存网络的拓扑结构具有一定差异,体重过轻和正常体重人群肠道菌群共存网络的复杂度较高,超重和肥胖人群肠道菌群共存网络的复杂度较低。[结论] 4类BMI人群肠道菌群的多样性、整体结构和共存网络间均存在差异。     

三峡大老岭山地常绿落叶阔叶混交林林隙干扰研究 I．林隙基本特征

为探讨我国亚热带山地常绿落叶阔叶混交林的林隙干扰特征,对三峡大老岭地区这一植被类型进行调查,分析了植被中林隙的数量、类型及成因;林隙形成木（GM）的类型、数量、物种构成和径级结构,以及林隙和GM的多尺度空间格局特征。结果表明1）林隙密度为11.7个*hm-2;冠林隙和扩展林隙分别占森林面积的11.09%和27.06%。平均每个林窗的形成木为4.5株;单株GM形成的林隙只占17.46%,其中翻倒木集群性最强。对林隙形成的贡献大小次序是翻倒木>折干>枯立>折枝。2）林隙成因方面冬雪和春、秋冻雨的影响最大;病害影响其次;树木间的牵连和撞击扩大了林隙的范围;陡峭的地形增大林隙形成的机率;干旱的影响很小。3）68种GM主要是森林建群种;常绿树种形成林隙的平均机率高于落叶种。4）GM的胸径结构表明本地森林林隙干扰十分频繁。     

Tensin

Tensin is a cytoplasmic phosphoprotein that localized to integrin-mediated focal adhesions. It binds to actin filaments and contains a phosphotyrosine-binding (PTB) domain, which interacts with the cytoplasmic tails of beta integrin. These interactions allow tensin to link actin filaments to integrin receptors. In addition, tensin has an Src Homology 2 (SH2) domain capable of interacting with tyrosine-phosphorylated proteins. Furthermore, several factors induce tyrosine phosphorylation of tensin. Thus, tensin functions as a platform for dis/assembly of signaling complexes at focal adhesions by recruiting tyrosine-phosphorylated signaling molecules through the SH2 domain, and also by providing interaction sites for other SH2-containing proteins. Analysis of knockout mice has demonstrated critical roles of tensin in renal function, muscle regeneration, and cell migration. Therefore, tensin and its downstream signaling molecules may be targets for therapeutic interventions in renal disease, wound healing and cancer.     

海洋固氮菌和解磷菌的分离鉴定及发酵条件优化

【目的】从西沙喜盐草根际沉积物中分离纯化得到具有高效固氮能力及解磷能力的菌株。优化其发酵培养条件,研究其制备海洋微生物菌剂的可能性。【方法】从形态学特征、生理生化、16S rDNA及功能基因水平进行鉴定,通过乙炔还原法、钼锑抗显色法检测菌株的固氮酶活性和解磷能力,单因素法和响应面法优化其发酵培养条件,溶血试验和急性毒性实验鉴定菌株的安全性。【结果】结果表明,菌株AZ16属于星箭头菌(Sagittula stellate),革兰氏阴性菌,选择性固氮培养基中菌落呈黄圆形黏稠状,固氮酶活性达34.63 nmol C2H2/(mL·h),最适生长条件为:盐度25‰、pH 7.5、温度33°C、接种量5.0%;菌株XT37为海洋芽孢杆菌(Bacillus sp.),革兰氏阳性菌,选择性固氮培养基中菌落呈深黄色圆形褶皱,植酸酶活性达239.49μg/L,最适合生长条件为:盐度25‰、pH 6.7、温度28°C、接种量5.0%。溶血实验和急性毒性实验证明两株菌属实际无毒级别。【结论】两株菌具有高效的固氮解磷功能,以及抗高盐、强碱等环境的能力,安全无毒,因此有潜力应用于多功能混合微生物菌剂的研制。     

The first insight into the <Emphasis Type="Italic">Taxus</Emphasis> genome via fosmid library construction and end sequencing

