建立胃癌实验动物模型方法的研究

目的通过对人低分化胃癌细胞系SGC-7901状态和接种细胞数目的研究,建立良好的皮下接种胃癌的动物模型。方法采用腹腔注射SGC-7901细胞,使裸鼠形成腹水;光镜及电镜观察细胞状态;将购买的SGC-7901细胞以及形成腹水后的肿瘤细胞分别以1×108、1×107和1×106个进行裸鼠皮下接种,每组接种5只。观察其肿瘤形成时间、大小、状态及病理学变化。结果SGC-7901细胞接种裸鼠形成腹水后进行培养的肿瘤细胞增殖状态发生改变;购买的SGC-7901细胞以1×108及1×107接种裸鼠,在第21天肿瘤组织中央均出现出血和坏死;1×106的裸鼠第21天未见肉眼可见的肿瘤形成。腹水培养的肿瘤细胞,接种1×108的裸鼠在第21天肿瘤组织中央可见大面积的出血和坏死;接种1×107及1×106的裸鼠在第21天均未见出血和坏死,接种1×107的肿瘤组织体积较大。结论SGC-7901细胞接种裸鼠形成腹水后的细胞,更容易建立SGC-7901细胞皮下接种的胃癌动物模型,其中以接种细胞数为1×107的肿瘤生长较好,更适用于胃癌的实验研究。     

Neighborhood Regularized Logistic Matrix Factorization for Drug-Target Interaction Prediction

In pharmaceutical sciences, a crucial step of the drug discovery process is the identification of drug-target interactions. However, only a small portion of the drug-target interactions have been experimentally validated, as the experimental validation is laborious and costly. To improve the drug discovery efficiency, there is a great need for the development of accurate computational approaches that can predict potential drug-target interactions to direct the experimental verification. In this paper, we propose a novel drug-target interaction prediction algorithm, namely neighborhood regularized logistic matrix factorization (NRLMF). Specifically, the proposed NRLMF method focuses on modeling the probability that a drug would interact with a target by logistic matrix factorization, where the properties of drugs and targets are represented by drug-specific and target-specific latent vectors, respectively. Moreover, NRLMF assigns higher importance levels to positive observations (i.e., the observed interacting drug-target pairs) than negative observations (i.e., the unknown pairs). Because the positive observations are already experimentally verified, they are usually more trustworthy. Furthermore, the local structure of the drug-target interaction data has also been exploited via neighborhood regularization to achieve better prediction accuracy. We conducted extensive experiments over four benchmark datasets, and NRLMF demonstrated its effectiveness compared with five state-of-the-art approaches.     

青鳉prdm14的原核表达、多克隆抗体制备及其应用

青鳉(Oryzias latipes)是研究遗传发育和细胞多能性的重要模式鱼类, 为探究prdm14同源基因的潜在作用, 实验将青鳉prmd14经原核表达后制备了兔抗Prdm14多克隆抗体。首先, 将prdm14基因的部分编码区连接到pET32a质粒中, 构建重组表达载体pET32a-prdm14?600。随后将重组载体转化至大肠杆菌(Escherichia coli)Rosetta(DE3), 经异丙基-β-d-硫代半乳糖苷(Isopropyl-β-d-thiogalactoside, IPTG)诱导表达, 获得分子量为60 kD的Prdm14重组蛋白。接着大量诱导蛋白表达并切胶纯化, 免疫家兔(Oryctolagus cuniculus), 6周后获得阳性抗体, 最后通过ELISA和Western blot检测抗体效价及其特异性。结果显示, 在37℃、0.6 mmol/L IPTG、诱导3h的条件下, 可获得Prdm14重组蛋白的高效表达; 制备的兔抗青鳉Prdm14多克隆抗体能够特异性识别青鳉组织中表达的Prdm14蛋白以及在HepG2细胞中过表达的青鳉Prdm14: EGFP融合蛋白。综上所述, 研究首次制备了一种能有效识别青鳉Prdm14的多克隆抗体, 该抗体的获得为后续研究prdm14基因在鱼类多能性干细胞中的作用提供了有力工具。     

Crystal structure determination of a neutral neurotoxin BmK M4 from Buthus martensii Karsch at 0.20 nm

BmK M4 is a neutral neurotoxin in the BmK toxin series.It is medially toxic and belongs to group III α-toxins.The purified sample was crystallized in rhombic space group P61.Using an X-ray diffraction technique,the crystal structure of BmK M4 was revealed by molecular replacement at 0.20 nm resolution.The model was refined.The final crystallographic R factor was 0.142 and the free R factor was 0.173.The root mean square deviation is 0.001 5 nm for the bond length and 1.753°for the bond angles.64 water molecules were added to the asymmetric unit.The refined structure showed an unusual non-prolyl cis peptide bond at residue 10.The structure was compared with group II α-toxin BmK M8 (an acidic,weak toxin).The potential structural implications of the cis peptide bond were discussed.     

