广州市城市化过程的景观动态格局及尺度效应

城市化过程直接改变了城市区域的景观结构,引起了景观格局的变化.该文以四期Landsat TM 遥感影像为数据源,运用景观格局指数分析了1990-2005 年广州市景观格局的动态变化特征,并利用空隙度指数对广州市景观格局的尺度效应进行了研究.研究结果表明:广州市在快速城市化的进程中,城市景观结构的变化主要表现为耕地、林地、草地等自然或半自然景观向城镇、农村居民点用地等人文景观转变;耕地大面积被城镇用地和工矿建设用地侵占,斑块数量增多,空隙度指数增大;城镇用地的空隙度指数一直呈现出下降的趋势,表明城镇用地景观中较小的斑块被合并,空间分布趋向集中.因此,综合运用景观格局指数和空间尺度分析,可以获得对城市景观动态过程较为全面的认识.     

4019例妇科门诊不同症状患者阴道微生态状况分析

目的探讨妇科门诊不同症状患者的阴道微生态状况。方法回顾性分析2011年11月至2012年9月西安交通大学医学院第一附属医院妇科门诊因不同症状就诊患者的阴道微生态评价（菌群的密集度、多样性、优势菌、病原菌、AV评分、Nugent评分及五项菌群功能及炎症反应指标）检测结果。结果4019例被检查者平均年龄为33．56岁。其中阴道微生态正常占n70％（28／4019）;阴道微生态失调者占99．30％（3991／4019）;后者包括未明确感染的阴道微生态失调患者占66．36％（2667／4019）;明确感染的阴道微生态失调患者占32．94％（1324／4019）;其中外阴阴道假丝酵母菌病（vulvovaginal candidiasis,VVC）患者占24．33％（978／4019）;需氧菌陛阴道炎（aerobic vaginitis,AV）患者占3．11％（125／4019）;细菌性阴道病（bacterial vaginosis,BV）患者占3．14％（126／4019）;滴虫阴道炎（trichomonas vaginitis,TV）患者占5．15％（207／4019）;混合感染患者占8．31％（110／1324）。优势菌群异常患者占54．32％（2183／4019）。结论妇科门诊中未明确感染的阴道微生态失调患者构成比最高;在明确感染的患者中外阴阴道假丝酵母菌病构成比最高;因此阴道微生态评价成为阴道感染性疾病诊断首选检测方法,在临床诊疗实践中具有重要意义。     

山羊品种间体细胞核移植研究

萨能奶山羊是著名的奶用山羊品种,波尔山羊则是世界著名的肉用山羊品种.为了研究波尔山羊体细胞在奶山羊卵母细胞中的去分化,我们将成年波尔山羊的颗粒细胞或耳皮肤成纤维细胞作为供核细胞(试验组),移入奶山羊中Ⅱ期的去核卵母细胞透明带下,经电融合和离子霉素与6-二甲基氨基嘌呤(6-DMAP)激活,直接移入同期发情奶山羊输卵管或经体内培养,将发育的重构胚移人同期发情羊子宫内.妊娠早期作B超诊断,确立妊娠的观察至足月.同时将奶山羊的35日龄胎儿成纤维细胞作供核细胞(对照组),按试验组同样方法处理,将重构胚直接移入同期发情的奶山羊输卵管内.结果试验组,波尔羊颗粒粒细胞与耳皮肤成纤维细胞的融合率分别为78.2%(115/147)、57.4%(116/202),重构胚卵裂率为85.8%(115/134),桑椹胚、囊胚的发育率38.8%(52/134),早期妊娠三头,分别于妊娠40、60、60日龄终止妊娠.对照组,融合率为89.5%(136/152),早期妊娠率为42.9%(6/14),四头受体足月分娩,产四头公羊羔,其中三头存活,一头分娩时死于肺不扩张,并体重过大,显示胎儿过大综合症.经基因型鉴定证实,这四头克隆羔羊均源于同一胎儿成纤维细胞系.以上结果表明,波尔羊体细胞核在奶山羊卵母细胞中能够去分化,并维持一定程度的发育.     

Autotoxic potential of cucurbit crops

Soil sickness is often observed in cucurbit crops such as Citrullus lanatus, Cucumis melo and Cucumis sativus, but not in cucurbit crops such as Cucurbita moschata, Lagenaria leucantha and Luffa cylindrica. Results showed that root aqueous extracts of Citrullus lanatus, Cucumis melo and Cucumis sativus were autotoxic, but those of Cucurbita moschata, Momordica charantia and Luffa cylindrica were less autotoxic to the radicle elongation of respective species. Plant growth of Citrullus lanatus, Cucumis melo and Cucumis sativus were greatly inhibited by autotoxic substances released from powered root tissue at a rate of 1 g per seedling. Root exudates of Citrullus lanatus, Cucumis melo and Cucumis sativus were autotoxic to radicle elongation and seedling growth of respective species. However, root exudates of Citrullus lanatus did not inhibit radicle elongation of Cucurbita ficifolia, which is commonly used as rootstock for the grafting of Citrullus lanatus, Cucumis melo and Cucumis sativus to decrease soil-borne diseases in commercial production. It seems possible to overcome autotoxicity in cucurbit crops by grafting on Cucurbita ficifolia. This revised version was published online in June 2006 with corrections to the Cover Date.     

