基于高通量测序分析盐角草根部内生细菌多样性及动态规律

【目的】探讨盐角草根部内生细菌群落多样性特征,揭示内生细菌群落结构在宿主关键发育期动态变化规律。【方法】通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16S r RNA片段,然后进行生物信息分析。【结果】共获得20363条16S r RNA基因序列。各样品中可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)在552–941之间。根部内生细菌群落主要包括4个门,其中Proteobacteri门占主导地位,其余依次是Firmicutes,Actinobacteria,Bacteroidetes。在Proteobacteria门中,Gammaproteobacteria是第一大纲,其后是Betaproteobacteria纲。宿主5个发育时期共同拥有7个细菌属,包括Azomonas,Serratia,Pantoea,Serpens,Pseudomonas,Halomonas,Kushneria。整体上看,Gammaproteobacteria纲在宿主5个发育时期呈现增长趋势。优势菌属在5个发育期存在差异,分别为Delftia,Kushneria,Serratia,Pantoea,Erwinia。所有文库总共含2108个特异OTUs,共同拥有5个相同OTUs。花期OTUs数量最多,结种期内生细菌多样性降低。在宿主的5个发育时期中,土壤p H、月均温和土壤盐含量这3个环境因子组成的集合对其内生细菌群落变化具有显著影响。【结论】盐角草内生细菌群落多样性丰富,宿主发育期决定了内生细菌群落结构。     

东方肉座菌EU7-22纤维素内切酶Ⅰ的异源表达

[目的]实现东方肉座菌纤维素内切酶EGⅠ在毕赤酵母中的表达,获得重组EGⅠ。[方法]通过RT-PCR获得EGⅠ开放阅读框。将EGⅠ成熟肽和PHO1信号肽的DNA片段插入p PIC3. 5K后,重组表达载体电转化毕赤酵母。通过甲醇诱导表达和镍柱纯化获得EGⅠ。以羟甲基纤维素钠检测活性,以肽N-糖苷酶F分析N-糖基化,以SDSPAGE分析表达情况和糖基化修饰。[结果]获得EGⅠ分泌表达菌株,诱导96 h后上清液活性为0. 513±0. 002 U/m L,纯化后的EGⅠ活性为0. 558±0. 012 U/mg。SDS-PAGE表明EGⅠ分子量在100～180 k Da,远高于预测值47. 3k Da,经肽N-糖苷酶F处理后,降至63～75 k Da。[结论]实现了EGⅠ的分泌表达,获得活性为0. 558±0. 012 U/mg的糖基化重组EGⅠ。     

首次报道中国北方Fonsecaea monophora所致着色芽生菌病1例及其相关实验研究

目的首次报道中国北方1例由Fonsecaea monophora所致着色芽生菌病。方法患者男性,58岁,主因"右腕部皮损伴瘙痒8~9a"就诊。对皮损脓液直接镜检,皮损组织病理检查,真菌培养,并对培养获得菌株进行形态学,分子生物学鉴定等实验室研究。结果脓液直接镜检可见多个圆形、厚壁、棕色硬壳细胞,皮损组织病理表现为慢性肉芽肿样改变,并可见硬壳小体。真菌培养可见暗棕色,橄榄色至黑色菌落生长,生长速度较慢,镜下可见枝孢型和喙枝孢型产孢。ITS区序列分析鉴定为Fonsecaea monophora。依据临床及实验室检查确诊该例为Fonsecaea monophora所致的着色芽生菌病。口服伊曲康唑200mg,1次/d;特比萘芬250mg,1次/d。治疗3个月后,皮损消退痊愈。结论 Fonsecaea monophora感染也可见于我国北方地区的着色芽生菌病患者,而ITS区序列分析是该菌种鉴定的重要手段,伊曲康唑联合特比萘芬治疗本例患者显示较好疗效。     

几种花卉植物对污泥中铅的富集特征

土地利用是资源化利用城市污水厂污泥的有效途径。为了解污泥中重金属污染物在土壤、植物之间的迁移富集规律,选用8种园林用植物进行污泥混配土种植实验。结果表明,植物对污泥混配土土壤中铅的富集能力,以及铅在植物中各器官的富集系数均不同,且不同种类植物差别较大。植物根部对铅有较强的富集能力,其次是叶和茎。菊花对铅的富集能力较强。植物对土壤中铅的富集能力也受土壤铅含量和赋存形态影响。     

Ischemia deteriorates the spike encoding of rat cerebellar Purkinje cells by raising intracellular Ca2+

Ischemia-induced excitotoxicity at cerebellar Purkinje cells is presumably due to a persistent glutamate action. To the fact that they are more vulnerable to ischemia than other glutamate-innervated neurons, we studied whether additional mechanisms are present and whether cytoplasm Ca²⁺ plays a key role in their ischemic excitotoxicity. Ischemic changes in the excitability of Purkinje cells were measured by whole-cell recording in cerebellar slices of rats with less glutamate action. The role of cytoplasm Ca²⁺ was examined by two-photon cellular imaging and BAPTA infusion in Purkinje cells. Lowering perfusion rate to cerebellar slices deteriorated spike timing and raised spike capacity of Purkinje cells. These changes were associated with the reduction of spike refractory periods and threshold potentials, as well as the loss of their control to spike encoding. Ischemia-induced functional deterioration at Purkinje neurons was accompanied by cytoplasm Ca²⁺ rise and prevented by BAPTA infusion. Therefore, the ischemia destabilizes the spike encoding of Purkinje cells via raising cytoplasm Ca²⁺ without a need for glutamate, which subsequently causes their excitotoxic death.     

