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应用定点突变与分子模建方法研究蛋白酶抑制剂eglin C突变体对蛋白酶furin和kexin的抑制活力 总被引:2,自引:0,他引:2
蛋白质前体加工酶参与许多重要蛋白质闪体的加工成熟过程,哺乳动物来源的furin和酵母中的kexin是该家族的重要成员。首先人工合成了编码枯草杆菌蛋白酶抑制剂eglin C的基因片段,组装后在大肠杆菌中得到表达。以定点突变方法在野生型eglin C抑制活性中心的P1、P2和P4位引入碱性氨基酸残基可以将其改造为很强的furin抑制剂(Ki约10^-9mol/L),和kexin抑制剂(Ki约10^-11mol/L)。同时根据枯草杆菌蛋白酶和eglin C复合物的晶体结构,计算机同源模建了前体加工酶与eglin C突变体结构之间的相互作用,并结合实验数据得到以下结果:(1)P1位引入的碱性残基是该抑制剂活力的前提;(2)P4位碱性残基的引入可以极大地提高抑制剂活力约两个数量级;(3)P2 的碱性残基将有效提高抑制剂的活力。然而同时可以破坏抑制剂本身的稳定性。(4)野生型P3位的疏水性残基参与抑制剂活性环附近疏水核心的构成。 相似文献
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目的建立一种快速的红色毛癣菌分子生物学鉴定方法。方法根据红色毛癣菌保守区域-真菌核糖体DNA(rDNA)的转录间隔区(ITS)设计特异性引物,采用上游:ITS19865'GAC ACC AAG AAA AAA TTC TCT GAA GA3',下游:ITS24415'GTC CTG AGG GCG CTG AA3'为引物对45株红色毛癣菌、5株须癣毛癣菌和1株紫色毛癣菌菌株的DNA进行PCR扩增,观察产物电泳带型的差异。结果 45株红色毛癣菌均能扩增出目的片段,5株须癣毛癣菌和1株紫色毛癣菌均无目的片段扩增出。结论红色毛癣菌可用特异引物PCR方法快速鉴定。 相似文献
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对六种灵猫科物种线粒体12 S rRNA基因及其中四种的Cytb基因部分序列进行了测定,并从Gen-Bank获得斑林狸(Prionodon pardicolor)、熊狸(Arctictis binturong)的Cytb基因同源序列。两基因整合序列比对后长755 bp,12 S rRNA基因序列中有70个变异位点,31个简约信息位点,在Cytb基因序列中,共有120个位点呈现变异,60个简约信息位点,Cytb基因的碱基变异百分比高于12 S rRNA基因的碱基变异百分比。使用邻接法(NJ)、最大似然法(ML)重建的分子系统树显示:斑林狸从灵猫亚科中分离出来,支持灵猫亚科的多系起源,而且斑林狸可能是中国起源最早且最特化的灵猫科动物。另外,同属于灵猫亚科的大灵猫(Viverra zibe-tha)、小灵猫(Viverricula indica)聚为一支,同属于棕榈狸亚科的果子狸(Viverricula indica)、熊狸聚为姐妹群,这些与传统形态学分类观点一致。 相似文献
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Ruan SQ Wang ZH Wang SW Fu ZX Xu KL Li DB Zhang SZ 《Biochemical and biophysical research communications》2012,420(2):385-390
Estrogen receptor (ER)-negative breast cancer cells are probably more aggressive with larger metastatic potential than ER-positive cells. Loss of ER in recurrent breast cancer is associated with poor response to endocrine therapy. G protein-coupled receptor 30 (GPR30) is expressed in half of ER-negative breast cancers. Tumor cell-derived heregulin-β1 (HRG-β1) is also found mainly in ER-negative cancer. In SkBr3 breast cancer cells that lack ER but express GPR30, HRG-β1 upregulates mRNA and protein levels of GPR30 by promoting ErbB2-ErbB3 heterodimerization and activating the downstream MAPK-ERK signaling pathway. Moreover, GPR30 boosts HRG-β1-induced migration and invasion of SkBr3 cells after combinative treatment with E2, 4-hydroxy-tamoxifen or the specific GPR30 agonist G-1, which are blocked by the specific GPR30 antagonist G-15 or the transfection with the small interfering RNA for GPR30. The ErbB2 inhibitor AG825 and the MEK1/2 inhibitor U0126 also partly inhibit the enhanced migration and invasion. Therefore, HRG-β1-induced migration and invasion partly depend on the upregulation of GPR30 expression through activation of the ErbB2-ERK pathway in SkBr3 cells. The results of this study indicate that the crosstalk between GPR30 and HRGs signaling is important for endocrine therapy resistance and may provide a new therapeutic way to treat breast cancer. 相似文献
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