急性髓系白血病mRNA与非编码RNA差异表达谱及CeRNA调控网络分析

利用GEO数据库(gene expression omnibus database)通过生物信息学分析方法探讨急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)的发病机制。检索GEO数据库中AML相关芯片数据集GSE142698、GSE142699和GSE96535。利用GEO2R分析得到差异mRNAs、miRNAs以及差异lncRNAs。利用在线生物信息学分析工具DAVID对差异mRNAs进行GO富集分析和KEGG通路分析。利用miRWalk数据库预测AML相关miRNAs的靶向mRNAs,利用Spongescan数据库预测AML相关miRNAs的靶向lncRNAs,构建lncRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA （competing endogenous RNA,ceRNA）调控网络。共筛选出29个显著差异mRNAs、70个显著差异miRNAs和20 005个显著差异lncRNAs。GO富集分析和KEGG通路分析显示,差异表达基因主要涉及蛋白磷酸化、细胞分裂、细胞增殖的负调控、基因表达的正向调节、周期蛋白依赖的丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调节等生物过程以及细胞周期、细胞衰老、癌症通路、PI3K-Akt通路等信号通路。将miRWalk数据库预测的靶向mRNAs与差异mRNAs取交集,Spongescan数据库预测的靶向lncRNAs与差异lncRNAs取交集,分别确定了25个mRNAs、6个lncRNAs参与AML相关ceRNA调控网络的构建。结果表明,lncRNAs可能作为关键的ceRNA,通过调控miRNA和相关靶基因参与AML的发生与发展,研究结果为AML诊断和治疗的分子生物学研究提供了新的依据。     

又一种引致人体原发性皮肤毛霉病的非商温根毛霉属真菌

一年多以前,我们报道了一种引致人类原发性皮肤毛霉病的病原真菌Rm6并定名为多变根毛霉((Rhizomucor variabilis Zheng & G.-q. Chen)。最近我们又发现了它的另外一个变种Rm7。它是北京医科大学第一医院的王端礼教授分离的,原编菌号4873。Rm7的病人和Rm6的情况很相近。她也是一个女病人,来自农村,患的同样是原发性皮肤病而没有患有其他的毛霉病或其他疾病,她的病也没有传染给她的家人。不同的是,她来自我国北部的河北省而不是南部的江苏省;她的病史更长,达16年之久;她的病部在脸上而不是在手上,并造成进食困难。Rm7和Rm6的培养物相似,也是亮黄色,但比较低矮。它与Rm6一样是非高温真菌,最适、最高、最低温度同样分别是24-30, 38,和9℃形态上的亲缘性也是显而易见的:两者都有匍匐菌丝和较发达的假根;孢子枝也是假轴分枝;孢子囊壁也是缓慢消解;有很不规则形状的囊轴;有明显的囊领;都有大量厚垣孢子。Rm7与Rm6的主要区别在于:(1)假根只从匍匐菌丝和气生菌丝上长出而不从孢子枝、孢子囊或囊轴等各处长出;(2)孢子枝可连续分枝达7次之多;(3)孢子枝在分枝处往往有一个隔膜;(4)往往在10天以上的培养物中才出现不规则形状的囊轴;(5)从未见有囊托;(6)孢囊孢子形状较规则,较短而不超过11 μm;(7)孢子囊和囊轴均较小,直径相应不超过70及30 μm.因此,我们将Rm7鉴定为Rm6的一个变种,并定名为较规则多变根毛霉新变种(Rhizomucor variabilis var. regularior Zheng & G.-q. Chen var.nov.)。这样,在根毛霉属内可以承认的共计5种6分类群。     

《中国真菌志》50年编研成果及展望

历经几代真菌人的艰苦奋斗,《中国真菌志》目前已出版65卷,其中子囊菌类有35卷、担子菌类26卷、接合菌类1卷、卵菌1卷、黏菌2卷;上述卷册记录923属9 228种及种下分类群。编研涉及大型和小型的类群、腐生菌、食药用菌、菌根真菌、作物和林木病原菌、捕食性真菌、虫生菌、菌生真菌以及毒菌等。编研过程中发现并发表了大量新分类群,丰富了对菌物物种多样性的认知。归纳已有成果,已立项卷册应加快编研和出版进度;资源调查与分类学研究需进一步加强,按分类群(专科、专属)继续开展编研工作,注重拟参编类群的前期研究积累;以下分类群值得在后续工作中予以关注：水霉目等部分卵菌、壶菌类、座囊菌纲部分类群、盘菌纲和锤舌菌纲中尚未参编的主要类群、伞菌纲中具有小型子实体的类群等。由于分类系统在不断更新和完善,已出版卷册中使用的部分名称和分类地位的处理需依据被大多数学者所公认的分类系统给予适时的订正。期待建设一支继往开来的菌物分类学研究队伍,不断取得令世人瞩目的编研成果,为我国菌物资源利用和物种保护提供科学依据。     

