借助斑马鱼EST数据库从鲤鱼微卫星序列中寻找蛋白编码基因

应用in sifico的方法,利用Blastu和Blastx搜索引擎,将鲤鱼微卫星序列与GenBank数据库进行同源序列比对.利用Blastn,将侧翼序列长度＞50bp的875个鲤鱼微卫星序列与斑马鱼的EST数据库首先进行比对,结果找到了121个同源序列.随后采用Blastx搜索蛋白质数据库,有94个微卫星位点存在同源蛋白.除了33个假定和3个未知蛋白外,剩余的58个微卫星位点被成功地进行了功能注释,而且其中的7个位点已经定位在了鲤鱼连锁图谱上.另外,通过PCR-SSCP的方法,将两个与鲤鱼微卫星侧翼序列相匹配的斑马鱼EST序列开发成鲤鱼的STS标记,并将其中的一个标记HLJZe33定位到鲤鱼连锁图谱上.以上研究结果表明,通过比较基因组研究,模式生物斑马鱼的很多遗传和基因组资源都可以被利用到鲤鱼的基因组研究中.     

金腰属植物化学成分和构效关系研究进展

介绍从金腰属(Chrysospleruium)植物中分离得到的化合物及其生理活性研究概况和构效关系,为进一步开展该属植物成分和药效研究提供参考。金腰属植物成分主要为黄酮类化合物,还有五环三萜。都有较强的生物活性。     

兔多杀性巴氏杆菌C51-3株黏附蛋白的表达、纯化及其抗原性检测

应用PCR从兔多杀性巴氏杆菌C51-3株基因组DNA中扩增出编码36 kD黏附蛋白的cp36基因, 将其克隆到pMD18-T载体并对插入片段进行测序。以重组质粒pMD18-cp36为模板, 用PCR扩增得到编码信号肽除外的成熟黏附蛋白基因cpm36, 并克隆到原核表达质粒pQE30中, 得到重组质粒pQE30-cpm36, 转化大肠杆菌M15, 在IPTG诱导下表达融合蛋白CPM36, 经Ni2+-NTA亲和层析纯化。DNA测序结果表明cp36基因片段大小为1032 bp, 与已报道的16个血清型多杀性巴氏杆菌cp36基因的核苷酸序列比较, 同源性在76.9%~100%之间。SDS-PAGE结果显示, 表达分子量约为37 kD的带有6×His标签的CPM36蛋白, 与预期分子量相符。Western blotting结果表明, 抗重组蛋白抗体分别能与CPM36蛋白和多杀性巴氏杆菌36 kD蛋白发生特异性反应, 证明原核表达蛋白具有抗原性, 为进一步开展多杀性巴氏杆菌免疫保护性抗原的研究奠定了基础。     

结直肠癌原发与配对转移肿瘤遗传异质性研究进展

结直肠癌(colorectal cancer, CRC)是我国常见的致死性肿瘤类型之一。根据体细胞突变谱预测抗EGFR单抗治疗疗效已成为转移性结直肠癌(metastatic colorectal cancer, mCRC)治疗的标准步骤。由于临床上转移样本难以获得,只能采用原发肿瘤替代进行检测。原发和配对转移肿瘤间的遗传异质性会导致原发灶取样无法代表转移灶突变谱。目前CRC原发和配对转移肿瘤间遗传异质性程度仍存在争议。本文就CRC原发和配对转移基因组谱的对比研究进行了综述,并讨论了原发与配对转移肿瘤遗传异质性形成的原因及应对策略。     

马尾松毛虫灾变发生类型与地貌及植被特征间对应分析

1　引　　言对应分析 (ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓ)由法国Ｂｅｎｚｅｃｒｉ于1970年首先提出 ,是在Ｒ型和Ｑ型因子分析基础上发展起来的一种多元分析方法[5] .它与主成分分析有着密切的联系 ,在某种意义上可以看成是主成分的特殊情形 ,从另外一种意义上讲 ,它又是主成分分析的推广 .另外 ,它和典型分析也是相通的[4 ] .对应分析的主要目的是寻求列联表行因素和列因素的基本分布特征和最优联立表示 ,并将彼此间的结构关系直观地展示出来 .对应分析已被用于生物学研究的不同领域[2 ,3 ] .本文应用对应分析方法 ,对小班 (ｓ…     