串联质谱数据的从头解析与蛋白质的数据库搜索鉴定

蛋白质的鉴定是蛋白质组学研究中必不可少的一步。用串联质谱 (tandemmassspectrometry ,MS/MS)可以进行多肽的从头测序 (denovosequencing) ,并搜索数据库以鉴定蛋白质。用图论以及真实谱 理论谱联配 (alignment)的方法对串联质谱得到的多肽图谱进行从头解析 ,得到了可靠的多肽序列 ,并应用到数据库搜索中鉴定了相应的蛋白质。同时 ,还用统计的方法对SwissProt以及TrEMBL蛋白质数据库进行了详细的分析。结果表明 ,3个四肽或者 2个五肽或者 1个八肽一般可以唯一地确定一个蛋白质     

不同供氮水平的水稻叶尖的傅里叶转换红外光谱

四个氮素水平处理的盆栽水稻(Oryza sativa L.)的叶尖在不同生育期均表现出明显的傅里叶转换红外光谱差异.新定义的光谱指数((A3400-A1653)/(A3400+A1653),A为某频率处的吸收值)随着施氮水平的提高而降低.结果表明,傅里叶转换红外光谱可用于诊断植物的氮素状况.     

Novel adjuvant for immunization against tuberculosis: DNA vaccine expressing <Emphasis Type="Italic">Mycobacterium tuberculosis</Emphasis> antigen 85A and interleukin-15 fusion product elicits strong immune responses in mice

Objectives

To investigate the potential of interleukin (IL)-15 as a novel adjuvant for Mycobacterium tuberculosis (Mtb) antigen 85A (Ag85A) vaccine.

Results

C57BL/6 mice were intramuscularly immunized three times with a plasmid expressing the Ag85A-IL-15 fusion protein (pcDNA3.1-Ag85A-IL-15), with the empty pcDNA3.1 vector and the pcDNA3.1-Ag85A as control. Mice vaccinated with pcDNA3.1-Ag85A-IL-15 generated more secretory IgA (sIgA) into their lung (209 ± 21 μg/ml) and acquired an enhanced serum IgG response to Ag85A. IgG2a/IgG1 ratios were upregulated, natural killer cell activity was augmented and Ag85A-specific splenic T cell proliferation was enhanced in these mice as well. Vaccination with pcDNA3.1-Ag85A-IL-15 promoted the polarization of CD4⁺ T cells towards a Th1 type in the spleen, and significantly upregulated the serum level of interferon (IFN)-γ (458 ± 98 pg/ml), a typical Th1 cytokine. IFN-γ-expressing CD8⁺ cells were also increased in the spleen after pcDNA3.1-Ag85A-IL-15 immunization.

Conclusions

A superior immune type I response in mice vaccinated with plasmid Ag85A-IL-15 has been achieved.

     

广东省蝙蝠新纪录种——大墓蝠

1984年9月24日在广东连州采集到2只蝙蝠(1♀,1♂),体型大,头体长分别为92.0mm,85.0mm,前臂长73.2mm,73.0mm,颅全长24.68mm,23.97mm;尾端有少量长毛;脑颅比较狭窄。经与国内已采集的黑髯墓蝠Taphozous melanopogon标本及已报道的同类蝙蝠特征相比较,鉴定该蝙蝠标本为鞘尾蝠科的大墓蝠Taphozous theobaldi Dobson,1872,为广东省蝙蝠新纪录种。     

原钙粘蛋白基因簇调控区域中成簇的CTCF结合位点分析

哺乳动物中原钙粘蛋白(Protocadherin, Pcdh)基因簇包含50多个串联排列的基因,这些基因形成3个紧密相连的基因簇(Pcdhα、Pcdhβ和Pcdhγ),所编码的原钙粘蛋白质群在神经元多样性(Neuronal diversity)和单细胞特异性(Single cell identity)以及神经突触信号转导中发挥重要作用。前期的工作已证实转录因子CTCF(CCCTC-binding factor)与CTCF结合位点(CTCF-binding site, CBS)的方向性结合能够决定增强子和启动子环化的方向以及其远距离交互作用的特异性,并进一步在Pcdh基因座(Locus)形成两个(Pcdhα和Pcdhγ)染色质拓扑结构域(CTCF/cohesin- mediated chromatin domain, CCD),而且染色质拓扑结构域对于控制基因表达调控至关重要。本文通过生物信息学方法对比人类和小鼠序列,发现Pcdhβγ染色质拓扑结构域调控区域中的DNase I超敏位点(DNase I hypersensitive sites, HSs)较为保守。染色质免疫沉淀及大规模测序实验(Chromatin immunoprecipitation and massive parallel sequencing, ChIP-Seq)揭示CBS位点在Pcdhβγ调控区域中成簇分布并且具有相同的方向。凝胶电泳迁移实验(Electrophoresis mobility shift assay, EMSA)确定Pcdhβγ调控区域内具体的42 bp CBS位点并且发现一个CTCF峰包含两个CBS位点。在全基因组范围内,运用计算生物学方法分析CTCF和增强子、启动子等调控元件的关系,发现CBS位点在调控元件附近有较多分布,推测CTCF通过介导增强子和启动子的特异性交互作用,在细胞核三维基因组内形成活性转录枢纽调控基因精准表达。