华北低丘山地不同退耕年限刺槐人工林土壤质量评价

以华北低丘山地退耕还林区的耕地、农田撂荒地、退耕10年刺槐林和退耕43年刺槐林为研究对象,采用土壤质量综合指数探讨退耕措施对土壤质量的影响.结果表明: 随着退耕年限的增加,退耕刺槐人工林土壤养分的表层富集作用显著,且0～5 cm土层土壤改良效果增强;与耕地相比,退耕刺槐人工林的土壤物理性状得到改善,养分含量增加,土壤微生物生物量显著提高.不同土地利用类型的土壤质量综合指数为退耕43年刺槐林(0.542)>退耕10年刺槐林(0.536)>撂荒地(0.499)>耕地(0.498),说明退耕地人工造林改善了华北低丘山地退耕地区的土壤质量.
     

兔脓毒性休克模型的建立

目的:建立相对稳定的兔脓毒性休克模型.方法:雄性新西兰大白兔20只,随机分为模型组和假手术组.麻醉后无菌操作下取中、下腹部正中切口,找出盲肠,距盲肠末端8.0cm处4号丝线结扎盲肠和相应血管;于盲肠游离末端避开血管戳孔2次,孔径0.5cm;将盲肠原位放回腹腔,缝合腹壁切口;腹腔内注射30ml/kg温生理盐水.假手术组只探查腹腔.术后每隔3小时监测肛温.颈动脉插管有创动脉压监测确定模型成功后送血培养、血气、血乳酸,监测4小时后处死动物,送腹水培养,取右肺中叶测定肺含水量,取心、肝、脾、肺、肾、肠常规切片HE染色.结果:制模成功时间为:(18.91±1.384)小时;模型平均动脉压MAP(95.00±10.817 vs 52.38±15.565,P＜0.05);血气:PH(7.40±0.047 vs 7.09±0.146,P＜0.01),PCO2(30.0±5.831 vs 19.80±4.104,P＜0.01),BE(-6.46±4.931 vs -24.11±4.276,P＜0.01),HCO3-(18.45±4.367 vs 5.73±2.422,P＜0.01);血乳酸(2.53±1.108 vs 7.85±5.834,P＜0.05);血培养(7/10)阳性:大肠埃希菌;腹水培养(10/10)阳性:大肠埃希菌及阴沟肠杆菌;肛温于术后呈先上升后下降,假手术组肛温较模型组差异有显著性(39.63±0.492 vs 36.82±0.999,P＜0.01);成模后肛温与平均动脉压呈正相关关系,r=0.748.P=0.013,方程:y(平均动脉压)=34.46x+0.45;肺干湿比及肺含水量无明显差异[(0.22±0.014 vs 0.19±0.288,P＞0.05),(78.17±1.375 vs 80.58±2.878,P＞0.05)].常规HE染色可见明显病理学改变.结论:本模型可模拟多微生物感染致脓毒性休克模型,模型相对稳定,可用于兔种属.     

黑果枸杞花青素结构差异对其稳定性及细胞抗氧化活性的影响

本文研究了黑果枸杞花青素化合物结构对其稳定性和细胞抗氧化活性的影响。通过半制备型HPLC分离纯化得到了4种黑果枸杞花青素化合物并鉴定结构,利用比色法评价了化合物的稳定性、细胞毒实验以及H₂O₂诱导的SH-SY5Y细胞损伤模型评价了细胞抗氧化活性,并讨论了化学结构对其影响。结果表明反式结构比顺式结构在中性和弱碱性条件下有更好的稳定性,反式结构、糖基的增加以及母核B环上的甲氧基取代均可以通过缩短母核与糖链的分子距离从而提高稳定性,糖基的增加能显著地降低损伤细胞中的乳酸脱氢酶水平,且反式结构较顺式结构更有活性优势。综上所述,黑果枸杞花青素的结构影响稳定性和细胞抗氧化活性,但糖基的增加和酰基的反式异构对二者有更积极的意义。     

4019例妇科门诊不同症状患者阴道微生态状况分析

目的探讨妇科门诊不同症状患者的阴道微生态状况。方法回顾性分析2011年11月至2012年9月西安交通大学医学院第一附属医院妇科门诊因不同症状就诊患者的阴道微生态评价（菌群的密集度、多样性、优势菌、病原菌、AV评分、Nugent评分及五项菌群功能及炎症反应指标）检测结果。结果4019例被检查者平均年龄为33．56岁。其中阴道微生态正常占n70％（28／4019）;阴道微生态失调者占99．30％（3991／4019）;后者包括未明确感染的阴道微生态失调患者占66．36％（2667／4019）;明确感染的阴道微生态失调患者占32．94％（1324／4019）;其中外阴阴道假丝酵母菌病（vulvovaginal candidiasis,VVC）患者占24．33％（978／4019）;需氧菌陛阴道炎（aerobic vaginitis,AV）患者占3．11％（125／4019）;细菌性阴道病（bacterial vaginosis,BV）患者占3．14％（126／4019）;滴虫阴道炎（trichomonas vaginitis,TV）患者占5．15％（207／4019）;混合感染患者占8．31％（110／1324）。优势菌群异常患者占54．32％（2183／4019）。结论妇科门诊中未明确感染的阴道微生态失调患者构成比最高;在明确感染的患者中外阴阴道假丝酵母菌病构成比最高;因此阴道微生态评价成为阴道感染性疾病诊断首选检测方法,在临床诊疗实践中具有重要意义。