Entropy effects on the ion-diffusion rate in transmembrane protein channels

We treat the transport of univalent cations through pore-like protein channels in biological membranes analytically, using two models (A + B) for the channel and the ion-channel interaction. A Lennard-Jones-type repulsion between the ions and the pore wall is introduced. We also include Van der Waals- and coulomb-type interactions between polar ligands of the pore-forming protein (e.g., carbonyl groups directed towards the axis of the channel) and the migrating particles. In model A, the polar groups are assumed to occur in pairs of dipoles pointing in opposite directions (as in the gramicidin A channel), while in model B the channel is treated as a pore with a radially isotropic charge distribution. In both models the ion-channel interaction leads to the occurrence of periodic potentials, corresponding to quasi-equilibrium and transition state sites of the ion in the pore. The diffusion rate can be calculated employing rate-theoretical concepts on the basis of microscopic parameters. It is demonstrated that the anomaly (inversion of the normal mass effect) for the transport rates of different ions can be related to differences in the activation entropy. The latter quantity is estimated analytically for both models. As a test, we performed numerical calculations with parameters based on the gramicidin A model. The results are in good agreement with experimental data and data from computer simulations. This shows that simple analytic expressions are well suited for predicting trends in the ionic conductivity of protein channels on the basis of microscopic interactions.     

Ion-specific diffusion rates through transmembrane protein channels. A molecular dynamics study

The migration of different alkali metal cations through a transmembrane model channel is simulated by means of the molecular dynamics technique. The parameters of the model are chosen in close relation to the gramicidin A channel. Coulomb- and van der Waals-type potentials between the ions and flexible carbonyl groups of the pore-forming molecule are used to describe the ion channel interaction. The diffusion properties of the ions are obtained from three-dimensional trajectory calculations. The diffusion rates for the different ions Li+, Na+, K+ and Rb+ are affected not only by the mass of the particles but also very strongly by their size. The latter effect is more pronounced for rigid channels, i.e., for binding vibrational frequencies of the CO groups with v greater than 400 cm-1. In this range the selectivity sequence for the diffusion rates is the inverse of that expected from normal rate theory but agrees with that found in experiments for gramicidin A.     

Polyamine als Stimulatoren von Genaktivitäten Eine autoradiographische Studie an Riesenchromosomen von Chironomus thummi

Zusammenfassung Inaktive Riesenchromosomen der Speicheldrüsen ausgewachsener Chironomus thummi-Larven zeigten nach 60 min Inkubation mit 0,05 N Putrescin-, Spermidin-oder Spermin-Lösung erneute Syntheseaktivitäten, die sich im Einbau von radioaktiv markiertem Uridin autoradiographisch zu erkennen geben. Diese Beobachtung wird im Zusammenhang mit der bekannten genaktivierenden Wirkung von Mg⁺⁺ diskutiert. Auf der Basis zahlreicher biochemisch analoger Wirkungen von Polyaminen und Mg⁺⁺ wird ein ursprünglich für die genaktivierende Wirkung von Mg⁺⁺ postuliertes Modell auf Polyamine übertragen.

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Stimulation of gene activities by polyamines an autoradiographic study with giant chromosomes of Chironomus thummi

Summary Inactive salivary gland giant chromosomes of full grown Chironomus thummi larvae showed after 60 min of incubation in 0.05 N putrescine, spermidine or spermine solutions autoradiographically demonstrable incorporation of radioactiv labelled uridine caused by a reactivation of RNA synthesis. This observations is discussed in relation to the known gene activating effect of Mg⁺⁺, and, since polyamines and Mg⁺⁺ have numerous effects in common, it is suggested that polyamines affect gene activity in a way similar to Mg⁺⁺.

     

Die Brutzeiten einiger Gänsearten und ihrer Bastarde in identischen Bedingungen

Zusammenfassung An Hand von 229 Brutbeginn-Daten von freilebenden Gänsen, die während der Jahre 1956–1966 in Seewiesen (Obb.) (48°N, 11°11E) brüteten, wurden die mittleren Brutbeginn-Daten von 5 Gänsearten und von Artbastarden bestimmt. Es zeigte sich, daß die untersuchten Arten unter diesen Bedingungen in derselben Reihenfolge brüteten, wie ihre Artgenossen in freier Wildbahn. Die mittleren Brutbeginn-Termine wurden allerdings um so mehr vorverlegt, je später die Art normalerweise brütet (Abb. 1). , die mit artfremden verpaart waren, brüteten zur selben Zeit wie ihre Artgenossen, die mit artgleichen verpaart waren (Abb. 1). GraugansxSchneegans-Bastard-, die mit Schneegantern verpaart waren, begannen meist nach den Graugänsen, aber stets vor den Schneegänsen zu brüten (Abb. 1, 2). Das intermediäre Brüten dieser wird als starkes Argument für die Richtigkeit der Hypothese gewertet, nach welcher die artspezifisch verschiedenen Brutzeiten wenigstens zum Teil genetisch bedingt sind. In der Diskussion wird die Frage kritisch erörtert, wie weit schon allein die Tatsache, daß die verschiedenen Arten über Generationen hinweg in derselben Reihenfolge wie ihre wildlebenden Artgenossen zu brüten beginnen, als Beweis für derartige genetische Unterschiede angesehen werden kann.

