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Zhou Y Drummond DC Zou H Hayes ME Adams GP Kirpotin DB Marks JD 《Journal of molecular biology》2007,371(4):934-947
To determine the importance of single-chain Fv (scFv) affinity on binding, uptake, and cytotoxicity of tumor-targeting nanoparticles, the affinity of the epidermal growth factor receptor (EGFR) scFv antibody C10 was increased using molecular evolution and yeast display. A library containing scFv mutants was created by error-prone PCR, displayed on the surface of yeast, and higher affinity clones selected by fluorescence activated cell sorting. Ten mutant scFv were identified that had a 3-18-fold improvement in affinity (KD=15-88 nM) for EGFR-expressing A431 tumor cells compared to C10 scFv (KD=264 nM). By combining mutations, higher affinity scFv were generated with KD ranging from 0.9 nM to 10 nM. The highest affinity scFv had a 280-fold higher affinity compared to that of the parental C10 scFv. Immunoliposome nanoparticles (ILs) were prepared using EGFR scFv with a 280-fold range of affinities, and their binding and uptake into EGFR-expressing tumor cells was quantified. At scFv densities greater than 148 scFv/IL, there was no effect of scFv affinity on IL binding and uptake into tumor cells, or on cytotoxicity. At lower scFv densities, there was less uptake and binding for ILs constructed from the very low affinity C10 scFv. The results show the importance of antibody fragment density on nanoparticle uptake, and suggest that engineering ultrahigh affinity scFv may be unnecessary for optimal nanoparticle targeting. 相似文献
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森林生态系统的水源涵养功能及其计量方法 总被引:27,自引:0,他引:27
为全面认识与正确评价森林生态系统的水源涵养功能,本文探讨了其概念、表现形式及其计量方法,认为:1)森林的水源涵养功能是一个动态、综合的概念,随着人们对森林水文作用认识的不断深入,其内涵不断丰富扩大,因此森林的水源涵养功能概念存在狭义和广义之分;2)森林的水源涵养功能(广义)有多种表现形式,包括拦蓄降水、调节径流、影响降雨和净化水质等,不过其具体表现形式与研究对象、研究目的以及研究尺度有关;3)目前森林拦蓄降水功能的计量方法主要有土壤蓄水能力法、水量平衡法、年径流量法和多因子回归法等8种,不过这些方法都存在一定的局限性,实际应用中需要综合考虑。 相似文献
965.
Aspergillus flavus genomics: gateway to human and animal health, food safety, and crop resistance to diseases 总被引:2,自引:0,他引:2
Aspergillus flavus is an imperfect filamentous fungus that is an opportunistic pathogen causing invasive and non-invasive aspergillosis in humans, animals, and insects. It also causes allergic reactions in humans. A. flavus infects agricultural crops and stored grains and produces the most toxic and potent carcinogic metabolites such as aflatoxins and other mycotoxins. Breakthroughs in A. flavus genomics may lead to improvement in human health, food safety, and agricultural economy. The availability of A. flavus genomic data marks a new era in research for fungal biology, medical mycology, agricultural ecology, pathogenicity, mycotoxin biosynthesis, and evolution. The availability of whole genome microarrays has equipped scientists with a new powerful tool for studying gene expression under specific conditions. They can be used to identify genes responsible for mycotoxin biosynthesis and for fungal infection in humans, animals and plants. A. flavus genomics is expected to advance the development of therapeutic drugs and to provide information for devising strategies in controlling diseases of humans and other animals. Further, it will provide vital clues for engineering commercial crops resistant to fungal infection by incorporating antifungal genes that may prevent aflatoxin contamination of agricultural harvest. 相似文献
966.