肌肽对低氧所致大鼠血管内皮细胞损伤的保护作用

目的：研究肌肽对低氧所致大鼠血管内皮细胞损伤的影响。方法：建立低氧条件下大鼠血管内皮细胞损伤模型,用MTT法观察肌肽对低氧损伤的血管内皮细胞活性的影响,测定细胞培养基中LDH活力,并对细胞骨架进行考马斯亮蓝R-250染色观测其细胞结构。结果：浓度为10mmol/L～20mmol/L肌肽孵育血管内皮细胞6h后,可以抑制缺氧12h和24h引起的血管内皮细胞活性下降,同时减少LDH的释放,保持细胞骨架完整。结论：肌肽对低氧所致的血管内皮细胞损伤具有保护作用。     

来源卤化二型聚酮类生物合成基因簇的两种关键功能基因鉴定与表达

为催化卤化产物,挖掘具有生物活性的新卤化物提供新的方法途径,拟构建卤化酶原核表达载体催化天然卤化物的卤化过程.对链霉菌Streptomyces sp.FJS31-2基因组中一个II型PKS类产物zunyimycin生物合成基因簇进行系列分析,针对其中的后修饰酶卤化酶基因和单加氧酶基因进行原核表达纯化.通过分子生物学手段...     

温带针阔混交林土壤碳氮气体通量的主控因子与耦合关系

中高纬度森林地区由于气候条件变化剧烈,土壤温室气体排放量的估算存在很大的不确定性,并且不同碳氮气体通量的主控因子与耦合关系尚不明确。以长白山温带针阔混交林为研究对象,采用静态箱-气相色谱法连续4a(2005—2009年)测定土壤二氧化碳(CO2)、甲烷(CH4)和氧化亚氮(N2O)净交换通量以及温度、水分等相关环境因子。研究结果表明:温带针阔混交林土壤整体上表现为CO2和N2O的排放源和CH4的吸收汇。土壤CH4、CO2和N2O通量的年均值分别为-1.3 kg CH4hm-2a-1、15102.2 kg CO2hm-2a-1和6.13 kg N2O hm-2a-1。土壤CO2通量呈现明显的季节性规律,主要受土壤温度的影响,水分次之;土壤CH4通量的季节变化不明显,与土壤水分显著正相关;土壤N2O通量季节变化与土壤CO2通量相似,与土壤水分、温度显著正相关。土壤CO2通量和CH4通量不存在任何类型的耦合关系,与N2O通量也不存在耦合关系;土壤CH4和N2O通量之间表现为消长型耦合关系。这项研究显示温带针阔混交林土壤碳氮气体通量主要受环境因子驱动,不同气体通量产生与消耗之间存在复杂的耦合关系,下一步研究需要深入探讨环境变化对其耦合关系的影响以及内在的生物驱动机制。     

生态足迹方法及研究进展

本文介绍了生态足迹的计算方法,回顾了国内外的研究进展,重点介绍了生态足迹计算中能源足迹算法的研究进展。目前,国外对生态足迹的研究集中在对长时间序列计算分析和计算方法的改进上,提出了改进的生态足迹方法“实际土地需求”法;国内研究还多限于生态足迹实例计算分析。探讨了生态足迹方法的优缺点,同时就生态足迹今后的研究重点提出一些看法和展望。     

靶向M细胞的抗原递送¾¾增强黏膜免疫应答的关键策略

黏膜是阻止病原入侵的第一道防线,黏膜免疫系统在抵抗感染方面起着至关重要的作用。通过黏膜途径接种疫苗可以同时诱导黏膜和全身免疫反应,因此,理论上针对黏膜的免疫策略是最合理和有效的。但黏膜免疫系统的复杂性和屏障作用造成抗原诱导的免疫应答水平低下,制约了黏膜疫苗的发展。M细胞(Microfoldcells)是黏膜免疫系统所独有的,其具有捕获腔内抗原和启动抗原特异性免疫应答的功能。M细胞摄取抗原的多少直接关系到黏膜疫苗的免疫效力,而利用M细胞配体可将抗原靶向递呈给M细胞,从而实现高效的黏膜免疫应答。靶向M细胞的抗原递送策略及其应用可以提高黏膜免疫应答水平,促进黏膜疫苗的研制。尽管如此,要成功研制安全高效的黏膜疫苗,今后依然有漫长的路要走,这可能有赖于进一步探究M细胞的特性和功能及黏膜免疫机制。