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Summary In 229 cases onset of breeding was recorded from free-living geese of 5 species and of some hybrids of these species, kept in Seewiesen/Obb. (48° N, 11° 11E) from 1956 to 1966. It was found that the species under these conditions bred in the same seasonal sequence as did wild birds. The mean breeding times, however, were found to be advanced in relation to the onset of breeding in the wild (Fig. 1). This was especially evident in the case of late-breeding species. paired with of another species came into breeding condition at the same time as paired with of the same species (Fig. 1). GraylegxSnowgoose hybrid paired with Snowgoose in most cases started to breed later than Greyleg geese but always earlier than the mean breeding time for Snowgeese (Fig. 1, 2). This intermediate breeding time is taken as a strong argument for the hypothesis that the species specific differences in breeding times are, at least in part, genetic in origin. The question as to the extent to which the differences in breeding times alone, persisting for generations in the same sequence as those of wild birds, can be attributed to genetic differences between the species, is critically discussed.

     

Veronica caespitosa Boiss.,V. bombycina Boiss.&Kotschy undV. thessalica Benth. gehören nicht in die SektionVeronicastrum Benth.

Zusammenfassung Die drei hochalpinen Polster-ZwergsträucherVeronica caespitosa Boiss.,V. bombycina Boiss. &Kotschy aus Kleinasien und dem Libanon sowieV. thessalica aus Nord-Griechenland und Albanien haben polytele Rumpfsynfloreszenzen (Troll, 1963), das heißt eine oder wenige laterale (axilläre) wenigblütige Trauben, deren Abstammungsachse in einen sterilen, wenige Blattpaare tragenden Gipfelsproß endet, der in der nächsten Vegetationsperiode monopodial weiterwächst und gegen die Spitze zu abermals laterale Trauben hervorbringt (Prolifikation). Diese Bauverhältnisse wurden bisher übersehen, da die blühenden Sprosse dieser hochalpinen Zwergstrauch-Polsterpflanzen gestaucht und dicht beblättert sind und der sterile Sproßgipfel von den Blütentrauben zur Seite gedrängt wird, so daß bei oberflächlicher Betrachtung der Eindruck eines endständigen köpfchenartig gedrängten Blütenstandes entsteht. Da die Stellung der Infloreszenzen für die GattungVeronica phylogenetisch und taxonomisch wichtig zu sein scheint, können die behandelten drei Arten nicht in der (akrobotryschen) SektionVeronicastrum verbleiben, die durch terminale Infloreszenzen charakterisiert ist, sondern müssen in die pleurobotrysche, durch ausschließlich laterale Infloreszenzen ausgezeichnete SektionenVeronica=(Chamaedrys) eingereiht werden.Ein fälschlich alsV. satureioides Vis. bestimmter Beleg in den Herbarien W und WU vonV. thessalica vom Gipfel des Berges Gjalica e Lumës (zirka 2470 m s. m.) in Nord-Albanien erweitert das bekannte Areal beträchtlich, denn die Art war bisher nur von dem etwa 250 Kilometer weiter südöstlich gelegenen Thessalischen Olymp in Griechenland bekannt.

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Summary The three speciesVeronica caespitosa Boiss. andV. bombycina Boiss. &Kotschy from high mountains of Asia Minor and the Lebanon andV. thessalica from high mountains of Northern Greece and Albania have not terminal but only one or a few lateral (axillary) raceme(s), the shoot ending sterile, continuing (prolificating) next year monopodially and developping again (a) lateral raceme(s) (fig. 1a, b). This fact hitherto has been concealed by the habit of these dwarfish undershrubs with densly crowded foliation, the raceme(s) overlapping and putting aside the short terminal shoot (fig. 1a). Thus the three species mentioned have to be transferred from the sectionVeronicastrum with terminal racemes to the sectionVeronica (=Chamaedrys), characterized by bearing only lateral racemes. V. thessalica until now was recorded only from the Thessalic Olympos (Greece). A speciemen in the herbaria W and WU from the peak of the mountain Gjalica e Lumës (2470 m s. m.) in Northern Albania, misidentified asV. satureioides Vis., makes it probable, that the area of this species covers also the high mountains between Albania and the Thessalic Olympos.