药物重定位的计算分析方法

全新结构药物的研发存在周期长、耗资大、风险高的问题.通过各种技术预测已有药物的新适应症,即药物重定位,可以缩短药物研发时间、降低研发成本和风险.由于疾病种类和已知药物的数量繁多,完全通过实验筛选已知药物的新用途仍然具有很高的成本.随着组学和药物信息学数据的积累,药物重定位进入到了理性设计和实验筛选相结合的阶段,药物重定位的计算预测已经成为计算生物学和系统生物学的重要研究方向.本文将目前药物重定位计算分析的策略归纳为药物-靶标关系分析、药物-药物关系分析和药物-疾病关系分析,对已报道的技术方法及其成功应用实例进行了综述.     

Water bathing alters threat perception in starlings

The majority of bird taxa perform water bathing, but little is known about the adaptive value of this behaviour. If bathing is important for feather maintenance then birds that have not bathed should have poorer feather condition, compromised escape ability and therefore increased responsiveness to cues of predation. We conducted two experiments examining the behaviour of captive starlings responding to conspecific alarm calls. Birds that had no access to bathing water showed a decreased willingness to feed and increased their vigilance behaviour following an alarm call. We argue that birds denied access to bathing water interpreted an ambiguous cue of threat as requiring more caution than birds that had access, consistent with higher levels of anxiety. Our results support the provision of bathing water for captive birds as an important welfare measure.     

在家兔“孤立脑”制备上刺激颈迷走神经的致眠作用

在家兔半慢性“孤立脑”制备上刺激颈迷走神经,可诱发睡眠。这一诱发睡眠具有慢波睡眠的特点。定量分析的结果表明:在刺激期睡眠总量增加了34%;睡眠持续时间增加了106％;δ指数增加了89%。刺激减压神经或膈下迷走神经,则无诱发睡眠的作用,据此探讨了家兔迷走神经内具有诱发睡眠作用的传入纤维的起源。     

SARS冠状病毒实时荧光RT-PCR定量检测

为建立一种快速、准确、特异的SARS病毒RNA定量检测方法,根据复合探针荧光定量分析原理,对SARS病毒核酸进行实时荧光定量RT-PCR检测.借助计算机辅助,对SARS病毒基因靶序列以及检测引物和探针进行了优化筛选;利用体外转录SARS病毒RNA靶序列,对RT-PCR反应的镁离子浓度参数进行了优化;比较Trizol法、磁珠法、Qiagen法、煮沸法等4种方法提取RNA的检测效果,建立了样本处理方法;通过对构建的体外转录靶序列模型的检测,对本方法的灵敏度、特异性、定量线性关系、精确度等进行了评价,并通过对42例临床标本的检测对本方法的检测效果进行了评估. 通过克隆SARS病毒核酸靶序列并进行体外转录,获得了长度约1.2 kb的体外转录RNA靶序列;经优化,荧光RT-PCR反应液中的Mg²⁺浓度以4.0 mmol/L为最好;RNA提取方法采用磁珠法效果较好;本方法的检测灵敏度最低可达5个拷贝的体外转录RNA分子,特异性100%,C_t值的CV值小于5%.对临床确诊的42份SARS病人血清和漱口水标本的检测结果表明,该方法的检出率为79%,与荧光抗体检测法的符合率为70%.上述结果表明,该方法建立的荧光定量RT-PCR技术能够快速准确、特异、敏感地对SARS病毒核酸进行定量分析,为临床SARS冠状病毒RNA的检测提供了新的,更为有效的检测方法.     

绵羊生殖道抗菌肽

以屠宰场收集的新鲜、健康、雌性绵羊生殖器官为原材料．采用乙酸浸提、透析、Sephadex G-50凝胶过滤层析和反相高效液相色谱(RP-HPLC)等方法分离纯化绵羊生殖道抗菌肽．以G+、G-和真菌为抗菌活性检测指示菌株,利用薄层琼脂糖孔穴扩散法、微量肉汤稀释法进行抗菌活性检测．对分离纯化所得纯品进行分子质量质谱测定、纯度鉴定、N端测序,并对其性质进行研究．结果表明：分离纯化所得两个绵羊生殖道抗菌肽分子质量分别为4820.47 u和4012.5 u,N端部分氨基 酸序列分别为AYVLDEPKP和YDSGA．对G+细菌(S. aureus ATCC2592、Streptococcu ATCC55121)、G-细菌(E． coli ATCC25922)、真菌(C． albicans ATCC2002)均具有良好的抑菌活性．对家兔红细胞无溶血活性,对人血液凝固无影响．目前未见有从绵羊生殖道分离纯化得到抗菌肽的报道,并且这一研究结果进一步证实抗菌肽在多种动物生殖道天然免疫防御方面起着重要作用．     

中国野桑蚕线粒体基因组特征

中国野桑蚕（ChBm）线粒体全基因组序列为15688bp,由13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、24个tRNA基因和AT富集区构成,比家蚕和日本野桑蚕（JaBm）线粒体基因组多2个tRNA基因．除COI基因外（含有一个TTAG假想起始密码子）,所有蛋白编码基因含有典型的ATN起始密码子;13个蛋白编码基因中,有11个使用TAA作为终止密码子．除tRNA^Ser（TGA）-like具有四茎环结构外,其他的tRNA具有典型的三叶草结构．ChBm的AT富集区为484bp,短于JaBm和家蚕．系统发育分析表明,ChBm与家蚕的亲缘关系较近,与JaBm的亲缘关系较远．ChBm与家蚕的分化时间约在（1．08±0．18）～（1．41±0．24）百万年前,家蚕和JaBm的分化时间约在（1．53±0．20）～（2．01±0．26）百万年前,ChBm和JaBm的分化时间约在（1．11±0．16）～（1．45±0．21）百万年前．     

豫北黄河故道湿地岛类自然保护区鸟类区系调查

1997－1999年对豫北黄河故道湿地鸟类自然保护区的鸟类进行了调查,共记录鸟类119种,隶属16目37科,其中留鸟32种,占总数的26．89％,冬候鸟24种,占总数的20．17％,夏候鸟30种,占总数的25．21％,旅鸟占33种,占总数的27．73％,国家一级重点保护鸟类2种,二级重点保护鸟类19种,河南省重点保护的鸟类6种。     

Cost,competition and information in communication between relatives

Recent signalling models have shown that honest, cost-free communication between relatives can be stable. Moreover, cost-free signalling equilibria are in some cases more efficient than costly equilibria. However, we show that they are also relatively uninformative, particularly when relatedness between signaller and receiver is low. We explore the trade-off between signal cost and information, and further demonstrate that incorporating competition among signallers into a model of communication between relatives can reduce the propensity of any one signaller to display. As a result, there is a general increase in the amount of broadcast information in a non-costly signal with increasing competitor number.     

Toll样受体对肠道病毒71型基因组RNA的识别分析

目的分析Toll样受体(TLRs)对肠道病毒71型(EV71)基因组RNA的识别。方法用荧光定量RT-PCR方法检测与EV71基因组RNA作用24、48和72 h后人结肠癌SW620细胞的TLR3、TLR7和白细胞介素-6(IL-6)、IL-8、IL-12 m RNA表达。结果细胞的TLR3、TLR7 m RNA和IL-6、IL-12 m RNA在作用72 h后表达增加,IL-8 m RNA各时间点表达无变化。结论 TLR3、TLR7可与EV71基因组RNA识别,并诱导细胞因子IL-6、IL-12活化表达。