Taxus mairei is a critically endangered and commercially important cultured medicinal gymnosperm in China and forms an important medicinal resource, but the research of its genome is absent. In this study, we constructed a T. mairei fosmid library and analyzed the fosmid end sequences to provide a preliminary assessment of the genome. The library consists of one million clones with an average insert size of about 39 kb, amounting to 3.9 genome equivalents. Fosmid stability assays indicate that T. mairei DNA was stable during propagation in the fosmid system. End sequencing of both 5′ and 3′ ends of 968 individual clones generated 1,923 sequences after trimming, with an average sequence length of 839 bp. BLASTN searches of the nr and EST databases of GenBank and BLASTX searches of the nr database resulted in 560 (29.1%) significant hits (E < e⁻⁵). Repetitive sequences analysis revealed that 20.8% of end sequences are repetitive elements, which were composed of retroelements, DNA transposons, satellites, simple repeats, and low complexity sequences. The distribution pattern of various repeat types was found to be more similar to the gymnosperm Pinus and Picea than to the monocot and dicot. The satellites of T. mairei were significantly longer than those of P. taeda and P. glauca. The tetra-nucleotide repeats of T. mairei were much longer than those of P. glauca and P. taeda. The fosmid library and the fosmid end sequences, for the first time, will serve as a useful resource for large-scale genome sequencing, physical mapping, SSR marker development and positional cloning, and provide a better understanding of the Taxus genome.     

汞在微生物中的跨膜运输机制研究进展

甲基汞是一种强亲脂性、高神经毒性的有机汞化合物,可以通过生物富集或生物放大造成人类甲基汞暴露。环境中甲基汞的产生主要是厌氧微生物所调控的无机汞的甲基化。主流观点认为厌氧微生物对汞的甲基化是一种细胞内反应,因此,甲基汞的产生速率不仅与环境中具有汞甲基化能力的厌氧微生物的存在与活性相关,同时也与无机汞在微生物细胞中的跨膜运输过程有着重要联系。要明确无机汞经微生物甲基化的机制,就必须了解无机汞被微生物细胞生物吸收的过程,即无机汞在微生物中的跨膜运输路径。目前研究认为该过程主要有Mer抗汞操纵子转运体系、被动扩散、促进扩散和主动运输4种路径。本综述主要围绕无机汞被微生物细胞生物吸收的这4种路径展开,将系统介绍科学界对这4种路径的最新研究进展,并对相关研究进行展望,指出无机汞经促进扩散或主动运输进入到微生物细胞内将是未来研究的重点。     

重组人白细胞介素6的制备

我们采用本院基础医学研究所组建的ＩＬ-６工程菌Ｅ．ｃｏｉｌＤＨ５ａ（ｐＢＶ-ｈｌＬ－６）,在选定的培养基及ｐＨ值下,采用３０升发酵罐进一步观察了工程菌的生长和ｒＩＬ－６的表达,确定了发酵工艺条件。在此条件下连续进行了三批次的培养试验。结果表明,工程首的生长密度达到２．５１±０．０２ｇ［干重］／Ｌ［发酵液］,ｒＩＬ-６产率为１８２．４±２．０ｍｇ／ｇ［干重］。ｒＩＬ-６以包涵体形式表达于大肠杆菌细胞中,破菌后选用非离子型去垢剂或尿素等变性剂提取包涵体中的杂蛋白,可使ｒＩＬ-６的纯度达到７０．１±１．３％,收率为７１．９±１．９％。洗涤后的包涵体,经过凝胶柱纯化和复性,ｒＩＬ-６纯度达到９５％以上,柱纯化的收率为７２．３±０．９％;采用依赖ＩＬ-６,小鼠杂交瘤细胞系７ＴＤ１及ＭＴＴ比色法测定生物活性,ｒＩＬ-６比活性达２×１０８Ｕ／ｍｇ。     

小麦间期集缩染色质的超微结构研究

本文以普通小麦(Triticum aestivum L.)根端分生组织为材料,在透射电镜下对间期细胞核内的集缩染色质的高层次结构进行了研究。在其中观察到直径约为20—25nm、50nm及110—120nm 的不同等级染色线,并且发现直径110—120nm 的染色线是由50nm 的染色线组成的,而直径约50nm 的染色线是由20—25nm 的染色线组成的。对这三个层次染色质结构之间的集缩方式进行了讨论。