基于易错PCR技术的黏质沙雷氏菌脂肪酶基因LipA的定向进化

利用易错PCR技术对黏质沙雷氏菌脂肪酶基因LipA进行定向进化,经过筛选最终获得一个比活力比野生酶提高了425 U/mg的突变体ep1,测序分析ep1有5个氨基酸发生了突变,与野生酶相比ep1的最适pH值由原来的8.5降低为7.5,Tm值提高3℃,Km值由原来的40 mg/mL降低为12.5 mg/mL.对其三维结构进行分析,推测酶学性质的改变可能与处在活性中心右前方双螺旋发卡结构上的158A、和处在下部β卷曲折叠拐角处的S375G的突变有关.     

低背景、高分辨率PAGE简易银染法

聚丙烯酰胺凝胶电泳银染一直存在耗时长、步骤繁琐等缺陷, 是其批量应用的瓶颈。文章报道了一种低背景、高分辨率的PAGE简易银染方法, 该法在降低NaOH浓度和批量显带方面进行了有益的探索, 建立了节省时间、节约试材, 对批量显带尤为实用的简易银染法。     

酪氨酸激酶EphB2受体N端球状结构域的表达及纯化

根据酪氨酸激酶ＥｐｈＢ２受体的碱基序列,用ＰＣＲ方法扩增其结合配体的关键结构域Ｎ端球状区,定向克隆到融合表达质粒载体ｒＲＳＥＴ Ａ中,转化大肠杆菌ＪＭ１０９（ＤＥ３）。阳性克隆经ＩＰＴＧ诱导,由Ｔ７启动子调控表达了氨基端带６个连续组氨酸残基的融合蛋白。电泳分析表明,表达的融合蛋白主要以包含体的形式存在,约占细菌总蛋白的１４％。Ｗｅｓｔｅｒｎ印迹确证,利用Ｎｉ－ＮＴＡ金属螯合亲和色谱法在变性条件下对     

中度嗜盐菌Martelella sp. AD-3 降解菲过程中水杨酸-5-羟化酶的酶学性质

[目的]研究中度嗜盐菌Martelella sp.AD-3在降解菲过程中水杨酸-5-羟化酶的活性与菲降解效率的关系及其酶学性质.[方法]通过HPLC分析菲的降解效率和AD-3菌粗酶液催化水杨酸的产物,根据NADH在340 nm处的吸光度变化计算水杨酸-5-羟化酶的活性.[结果]水杨酸-5-羟化酶是一种诱导酶,在AD-3菌的对数生长期和稳定初期时活性较高,酶活力大小与该菌对菲的降解速率基本一致.在菲浓度为200 mg/L、生长盐度为3％、pH为9.0的培养条件下,AD-3菌株表达的水杨酸-5-羟化酶的活力最高,为132.8 nmol/(min·mg).水杨酸-5-羟化酶催化水杨酸降解时的最适温度、pH和盐度分别为30℃、7.5和3％,酶的最大反应速率为200 nmol/(min· mg)、米氏常数Km为8.7μmol/L.[结论]AD-3菌在降解菲的过程中表达水杨酸-5-羟化酶,该酶的活性与菲降解速率具有相关性.     

水圈微生物专栏序言

<正>国家自然科学基金委员会于2017年启动了“水圈微生物驱动地球元素循环的机制”重大研究计划(简称“水圈微生物”计划)。“水圈微生物”计划聚焦典型水圈生境,通过多学科交叉研究,借助新技术、新方法,揭示水圈微生物在物种、群落和生态水平驱动碳氮硫循环的机制及其环境响应,认识水圈微生物在元素地球生物化学循环中的宏观生态作用,为应对全球变化、保护水圈生态服务功能、实施双碳战略、     

记山西榆社晚新生代鹿科化石两新种

本文记述了山西榆社盆地晚新生代鹿科化石中的两个新种:Eucladoceros proboulei sp.nov.和Procapreolus jinensis sp.nov.,并列出了已鉴定完毕的所有产于榆社盆地晚新生代地层的鹿类动物化石单.     

理性设计盐桥构建伯克霍尔德菌脂肪酶热稳定突变体

【目的】借助蛋白质工程技术提高伯克霍尔德菌ZYB002脂肪酶LipA的热稳定性,以期更好地将其应用于工业生产中。【方法】利用YASARA、Fold X、Rosetta、Gromacs等生物信息学软件,构建1个脂肪酶Lip A的热稳定性提高的微型突变体电子文库;通过对突变体的结构信息和自由能变化进行评估,筛选出潜在的有价值的突变体。继而利用基因定点突变技术,构建上述候选突变体的突变基因文库,通过实验筛选出热稳定性提高的脂肪酶LipA突变体。【结果】利用上述方法,从构建的20个脂肪酶LipA突变体中,筛选到热稳定性有显著提高的3个突变体LipA-Asn~(125)Asp、LipA-Asn~(125)Glu和LipA-Gln~(262)Glu。经55°C处理12 min后,上述3个突变体的T1250值较野生型分别提高4.0°C、5.5°C和4.4°C;在55°C下的半衰期较野生型分别提高了2.2倍、3.8倍和2.6倍。【结论】利用生物信息学软件,构建脂肪酶LipA突变体电子文库,结合蛋白质的结构信息,可以快速筛选到热稳定性提高的脂肪酶LipA突变体。     

微小RNA与肺癌耐药

肺癌细胞对化疗药物产生耐药性是目前肺癌化疗过程中遇到的主要问题。微小RNA（miRNA）是一类内源性非编码短链小分子RNA,它能调节细胞生长、凋亡和信号转导。miRNA的多态性与药物代谢和耐药形成密切相关,异常表达的miRNA对预测肺癌化疗药物敏感性有重要作用。调节特异miRNA的表达,将为克服肺癌耐药和选择个体化治疗开辟新的途径。     

Invasive alien plant species in China: regional distribution patterns

Plant invasions have been attracting increasing attention from ecologists because of their worldwide environmental impacts and huge economic costs. Research on the characteristics of the recipient regions is essential for understanding the process of plant invasion. However, few previous studies on invasibility of habitats include social factors, although human activities are critical in the process of plant invasion. China is a vast country with high plant species diversity and a long history of introduction of exotic plant species and is particularly vulnerable to invasive plant species. Alien plant species are widespread in the country. Therefore, the study of invasive plants in China is urgent in practice and theoretically important for developing invasion ecology. For the present study, 126 species were selected to represent the major invasive plant species in China. We then collected data on their species richness in 31 provincial administrative units of China and performed Spearman rank correlations between species richness and possible natural and socio‐economic factors. We found that socio‐economic factors, such as human density and GDP, correlated positively with the species richness of invasive plants in China. In conjunction with the natural and socio‐economic correlations in the study of regional distribution pattern of the major invasive plants, we discussed the factors influencing the regional distribution pattern of the major invasive plants in China. We suggest that native plant species richness was mainly determined by the natural conditions of the regions, while invasive species richness was influenced by natural conditions and human disturbance together.     

广西邦亮长臂猿自然保护区的鸟类

摘要：于2006年5月及2010年的1月、5月和9～ 10月,采用样线法和定点观察法,结合雾网法对邦亮自然保护区鸟类资源进行了调查。共记录到鸟类223种,隶属于14目49科,其中留鸟146种、夏候鸟40种、冬候鸟34种、旅鸟3种。区系分析表明,保护区鸟类具有典型的华南区区系特点和显著的北热带特征。保护区有国家Ⅱ级重点保...