七氟烷对糖尿病心肌缺血/再灌注损伤的影响

糖尿病是一种常见病、多发病,严重威胁着人类的健康。现已明确,糖尿病是冠心病发病的一个重要因素。心肌缺血/再灌注(ischemia/reperfusion,I/R)损伤是临床常见的病理过程,同时是冠心病发病及心肌血运重建治疗过程中的核心环节,如何减轻I/R损伤一直是国际研究热点之一。糖尿病与I/R损伤对心肌都有损害作用,相关研究证明糖尿病能够进一步恶化I/R损伤对心肌的损伤作用。研究表明,缺血预处理(ischemia preconditioning,IPC)可以延缓或减轻心肌I/R损伤,同时,麻醉药预处理(anesthetic induced preconditioning,APC)也具有IPC样的心肌保护作用。其中,七氟烷作为现阶段临床较常用的吸入麻醉药,同样对心肌I/R损伤具有保护作用。本文就七氟烷对糖尿病心肌I/R损伤的影响及其机制做一综述。     

基于组合探针识别的大规模细菌分类16 S rRNA基因芯片设计

随着16 S rRNA序列资源的不断丰富,以及寡核苷酸微阵列基因芯片技术的不断进步,检测复杂微生物菌落中的微生物种群构成成为可能．现有的序列特异性探针设计算法缺乏足够的覆盖度、灵活性以及效率,不能满足大规模细菌检测基因芯片的设计要求．很多组特异性探针设计算法的思路多局限于针对某个目标序列组设计唯一的组特异性探针．在很多应用场合,设计单个探针检测组内所有目标序列的目标是很难达到的．因此,设计多个探针通过组合方式进行检测是很有必要的．每个探针能特异性地检测组内一部分目标序列,通过组合就能提高覆盖率．然而,在所有可能的探针组合中找到一个优化的探针组合是很耗时的．提出了一个可行的基于相对熵和遗传算法的组合探针设计算法．     

SARS-CoV-2污染的进口冷链产品导致的一起大连本土新冠疫情

2020年12月15日,大连市报告了4名码头冷链货物搬运工人SARS-CoV-2核酸检测呈阳性,在此之前,大连市已经连续136天没有报告本土病例.在这次大连COVID-19疫情(简称"大连新冠疫情")中,我们收集了2020年12月15日至2021年1月8日期间大连新冠疫情中全部感染者(83)及部分接触的轮船货物样本,其中确诊病例占61.45％(51/83),无症状感染者占38.55％(32/83).通过高通量测序,共获得76条SARS-CoV-2全基因组序列,其中72条(86.75％,72/83)来自临床样本,4条来自R国籍A货船上的冷链食品外包装样本.基因组分析数据显示,与武汉参考株(NC_045512)相比,76条全基因组分别存在12～16个核苷酸突变位点,共享12个核苷酸突变位点,符合B.1.1进化分支突变特征.结合病毒基因组学和现场流行病学调查结果综合分析表明,大连新冠疫情是一起由SARS-CoV-2污染的进口冷链产品感染码头工人导致的本土疫情,在传播过程中至少形成了3个病毒代际和3个相对独立的传播链.     

Preliminary genetic linkage maps of Chinese herb Dendrobium nobile and D. moniliforme

Dendrobium is an endangered genus in the orchid family with medicinal and horticultural value. Two preliminary genetic linkage maps were constructed using 90 F₁ progeny individuals derived from an interspecific cross between D. nobile and D. moniliforme (both, 2n?=?38), using random amplified polymorphic DNA (RAPD) and intersimple sequence repeat (ISSR). A total of 286 RAPD loci and 68 ISSR loci were identified and used for genetic linkage analysis. Maps were constructed by double pseudo-testcross mapping strategy using the software Mapmaker/EXP ver. 3.0, and Kosambi map distances were constructed using a LOD score ≥ 4 and a recombination threshold of 0.4. The resulting frame map of D. nobile was 1474 cM in total length with 116 loci distributed in 15 linkage groups; and the D. moniliforme linkage map had 117 loci placed in 16 linkage groups spanning 1326.5 cM. Both maps showed 76.91% and 73.59% genome coverage for D. nobile and D. moniliforme, respectively. These primary maps provide an important basis for genetic studies and further medicinal and horticultural traits mapping and marker-assisted selection in Dendrobium breeding programmes.     