云南美登木悬浮培养细胞的化学成分

利用组织培养方法以云南美登木（Maytenus hookeri Lose.）未木质化的茎和嫩叶为材料诱导出愈伤组织,经过继代培养建立了悬浮细胞培养系,培养物的乙酸乙酯提取物显示抗橙色青霉（Penicillium avellaneum UC-4376）生长的生物活性。对培养物进行化学成分研究,分离鉴定了9个化合物,2,3-diacetoxyl maytenusone(1)、角鲨烯（squa-lene,2）、β-谷甾醇（β-sitosterol,3)、2′,3′,4′-triacetylsitoindoside I(4)、salaspermic acid(5)、美登酮酸（maytenonic acid,6)、2α-羟基美登酮酸（2α-hydroxy-maytenonic acid,7)、6,11,12-trihydroxy-8,11,13-abietrien-7-one（8）和11,12-dihydroxy-8,11,13-abietrien-7-one（9）,其中化合物1为新化合物,通过2D NMR对化合物5-7的NMR数据进行了全指定,并修正了化合物5和6的部分碳谱数据指定。     

鲤鱼微卫星标记与体重、体长和体高性状的相关分析

利用47个鲤鱼微卫星标记, 对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系自交F2代的92个个体基因组DNA进行检测, 得到162个等位基因, 各座位等位基因数2~6个, 片段长度100~444 bp, 有效等位基因数1.3069~4.2288, 杂合度0.2361~0.7677, 位点多态信息含量0.5368。利用统计软件SPSS的GLM程序对47个微卫星标记与鲤鱼体重、体长和体高相关性进行了分析, 结果表明HLJ695、HLJ716、HLJ739、HLJ759、HLJ774、K16与体重、体长和体高相关, HLJ776与体高相关。对同一标记不同基因型间进行多重比较, 找到与3种性状相关的基因型。     

海北藏系绵羊种群结构及其出栏方案分季最优化的探讨

本文是作者以前(1984)最优化模型探讨的续篇。考虑到季节性草畜矛盾是藏系绵羊生产的重要限制,为弥补以前模型之不足,本文对该模型进行了扩充,构造了种群季节动态模型,并在此基础上,以各季能量收益总和最大为目标,以种群年间平衡态和各季牧草限制为约束条件,构造了分季最优化的线性规划模型。种群季动态模型形式为: N_(t,s)+1=A_sN(t,s)-B_sU_(t,s) S=1,2 N_(t+1,1)=A_sN_(t,s)-B_sU_(t,s) S=3分季最优化的线性规划模型为: Max Z=(sum from s=1 to 3 sum from i=1 to 7 C_(is)U_i~s)+(sum from s=1 to 3 sum from i=1 to 7 d_(is) N_i~s s.t.sum from i=1 to 7 g_(is) N_i~s≤G_s A_3N_3-B_3N_3=N_1 A_1N_1-B_1N_1=N_2 A_2N_2-B_2N_2=N_3在构造模型同时,本文阐明了分季模型同以前年模型的异同及其数学和生物学的结构关系。除了构造模型之外,本文还使用来源与上篇相同的数据,计算了藏系绵羊最优种群结构、最优出栏方案及收益,并把计算结果同上篇的计算结果作了比较。从本文计算结果及其比较看,以百分比表示的最优存栏种群结构和最优出栏方案同上篇结果完全一致,但存栏和出栏的最优只数及收益上比上篇计算结果低20%左右。这个比值是由于季节牧草不平衡和藏系绵羊本身特征,使各季牧草不能按需均分,从而有余有缺而形成的。因此,在季节限制下,上篇模型预测的存栏结构和出栏方案仍为最优,然而其最优羊只数不能完全实现。     

“细胞的能量‘货币’ATP”单元教学设计

基于新课程标准的要义,结合“细胞的能量‘货币’ATP”的单元教学,探讨发展高中生物学学科核心素养的途径。     

Ang2、Tie2基因的RNA干扰及其在体外抑制血管生成的作用

目的：探讨应用RNA干扰（RNA interference,RNAi）技术沉默Ang2、Tie2基因及其在体外抑制血管生成的研究,为将来进一步进行抑制肿瘤血管生成的动物实验研究奠定基础,为肿瘤的基因治疗提供实验依据。方法：用pSilencer 1.0-U6-Ang2/Tie2-siRNA重组质粒转染人脐静脉内皮细胞(HUVECs),采用RT PCR检测各组HUVECs Ang2、Tie2的mRNA表达状况。应用体外血管生成的三维培养模型研究转染后的HUVECs在体外形成血管样结构的情况。结果：pSilencer 1.0-U6-Ang2/Tie2-siRNA重组质粒转染HUVECs后,RT-PCR检测结果显示: Ang2、Tie2基因mRNA的表达水平均受到明显抑制（P<0.05）,并且siRNA的2条重组质粒之间均无明显差别（P>0.05）。转染后的HUVECs在体外三维培养模型中血管样结构形成的数量和长度均明显减少（P<0.05）,表明血管生成受到明显抑制。结论：Ang2-siRNA、Tie2-siRNA能够抑制HUVECs中Ang2和Tie2的mRNA表达,从而在体外抑制血管生成。