基于宏基因组学的猪群样本病毒探测方法的建立

极其多样的病毒广泛存在于我们周围的环境和动物体内,其中很多病毒是人类所未知的,而发现未知病毒常常受制于病毒常规检测技术的局限性.[目的]构建未知病毒检测技术平台.[方法]应用病毒宏基因组学的理念,结合新型分子诊断技术,首先利用过滤和核酸酶处理去除样品宿主核酸干扰,然后随机PCR扩增潜在的病毒宏基因组,最后通过大规模测序及序列分析获取病毒核酸信息.[结果]利用此技术我们对猪瘟病毒(CSFV)细胞培养物和猪圆环病毒2型(PCV2)感染猪病料进行了分析,分别检测到序列总长度1680 bp,占基因组13.7％的CSFV序列和序列总长度834 bp,占基因组47.2％的PCV2序列;利用此检测技术平台研究一未知病原细胞培养物,通过测序和序列分析,结果显示56条序列中有26条为副流感病毒5型(PIV5)同源序列,覆盖了其基因组全长的16.4％;此外,应用本研究建立的方法结合新一代高通量测序,我们在混合的7份病原未知的病猪组织样品中检测到了1.1％的病毒序列,包括CSFV、PCV2、猪细环病毒(TTSuV)、猪bocavirus (PBoV)和人腺病毒6型(Ad6)等的部分基因序列.[结论]本研究建立的基于病毒宏基因组学的未知病毒的检测方法突破了传统病毒研究方法的缺陷,对于猪群样本中病毒的检测具有较高的敏感性,有望为新发、突发感染性疾病的诊断和监测提供技术支持.     

The Hippo–YAP pathway regulates the proliferation of alveolar epithelial progenitors after acute lung injury

Regeneration of pulmonary epithelial cells plays an important role in the recovery of acute lung injury (ALI), which is defined by pulmonary epithelial cell death. However, the mechanism of the regenerative capacity of alveolar epithelial cells is unknown. Using a lung injury mouse model induced by hemorrhagic shock and lipopolysaccharide, a protein mass spectrometry‐based high‐throughput screening and linage tracing technology to mark alveolar epithelial type 2 cells (AEC2s), we analyzed the mechanism of alveolar epithelial cells proliferation. We demonstrated that the expression of Hippo‐yes‐associated protein 1 (YAP1) key proteins were highly consistent with the regularity of the proliferation of alveolar epithelial type 2 cells after ALI. Furthermore, the results showed that YAP1+ cells in lung tissue after ALI were mainly Sftpc lineage‐labeled AEC2s. An in vitro proliferation assay of AEC2s demonstrated that AEC2 proliferation was significantly inhibited by both YAP1 small interfering RNA and Hippo inhibitor. These findings revealed that YAP functioned as a key regulator to promote AEC2s proliferation, with the Hippo signaling pathway playing a pivotal role in this process.     

丁香酚对致热家兔弓状核及PO/AH区脑组织中PGE2和cAMP含量的影响

丁香酚是中药丁香油中的主要作用成份,它具有多种复杂的药理作用,尤其在解热降温方面有显著作用.本研究室以往的电生理实验观察到,丁香酚可反转致热原作用下的PO/AH(视前区-下丘脑前部)温度敏感神经元的放电活动,说明丁香酚的解热作用是通过直接或间接地影响PO/AH神经元的放电活动而实现的.近年来,弓状核在体温调节方面的作用倍受观注.本研究室多年的研究表明,弓状核积极地参与了体温调节活动,因为毁损弓状核后大鼠体温发生明显紊乱.本实验对PO/AH与弓状核在体温调节中的作用进行比较性研究,同时观察家兔发热以及丁香酚解热时在家兔弓状核及PO/AH中PGE2和cAMP含量的变化.     

两种A类氨基酸转运蛋白部分功能差异的研究

应用重组Vaccinia病毒表达系统在猴肾成纤维细胞CV—1中瞬时表达大鼠A类氨基酸转运蛋白GlnT和SAT—2,研究它们转运MeAIB、Ala和Gln的动力学和对多种氨基酸转运亲和性的差异,结合它们的氨基酸序列同源性比较表明：虽然GlnT和SALT—2蛋白的氨基酸序列有较高的同源性,但它们在转运功能上有较大的差异。     

High cell density culture of the diatom Nitzschia laevis for eicosapentaenoic acid production: fed-batch development

A fed-batch process was developed for high cell density culture of the diatom Nitzschia laevis for enhanced production of eicosapentaenoic acid (EPA). Firstly, among the various medium components, glucose (Glu) was identified as the limiting substrate while nitrate (NO₃⁻), tryptone (Tr) and yeast extract (Ye) were found to promote cell growth by enhancing specific growth rate. Therefore, these components were considered essential and were included in the feed medium for subsequent fed-batch cultivation. With the optimized ratio of NO₃⁻:Tr:Ye being 1:2.6:1.3 (by weight), the relative proportions of glucose to the nitrogen sources in the feed were investigated. The optimal ratios of Glu:NO₃⁻ for specific growth rate and EPA productivity were both determined to be 32:1 (by weight). Finally, based on the residual glucose concentration in the culture, a continuous medium feeding strategy for fed-batch fermenter cultivation was developed, with which, the maximal cell dry weight and EPA yield obtained were 22.1 g l⁻¹ and 695 mg l⁻¹, respectively, which were great improvements over those of batch cultures.     

