走出中国：酿酒酵母的起源、驯养与演化

酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)被广泛应用于酒类酿造和食品发酵等行业,其被人类利用的历史已有近万年。酿酒酵母也是遗传学、分子生物学、基因组学和合成生物学等研究中常用的模式生物。近年来研究者对其自然和驯养种群进行了全球范围的生态学、群体遗传学和群体基因组学等方面的研究,更新了对其生态分布、遗传多样性、自然进化和驯养史以及进化动力等方面的认知。发现酿酒酵母在原始森林等自然环境中普遍存在,并可能偏好阔叶树树干、腐木和周围土壤等生境。中国酿酒酵母的遗传多样性显著高于世界其他地区,该物种最古老的谱系也仅发现于中国,说明中国可能是该物种的起源地。生态适应是塑造该物种群体结构的主要力量,导致其野生和驯养群体之间的明显分化。驯养群体又分化为固态发酵和液态发酵两大类群,每个类群内又形成不同的驯养谱系。该物种野生群体的遗传多样性远高于其驯养群体,而野生群体遗传多样性的形成主要由中性突变引起。中国野生和驯养群体在麦芽糖利用能力、基因组杂合性、子囊孢子形成率和孢子活力等方面表现出显著差异,表明这2个群体采取不同的生活策略来适应其不同的生活环境。驯养群体通过群体或谱系特异性基因拷贝数...     

卡伍尔氏链霉菌NA4的Ⅱ型聚酮基因簇的靶向激活及其产物鉴定

【目的】以基因组信息为导向,定向激活海洋来源卡伍尔氏链霉菌（Streptomyces cavourensis） NA4中沉默的Ⅱ型聚酮类次级代谢产物生物合成基因簇,鉴定新产生的次级代谢产物的结构和抑菌活性。【方法】通过添加启动子和敲除负调控基因的方法激活实验室培养条件下沉默或低表达的生物合成基因簇,并完成目标化合物的分离与纯化,通过电喷雾质谱（electrospray ionization-mass spectrometry,ESI-MS）和核磁共振（nuclear magnetic resonance,NMR）数据分析鉴定目标化合物结构,对目标化合物进行抑菌活性鉴定,基于生物信息学信息推导化合物的生物合成途径。【结果】根据基因组生物信息学分析,从海洋来源链霉菌Streptomyces cavourensis NA4中选取一个编码PKSⅡ型次级代谢产物的生物合成基因簇开展研究,成功激活目标基因簇,从中分离到1个PKSⅡ型化合物,推导了其生物合成途径并进行了抑菌活性鉴定。【结论】基因组导向下的天然产物挖掘,可以目标明确地分离产物,充分挖掘链霉菌编码次级代谢产物的潜力。     

锐孔菌属一新种

本文报道了多孔菌科(Polyporaceae)锐孔菌属(Oxyporus)一新种:长白锐孔菌(Oxyporus changbaiensis Y.P.Bai et X.L.Zeng)。本种在形态特征上与黄白锐孔菌[Oxy-porus cervino-gilvus(Jungh.)Ryv.]相近,但菌丝具有大量横隔膜,且孢子较宽;亦与宽边锐孔菌[Oxyporus latemaginatus(Dur.et Mont.)Donk]相似,但孢子较大,有时有菌盖,囊状体上部被以结晶。文中有拉丁文及中文描述。     

宁夏下盾螨属三新种──（蝉螨亚纲：厉螨科）

宁夏下盾螨属三新种（蝉螨亚纲：厉螨科）白学礼,陈百芳,顾以铭宁夏回族自治区地方病防治所,宁夏银川市７５０００４南京大学医学院,江苏省南京市２１０００８关键词蜱螨亚纲,厉螨科,下后螨属,新种在整理宁夏革螨标本中,发现了下盾螨属Ｈｙｐｏａｓｐｉｓ３新种,...     

粘虫肠道蛋白酶在苏芸金杆菌肯尼亚变种“7404”晶体致病中的作用

粘虫的反吐肠道液以丙酮粗提后,经葡聚糖凝胶sephadex G-75柱层析,得到两个有蛋白酶活力的洗脱峰,它们的聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱完全不同,但都能水解晶体。纯晶体以反吐肠道液温培后,经Sephadex G-200柱层析,得到四个蛋白峰的层析图。经生物测定,以第二个蛋白峰的毒性最高,并在聚丙烯酰胺凝胶电泳中有稳定的蛋白图谱。     

基于政策工具视角的中国生物产业政策差异性分析

产业发展离不开产业政策的制定与发布,产业政策对于产业具有导向性与支持性,其制定主体主要包括中央政府和地方政府。以生物产业为例,采用计量分析的方法,搜集并整理了中央政府以及湖北、深圳、重庆、上海、北京五个地方政府颁布的生物产业政策,对其外部属性特征进行差异性分析,同时对多份国家层面的生物产业结构性政策运用内容分析的方法,进行政策工具分类分析,并构建了“政策工具-生物产业发展阶段”二维政策工具分析框架,探讨不同产业发展阶段之间政策工具使用的差异性。研究发现,中央政府与地方政府生物产业政策密集发布年份存在差异,且与生物产业发展关键节点有关联;国家层面生物产业政策不同类型政策工具使用频率差距较大,以环境型政策工具为主,较少使用需求型政策工具。针对研究结果,从我国生物产业发展情况及区域间差异的角度提出了相关政策建议。     

Asymmetric larval competition between two species of solitary parasitoid wasps: the influence of superparasitism

Abstract.

• 1 We test the hypothesis that a solitary parasitoid wasp may gain in fitness if she lays more eggs in a host.
• 2 Using heterospecific superparasitism (=multiparasitism) between the solitary aphid parasitoids, Aphidius smithi Sharma & Subba Rao and Ephedrus californicus Baker, we show that (i) a superparasitizing female's chance that her offspring will survive competition is an increasing function of egg density, and (ii) survival among same-aged larvae is independent of the oviposition sequence.
• 3 These findings on asymmetric larval competition provide indirect evidence that supports two fundamental, but untested, assumptions underlying models of adaptive superparasitism between conspecific wasps.

     

莴苣叶疫病和茎腐病的病原

2021年3–6月,从甘肃省的生菜(叶用莴苣)叶片和青海省的莴笋(茎用莴苣)茎秆罹病样本上分离得到腐霉属卵菌。通过Koch’s法则明确了分出菌株的致病性。依据形态学和分子生物学特征,将3个菌株鉴定为嗜导管腐霉Pythium tracheiphilum。在核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS)、细胞色素氧化酶亚基1(cox1)和核糖体DNA28S大亚基(rDNA-LSU)基因联合系统发育树中,甘肃菌株(LPy-B)和青海菌株(LPy-C和LPy-D)被聚在P. tracheiphilum的不同亚群里,不同菌株的适宜生长温度和产孢特性存在差异。孢子囊顶生、间生或侧生,球形,17.13–53.73μm,或近球形至葫芦状,24.58–56.72×18.62–53.73μm;休止孢球形,6.70–9.68μm;藏卵器光滑,顶生或间生,球形,15.64–23.09μm;每个藏卵器有雄器1–2个,雄器与藏卵器同丝或异丝生;卵孢子满器或近满器,球形,直径13.41–20.11μm,卵孢子壁厚0.74–2.23μm。致病性测定结果表明,除莴苣外,嗜导管腐霉还可侵染菊科的华蒲公英和刺儿菜、十字花科的...