Validation and dissection of quantitative trait loci for leaf traits in interval RM4923-RM402 on the short arm of rice chromosome 6

Validation and dissection of a QTL region for leaf traits in rice which has been reported in a number of independent studies were conducted. Three sets of near isogenic lines (NILs) were originated from a residual heterozygous line derived the indica cross Zhenshan 97B/Milyang 46. They were overlapping and totally covered a 4.2-Mb heterogenous region extending from RM4923 to RM402 on the short arm of rice chromosome 6. Each NIL set consisted of 10 maternal lines and 10 paternal lines. They were measured for the length, width, perimeter and area of the top three leaves and the number of spikelets per panicle, number of grains per panicle and grain weight per panicle. In NIL sets 6-4 and 6-7, differing in intervals RM4923-RM225 and RM19410-RM6119, respectively, significant variations with the enhancing alleles from the female parent ZS97 were shown for the length, perimeter and area except for the area of the third leaf from top in 6-4, but the effects were lower in 6-4 than in 6-7. No significant effects were detected for the three traits in the remaining NIL set. It was shown that flag leaf length (FLL) is the primary target of the QTLs detected. Two QTLs for FLL linked in repulsion phase were resolved, of which qFLL6.2 located in the 1.19-Mb interval RM3414-RM6917 had a major effect with the enhancing allele from Zhenshan 97B, and qFLL6.1 located in the 946.8-kb interval RM19350-RM19410 had a smaller effect with the enhancing allele from Milyang 46. The two QTLs also exerted pleiotropic effects on the yield traits.     

大连市两种来源的副溶血性弧菌分子分型

目的 分析食品来源、患者来源及2种来源的副溶血性弧菌之间的PFGE图谱的关系,从分子流行病学角度探讨2种来源的副溶血性弧菌的关联。 方法 收集患者和食品2种来源的副溶血性弧菌178株,经限制性内切酶SfiI酶切,用脉冲场凝胶电泳方法进行电泳,凝胶成像仪获得电泳图谱,利用BioNumerics软件对图谱进行聚类分析。 结果 食品来源的96株菌,有13株降解,83株菌被限制性内切酶SfiI酶切出83个PFGE types(PT),聚类分析发现各菌株间相似系数为55.6%～97.4%,按带型相似系数为85%标准划分为1~67共67个克隆群。患者来源的82株菌,有5株降解,77株菌被限制性内切酶SfiI酶切出46个PFGE types(PT),聚类分析发现各菌株间相似系数为64.1%～100.0%,按带型相似系数为85.0%标准划分为A～O群共15个克隆群。将2种来源的共160株副溶血性弧菌的PFGE图谱进行聚类分析,各菌株间相似系数为41.7%～100.0%,按带型相似系数为85.0%标准划分为79个克隆群。 结论 多数食品来源菌株间相似系数较低,患者来源菌株间相似系数高,而食品和患者来源菌株间相似系数较低,只有少数食品来源与患者来源菌株相似系数较高。     

药物重定位的计算分析方法

全新结构药物的研发存在周期长、耗资大、风险高的问题.通过各种技术预测已有药物的新适应症,即药物重定位,可以缩短药物研发时间、降低研发成本和风险.由于疾病种类和已知药物的数量繁多,完全通过实验筛选已知药物的新用途仍然具有很高的成本.随着组学和药物信息学数据的积累,药物重定位进入到了理性设计和实验筛选相结合的阶段,药物重定位的计算预测已经成为计算生物学和系统生物学的重要研究方向.本文将目前药物重定位计算分析的策略归纳为药物-靶标关系分析、药物-药物关系分析和药物-疾病关系分析,对已报道的技术方法及其成功应用实例进行了综述.     

在家兔“孤立脑”制备上刺激颈迷走神经的致眠作用

在家兔半慢性“孤立脑”制备上刺激颈迷走神经,可诱发睡眠。这一诱发睡眠具有慢波睡眠的特点。定量分析的结果表明:在刺激期睡眠总量增加了34%;睡眠持续时间增加了106％;δ指数增加了89%。刺激减压神经或膈下迷走神经,则无诱发睡眠的作用,据此探讨了家兔迷走神经内具有诱发睡眠作用的传入纤维的起源。     

中国野桑蚕线粒体基因组特征

中国野桑蚕（ChBm）线粒体全基因组序列为15688bp,由13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、24个tRNA基因和AT富集区构成,比家蚕和日本野桑蚕（JaBm）线粒体基因组多2个tRNA基因．除COI基因外（含有一个TTAG假想起始密码子）,所有蛋白编码基因含有典型的ATN起始密码子;13个蛋白编码基因中,有11个使用TAA作为终止密码子．除tRNA^Ser（TGA）-like具有四茎环结构外,其他的tRNA具有典型的三叶草结构．ChBm的AT富集区为484bp,短于JaBm和家蚕．系统发育分析表明,ChBm与家蚕的亲缘关系较近,与JaBm的亲缘关系较远．ChBm与家蚕的分化时间约在（1．08±0．18）～（1．41±0．24）百万年前,家蚕和JaBm的分化时间约在（1．53±0．20）～（2．01±0．26）百万年前,ChBm和JaBm的分化时间约在（1．11±0．16）～（1．45±0．21）百万年前．