水稻蜡质基因5＇上游区缺失对基因表达的影响

为研究水稻蜡质基因（ｗａｘｙ）５＇上游调控区中存在的顺式作用元件,我们将水稻ｗａｘｙ基因翻译起始声、（ＡＴＧ）５＇上游３．４ｋｂ（－２１１８～＋１２９１ｂＰ）片段经外切核酸酶ＥｘｏⅢ部分酶解,得到一系列５＇端缺失的片段。将这些缺失片段分别与ｇｕｓ基因编码区连接,构建成融合质粒,经ＰＥＧ介导引入水稻原生质体,２６℃培养４８ｈ后,定量测定ＧＵＳ酶活力,并以同时导入的由３５Ｓ启动子指导的荧光素酶（ＬＵＣ）基因表达的酶活力作为内对照。结果表明,ＧＵＳ酶活性随５’上游调控区长度的减少而逐渐减弱。由─８６１ｂｐ缺失至─６４０ｂＰ时,ｇｕｓ基因表达水平有较明显的降低,推测在该区域中可能存在一个顺式作用元件区。     

Repair effect of thymine radical anion by echinocoside using pulse radiolysis

Repair activities of thymine radical anion by echinocoside, isolated from Pedicularis plicata. were studied using pulse radiolysis technique. The thymine radical anion was produced by the reaction of hydrated electron with thymine. Echinocoside. one of the polyphenols of phenylpropanoid glycoside, was added to the thymine aqueous solution saturated with N2. Kinetic analysis by transient absorption spectrum showed that thymine radical anion was formed at first, and then after several decades of microseconds of pulse radiolysis. the spectrum of thymine radical anion was changed to that of echinocoside radical anion. The evidence indicated that thymine radical anion was repaired through one-electron-transfer between the DNA base radical anion and echinocoside. The rate constant of electron transfer by echinocoside was 1.45× 109 dm3 · mol1 · s 1.     

下盾螨属一新种──（蜱螨亚纲：厉螨科）

本文记述下盾螨新种Ｈｙｏａｓｐｉｓｓｏｒｅｃｉｓｓｐ．ｎｏｖ,并讨论与近似种Ｈ．ＨｒｙｄｉＳａｍｓｉｎａｋ１９６１的鉴别特征。模式标本采自青海互助土族自治县的暗色ＳｏｒｅｘｓｉｎａｌｉｓＴｈｏｍａｓ,１９１２体上。文内量度单位均为μｍ,标本存放在青海省地方病防治研究所,西宁。     

中国异皮属线虫一新种（线虫纲：垫刃目：异皮科）

本文描述采自河北省滦县寄生于白茅Ｉｍｐｅｒａｔｅ ｃｙｌｉｎｄｒｉｃａ ｖａｒ．Ｍａｊｏｒ的异皮属线虫一新种,中华异皮线虫Ｈｅｔｅｒｏｄｅｒａ ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．;新种孢囊为柠檬形,阴门膜孔为两侧单膜孔型,下桥发达有泡状突;二龄幼虫口针基部球前部略凹陷,口孔侧唇外缘融合王头晕第１环纹内,即无明显侧唇,其体侧区有３条侧线与体环纹呈不完全网格状交叉;雄虫侧区有３条侧线与体环纹呈完全网格状     

中国赤螨两新种（蜱螨亚纲：赤螨科）

醉语言忆述赤螨科２属２新种。朱亭纤赤螨Ｌｅｐｔｕｓ ｚｈｕｉｎｇｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．,外寄生于刺股钩臂叶甲和一种蝉,新种与Ｌ．ｄｒａｃｏ Ｓｏｕｔｈｃｏｔｔ近似,前感毛基部位于骨化程度较低之盾片上,但新种Ｖｓ刚毛位于足Ⅱ膝节上,而不象Ｌ．ｄｒａｃｏ位于足Ｉ膝节上,新种须肢股节上刚毛为披针形,而Ｌ．ｄｒａｃｏ为棒状,以资区别。湖南查丽赤螨Ｃｈａｒｌｅｔｏｎｉａ ｈｕｎａｎｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏ     

中国蚱科三新种记述（直翅目）

本文记述采自云南和四川省刺翼蚱亚科二新种,钝叶瘤蚱Ｔｈｏｒａｄｏｎｔａ ｏｂｔｕｓｉｌｏｂａｔａ ｓｐ．ｎｏｖ．,横刺瘤蚱Ｔｈｏｒａｄｏｎｔａ ｔｒａｓｓｐｉｃｕｌａ ｓｐ．ｎｏｖ．,及采自新疆蚱亚科一新种,新疆蚱Ｔｅｔｒｉｘ ｘｉｎｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．。     

盐长蝽亚科外部形态及其系统学意义的研究：半翅目：长蝽科

本文研究了半翅目长蝽科盐长蝽亚科（Ｈｅｎｅｓｔａｒｉｎａｅ）的外部形态,希图为长蝽总科复合体的系统发育研究提供资料。材料选用盐长蝽ＨｅｎｅｓｔａｒｉｓｏｓｃｈａｎｉｎｉＢｅｒｇｒｏｔｈ１９１９和卤长蝽ＥｎｇｉｓｔｕｓｓａｌｉｎｕｓＪａｋｏｖｌｅｖ１８７４,分别作为该亚科３个成员属中两个属（即盐长蝽属ＨｅｎｅｓｔａｒｉｓＳｐｉｎｏｌａ１８３９和卤长蝽属ＥｎｇｉｓｔｕｓＦｉｅｂｅｒ１８６４）的代表。文章还初步提出了该亚科的一些共有新征,并作了有关讨论,认为此分类单元为一单系群。