油菜与紫云英间混作系统的生理生态效应

采用7种耕种方式研究油菜与紫云英间混作系统中油菜生长发育、产量形成及其效益.结果表明,育苗移栽油菜的株高、叶片大小、根颈粗、开盘度以及产量指标均明显优于免耕直播油菜;与紫云英混作的免耕直播油菜,各形态指标均优于免耕直播间作和单作油菜.耕翻后与紫云英混作的育苗移栽油菜产量比免耕直播单作油菜增产11.9%;与紫云英混作的免耕育苗移栽油菜产量与免耕直播单作相近.耕翻后与紫云英混作的育苗移栽油菜产值和效益最大,免耕直播油菜单作其次.结合产投比和土地当量比,耕翻后与紫云英混作育苗移栽油菜和与紫云英混作免耕育苗移栽油菜两种方式综合效益最高,增产增收,增加有机肥源,提高土壤肥力.     

昆虫杆状病毒系统表达口蹄疫病毒3ABC基因

以O型口蹄疫病毒为研究对象,经过RT-PCP扩增得到非结构蛋白3ABC基因,克隆到转移载体pFastbacHT,将其转入含穿梭载体Bacmid的DH10Bac,与Bacmid发生位点特异性转座作用,得到3ABC的重组穿梭载体Bacmid-3ABC,再将其转染昆虫细胞Hi Five.PCR鉴定证实3ABC基因正确地插入到病毒基因组的多角体蛋白基因启动子下游,经过SDS-PAGE和Western blot检测,3ABC基因在昆虫细胞中表达了大小约为50kDa的蛋白条带,3ABC基因在Bac-to-Bac系统中的成功表达为建立以基因工程产品为抗原、鉴别诊断自然感染和免疫动物的方法提供了技术条件.     

Mutational analysis of interaction between coat protein and helper component-proteinase of Soybean mosaic virus involved in aphid transmission

Soybean mosaic virus (SMV), a member of the genus Potyvirus , is transmitted by aphids in a non-persistent manner. It has been well documented that the helper component-proteinase (HC-Pro) plays a role as a 'bridge' between virion particles and aphid stylets in the aphid transmission of potyviruses. Several motifs, including the KITC and PTK motifs on HC-Pro and the DAG motif on the coat protein (CP), have been found to be involved in aphid transmission. Previously, we have shown strong interaction between SMV CP and HC-Pro in a yeast two-hybrid system (YTHS). In this report, we further analysed this CP–HC-Pro interaction based on YTHS and an in vivo binding assay to identify crucial amino acid residues for this interaction. Through this genetic approach, we identified two additional amino acid residues (H256 on CP and R455 on HC-Pro), as well as G12 on the DAG motif, crucial for the CP–HC-Pro interaction. We introduced mutations into the identified residues using an SMV infectious clone and showed that these mutations affected the efficiency of aphid transmission of SMV. We also investigated the involvement of the PTK and DAG motifs in the CP–HC-Pro interaction and aphid transmission of SMV. Our results support the concept that physical interaction between CP and HC-Pro is important for potyviral aphid transmission. Based on the combination of our current results with previous findings, the possibility that aphid transmission may be regulated by more complex molecular interactions than the simple involvement of HC-Pro as a bridge is discussed.     

应用逆转录PCR检测海产贝壳类中的甲型肝炎病毒

污染水体中生长的贝壳类是传播甲型肝炎的重要媒介之一,本文介绍了用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测贝壳类中甲型肝炎病毒(HAV)的方法。贝壳类中HAV的浓集回收采用洗脱-沉淀法并加以改进,30g贝肉中的病毒浓集回收在1.5~2.0m l上清液中。RT-PCR检出限为回收样品经二次扩增后10-2稀释度。从7种39份采自大连近海海域的贝壳类样品中,用该法检测出阳性样品4种10份,阳性率为26%。说明各种贝壳类有不同程度的污染。     

应用计算机软件辅助重组hbFGF 基因的筛选

目的：尝试通过计算机的辅助筛选基因重组组合,期望能减少人工筛选的工作量并得到高表达的蛋白。方法：从影响表达的两个因素即翻译起始区陬的二级结构自由能和翻译起始区的密码子偏好性问题研究入手,对部分核苷酸进行了突变,利用RNA二级结构预测软件DNASISv2．5对hbFGF的陬区起始密码子开始前35个核苷酸进行了分析,筛选出预期表达量高的组合并在实验中加以验证。结果：从32种突变方式中筛选出10条自由能绝对值最低的序列做引物,克隆至表达载体上,得到了两株高表达菌株。结论：利用计算机辅助设计可以优化和筛选实验结果,提高工作效率,降低具体实验的工作量。     