三江源国家公园兽类物种多样性及区系分析

为了解三江源国家公园野生兽类的分布现状,2015-2017年对园区进行了实地调查。根据调查结果并参考相关文献资料,三江源国家公园内野生兽类共62种,分别隶属8目19科44属。园区内兽类呈现出物种多样性高,珍稀濒危物种多,特有种多的特点：三江源国家公园内的兽类物种多样性G-F指数为0.77,表明该区域物种多样性处于很高水平。根据中国物种红色名录,20个物种受威胁（极危、濒危和易危）,比例为32.26%,远高于国家整体水平;中国或青藏高原特有种29种,占46.77%。三江源国家公园在动物地理区划上属于古北界青藏区,在地理分布型上,以古北界成分为主,东洋界成分为辅,以古北界高山型成分最多,有25种,且资源量大,表明三江源国家公园的兽类以适应高寒气候的特殊种类为主。3个园区的平均动物区系相似性比较结果表明,长江源园区与澜沧江源园区为共同关系,黄河源园区与长江源园区和澜沧江源园区为密切关系。近些年,三江源地区的兽类保护工作取得了很好的效果,并得到国内外认可,本研究结合园区生物多样性和区系特点,根据保护现状,提出了今后的监测保护建议。     

L(+)-酒石酸发酵法生产工艺改进的研究

虽然具有广泛用途的Ｌ( ) 酒石酸的生产方法有 4种[1 ] ,但目前研究最多 ,最具工业生产前景的方法 ,是应用化学合成的前体为底物 ,发酵生产Ｌ( ) 酒石酸的方法。该法中的微生物发酵转化适宜在弱碱性的条件下进行 ,通常都是把顺式环氧琥珀酸制备成相应的二钠盐来作为前体 ,再进行微生物转化生成Ｌ( ) 酒石酸。张建国[2 ] 、黄腾华等人[3 ] 在实验室按以上路线生产Ｌ( ) 酒石酸 ;孙志浩等人[4] 以明胶为载体固定化微生物细胞生产Ｌ( ) 酒石酸 ;张建国等人[5 ]在他们自己工作的基础上进一步探讨了细胞固定化的方法 ,找到了一种…     

猪霍乱沙门氏菌递送的双启动子表达载体的构建

猪霍乱沙门氏菌C500株不仅可以作为预防猪沙门氏菌病的活疫苗,还可作为运送其他DNA疫苗的优良载体,并通过粘膜免疫诱导产生针对特定抗原的各种免疫应答。为增强其携带的DNA疫苗的免疫效力,本研究以真核表达载体pEGFP-C1为基础,将其真核启动子CMVie与原核启动子Ptrc串联,并在其多克隆位点MCS下游引入rrnbT1T2转录终止序列,构建了真、原核双启动子表达载体pEGFPPtrcR。用1×TSS法将其转化C500,得到工程菌C500/pEGFPPtrcR,通过SDS-PAGE和Westernblotting鉴定了报告基因EGFP的原核表达,该菌在荧光显微镜下能发出强烈绿色荧光,被证明在体外至少能稳定遗传20代;采用脂质体介导法将pEGFPPtrcR转染Vero细胞,EGFP在胞核和胞浆内表达,24h后观察可到明显绿色荧光。结果表明,双启动子表达载体pEGFPPtrcR构建成功,预示其携带的外源基因既可在C500中表达,又可在体细胞中表达,为研制以C500为载体的新型DNA疫苗的发展开辟了一个新的途径。     

三种海水生态养殖池塘细菌数量特征及其与环境因子的相关性

为阐明不同生态养殖池塘浮游细菌数量变化规律及其与环境因子间的相关性,以期为多元立体综合养殖模式中的水质安全与生物疾病防控提供科学依据。利用荧光显微镜细菌计数法(Acridine Orange Direct Counting),研究了“参-虾”“蟹-蛏”和“蜇-蛏”三种海水生态养殖池塘的细菌数量特征,使用典范对应分析(Canonical Correspondence Analysis, CCA)探讨细菌数量与环境因子的相互关系。结果表明,“参-虾”“蟹-蛏”和“蜇-蛏”池塘的细菌平均密度分别为(0.49～3.32)×10⁵ cell/mL、(0.52～2.98)×10⁵ cell/mL和(0.47～2.55)×10⁵ cell/mL,细菌数量有明显的时间差异,夏季密度大于春秋季。三种海水生态养殖池塘的水温、溶解氧和pH变化均不明显,且相差不大,而硝态氮均发生显著变化;其中“蟹-蛏”和“蜇-蛏”池塘的硝态氮、亚硝态氮、活性磷、总氮和总磷均高于“参-虾”池塘,透明度、叶绿素a和化学耗氧量则均低于“参-虾”池塘。典范对应分析(C...     

一种快速、无损大豆种子DNA提取方法的建立和应用

基因分型是进行植物基因功能的遗传分析和分子标记辅助育种的重要环节。该研究以大豆(Glycine max)成熟种子为材料, 建立了通过钻孔采集样品、快速提取DNA进行基因型鉴定的方法。用此方法, 一个熟练的工作人员可以在1个小时内完成120个样品的采集和DNA提取; 同时种子钻孔取样后, 不会对大豆种子的萌发造成影响。利用该方法获得的DNA可满足PCR扩增的要求。实验重复性好, 成功率在98%以上。这种快速且无损的大豆种子基因型鉴定方法可以用于鉴定杂交种子、品种纯度以及遗传分析等研究工作。