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Friemann R Ivkovic-Jensen MM Lessner DJ Yu CL Gibson DT Parales RE Eklund H Ramaswamy S 《Journal of molecular biology》2005,348(5):1139-1151
Nitroaromatic compounds are used extensively in many industrial processes and have been released into the environment where they are considered environmental pollutants. Nitroaromatic compounds, in general, are resistant to oxidative attack due to the electron-withdrawing nature of the nitro groups and the stability of the benzene ring. However, the bacterium Comamonas sp. strain JS765 can grow with nitrobenzene as a sole source of carbon, nitrogen and energy. Biodegradation is initiated by the nitrobenzene dioxygenase (NBDO) system. We have determined the structure of NBDO, which has a hetero-hexameric structure similar to that of several other Rieske non-heme iron dioxygenases. The catalytic subunit contains a Rieske iron-sulfur center and an active-site mononuclear iron atom. The structures of complexes with substrates nitrobenzene and 3-nitrotoluene reveal the structural basis for its activity with nitroarenes. The substrate pocket contains an asparagine residue that forms a hydrogen bond to the nitro-group of the substrate, and orients the substrate in relation to the active-site mononuclear iron atom, positioning the molecule for oxidation at the nitro-substituted carbon. 相似文献
968.
大渡河上游不同林龄云杉人工林与原始林下地表苔藓层片结构与物种组成 总被引:1,自引:1,他引:1
为评估在人工林早期发育过程中地表苔藓层片物种组成和结构的演变趋势, 选择四川省金川县507林场4–30年林龄的5块云杉(Picea asperata)人工林和1块300年岷江冷杉(Abies faxoniana)原始林, 开展了地表苔藓植物调查。采用方差分析法(ANOVA)对苔藓植物特征参数进行差异性检验, 采用Sørensen群落相似性系数比较了苔藓群落β多样性差异。结果表明: (1)云杉人工林较原始林地表苔藓物种丰富度高。年轻的人工林(<16年)较中龄林(21–30年)地表有更多的苔藓种类; (2)原始林较人工林有更高的地表苔藓植物盖度、密度、平均高度和厚度, 而不同林龄的人工林之间在苔藓植物层片盖度和密度上并没有表现出统计学意义上的差异(P>0.05), 但地表苔藓优势种及次优势种组成具有较明显的差异; (3)人工林与原始林地表苔藓共有种具有明显的喜光耐旱特性, 4年生未成林地段与原始林共有种数最多, 为19种; (4)原始林下地表24种苔藓植物中, 除Rhytidium rugosum外, 23种在云杉人工林早期发育过程中存在。在人工林发育过程中地表苔藓物种替代明显, 替代率随林龄呈增加趋势(0.24–0.60), 有明显的物种替代现象发生。综合分析表明: (1) 本文所研究的4–30年的云杉人工林发育过程中地表苔藓结构与多样性并没有表现出预期的恢复趋势, 大多数土著苔藓种群还未能有效恢复; (2)要恢复重建林地后演替阶段的苔藓种群结构和多样性, 不仅需要在采伐和造林过程中减少对土壤的扰动以保护地表微生境, 还应在云杉人工林处于16–20年林龄, 地表苔藓植物丰富度发生显著衰退时进行合理疏伐。 相似文献
969.
寒温针叶林土壤呼吸作用的时空特征 总被引:2,自引:0,他引:2
利用Li-6400便携式CO2分析系统对寒温针叶林土壤呼吸作用观测数据分析表明,土壤呼吸作用日、季动态均呈单峰型变化,日最大值出现在16:00左右,与5 cm土壤温度日动态相似,滞后于气温日动态变化;月最大值出现在8月份,2006年和2007年分别为8.19 和6.89 μmol CO2 m-2 s-1。日、季土壤呼吸作用与土壤温度的相关性均好于气温。土壤呼吸作用存在较大的空间变异性,一天内3:00 am、7:00 am和11:00 am的土壤呼吸作用变异系数分别为35.5%、27.6%和23.0%,根系和凋落物与土壤呼吸作用表现出相似的空间变异性,其中细根与土壤呼吸作用的相关性最好。 相似文献
970.