一种融合表达谱相关性信息的激活子网辨识算法

传统表达谱数据分析方法集中于寻找差异表达基因和共表达基因集合,没有考虑基因表达产物之间已知的相互作用.近年来在系统生物学的研究中发展了将基因表达谱与蛋白质相互作用网络进行整合分析的方法.现有方法未能综合考虑基因表达差异性和相关性信息,容易导致辨识结果中重要功能分子缺失且生物学功能相关度不高.提出一种融合表达谱差异性和相关性信息的激活子网辨识算法,能够在蛋白质相互作用网络中辨识高功能相关度的激活子网.应用到人免疫缺陷病毒HIV-1感染过程的研究,结果表明,该算法可以有效避免仅考虑基因表达差异性所引入的偏差,揭示了高相关性低表达差异基因在相关通路中的关键性作用.     

新疆喀纳斯湖北端河漫滩湿地植物群落演替

对喀纳斯湖北端河漫滩湿地植物群落进行了调查取样,通过除趋势对应分析(detrended correspondence analysis,DCA)排序研究了群落演替的动态,同时采用Shannon多样性指数、Margalef丰富度指数、Simpson多样性指数和Pielou均匀度指数,分析了物种多样性在群落演替过程中的动态变化,并运用去势典范对应分析(detrended canonical correspondence analysis,DCCA)方法,分析了不同样方中土壤因子与群落多样性指数之间的关系。结果表明:1)该区域植物群落演替序列为泽生苔草群落→西伯利亚早熟禾群落→金露梅群落→沼桦群落→西伯利亚云杉群落;2)随着演替的进行,群落物种优势度显著增加,而物种多样性呈先增加后降低的趋势,金露梅群落最高;3)土壤含水量和群落物种优势度之间存在显著负相关。     

上海虹桥国际机场飞行区植被与鸟类的关系

2008年3月～2009年2月,通过实地样方调查、样方植株烘箱处理和鸟类直接观察及样本解剖,对土道面区不同草高的所选样区进行植被、草丛动物和鸟类的研究,并对相关数据进行处理分析.调查结果显示: 1) 春季菊科、百合科、旋花科和葡萄科等蜜源植物开花会招引来大量昆虫,秋季禾本科、茄科、豆科和葡萄科等结实植物的果实又会为大量的昆虫以及鸟类提供食物; 2) 植被的生物量在一定程度上影响着鸟类种类数变化; 3) 植被和草丛动物的多样性指数具有极其显著正相关性,但鸟类与植被、草丛动物的多样性指数则不具有相关性; 4) 从各样区鸟类遇见率指数来看,各种鸟类对草高的喜好有着一定的差异.据此提出防范机场鸟击相关的对策和建议.     

SARS-CoV-2污染的进口冷链产品导致的一起大连本土新冠疫情

2020年12月15日,大连市报告了4名码头冷链货物搬运工人SARS-CoV-2核酸检测呈阳性,在此之前,大连市已经连续136天没有报告本土病例.在这次大连COVID-19疫情(简称"大连新冠疫情")中,我们收集了2020年12月15日至2021年1月8日期间大连新冠疫情中全部感染者(83)及部分接触的轮船货物样本,其中确诊病例占61.45％(51/83),无症状感染者占38.55％(32/83).通过高通量测序,共获得76条SARS-CoV-2全基因组序列,其中72条(86.75％,72/83)来自临床样本,4条来自R国籍A货船上的冷链食品外包装样本.基因组分析数据显示,与武汉参考株(NC_045512)相比,76条全基因组分别存在12～16个核苷酸突变位点,共享12个核苷酸突变位点,符合B.1.1进化分支突变特征.结合病毒基因组学和现场流行病学调查结果综合分析表明,大连新冠疫情是一起由SARS-CoV-2污染的进口冷链产品感染码头工人导致的本土疫情,在传播过程中至少形成了3个病毒代际和3个相对独立的传播链.