沙门氏菌中dnd基因簇的缺失与异源表达

沙门氏菌Salmonella enterica serovar Cerro 87是一株从鸡场分离到的菌株, 其DNA骨架上的磷硫酰化导致了在高压脉冲电泳过程中DNA降解(DNA degradation, Dnd表型)。本研究采用SacB所介导的负筛选系统, 在该菌株中成功缺失了dnd基因簇, 构建了突变株XTG103, 该突变株不再具有Dnd表型。通过异丙基-b-D硫代半乳糖苷(IPTG)诱导启动子PlacZ的转录可以调控DNA磷硫酰化修饰的dnd基因簇的异源表达。     

座壳孢菌株的选育

为了提高座壳孢(Aschersonia papillata)防冶温室日粉虱(Trialeurodes vaporariorum)的效果,对该菌株进行了常规育种。以野生菌株A6S为原始菌株,经自然分离获得A6S一1菌株,经人工诱变得到A6s一256、A6s一393、A6S一504等菌株。选育的菌株不但保持原菌株的性状,而且适应性更强。在寄生率和产孢量上均显著优于自然分离菌株。     

上海宝钢工业区凋落物中土壤动物群落结构及季节变化

为探讨城市工业区凋落物中土壤动物的群落特征, 作者于2005年夏季至2006年春季, 对上海市宝山钢铁公司厂区不同功能区(生产区、过渡区和办公区)凋落物中的土壤动物进行了调查。共捕获土壤动物52,070 只, 分别隶属于3门10纲19目, 优势类群为蜱螨目和弹尾目, 二者共占总数的90.60%; 常见类群为鳞翅目和近孔寡毛目。不同功能区的优势类群相同, 常见类群相异, 且土壤动物总密度随着生产区-过渡区-办公区呈现递减趋势; 不同功能区凋落物和不同绿化类型(乔木和灌木)中的5种指数呈现规律不同: Simpson优势度指数(C)、Margalef丰富度指数(D)为中间过渡区高, 两边区域低; Pielou均匀度指数(E)为生产区>办公区>过渡区; DG指数和Shannon-Wiener多样性指数表现为生产区>过渡区>办公区; 凋落物中土壤动物数量的季节变化为冬季>秋季>夏季>春季, 而类群数量为冬季=秋季>夏季=春季; 不同功能区凋落物pH值、有机碳、总氮和总磷含量不同, 其中pH值、总氮达到显著性差异, 对凋落物中土壤动物有一定影响。     

鄂西南山区重楼属植物资源调查与鉴定研究

目的：进行鄂西南山区重楼属植物资源的调查、引种和资源鉴定,为重楼属植物资源开发提供依据。方法：采取文献调研与野外调查相结合的方法,初步明确该地区的资源现状;引种于适生环境后,参照《重楼属植物》的分类方法,以田间活体标本鉴定为主,以彩色图片鉴定为辅进行品种鉴定。结果：本区重楼属植物分属于中轴亚属和侧膜亚属2个亚属,5个种,7个变种,3个变型,共有15个变异类型,其中白花重楼的2个变型是《重楼属植物》中没有的;以往认为本区有分布的狭叶重楼变种的两个变型中狭叶变型没有收集到。     

用反向斑点杂交方法检测猪常见致病菌

目的:建立检测猪常见致病菌的反向斑点杂交方法。方法:将23S rRNA基因芯片用的针对12种细菌的25～30 mer探针加长到30～38 mer,2对通用引物序列不变。用地高辛标记下游引物,以尼龙膜为载体制备膜芯片,检验探针/膜杂交的特异性和敏感性;另外设计1条大肠杆菌K88基因探针、一段带K88探针的报告基因和1对报告基因的反向PCR引物,在PCR体系中增加封口的K88报告基因和反向引物对,被检样品扩增后进行膜杂交。结果:修改的13条探针与参考目标菌株在膜上成特异性杂交,对52个参考菌株和野外分离株的检测准确率为92%;膜杂交的敏感性与玻片芯片接近,最小检出量为100 fg DNA;在尼龙膜上增加K88探针,与3重PCR产物杂交,可以检测到大肠杆菌K88毒力基因。结论:建立的反向斑点杂交方法简便快速,检测成本低,可用于仪器设备不足的实验室,同时可以加入检测如大肠杆菌K88等致病基因,提高基于保守基因的芯片的诊断能力。     

锥虫早老素蛋白亲水区的克隆和表达纯化

目的体外表达锥虫早老素蛋白亲水区肽段,以制备抗血清用于功能研究。方法根据锥虫早老素蛋白二级结构特性,设计引物分别扩增N端及C端片段的亲水区肽段基因,装入原核表达载体进行表达,并通过变性纯化方法获得足够量表达蛋白,制备兔抗血清。结果成功扩增并克隆锥虫早老素蛋白亲水区片段L2及L7．并分别采用变性磁珠法和变性树脂法进行大量蛋白产物纯化,浓缩纯化产物制备兔抗血清经Westem blot杂交验证,出现目的蛋白大小阳性条带。结论成功表达锥虫早老素蛋推测N端及C端亲水肽段,并成功制备抗血清．可用于锥虫早老素蛋白功能分析。     

应用飞秒时间分辨瞬态吸收光谱研究蛋白质中距离相关长程电荷转移：光合细菌天线复合体LH2与TiO2纳米颗粒超分子组装体个例初探

蛋白质在生物体内电荷转移过程中所起的作用迄今仍然是一个有争议的问题,其争论焦点是蛋白质在生物电荷转移过程中是否提供特殊的电子传递通道或者是仅仅作为普通的有机介质。应用飞秒时间分辨瞬态吸收光谱研究由光合细菌天线分子和平均粒径为8nm的TiO2组装而成的超分子系统中长程电荷转移,晶体结构研究表明,光合细菌天线分子具有由多个α-脱辅基和β-脱辅基蛋白跨膜螺旋构成的双层空心柱面体结构,其中α-脱辅基蛋白跨膜螺旋构成的小环状体套于β-脱辅基蛋白跨膜螺旋构成的大环状体中,小环状体的空腔直径约为3.6nm。光合色素细菌叶绿素和β-胡萝卜素分子处于两环之间。细菌叶绿素距离外周胞质膜最近,预计为1nm。本研究试图将TiO2纳米颗粒部分装入光合细菌膜蛋白的腔体中,探讨细菌叶绿素与TiO2纳米颗粒间进行的光致长程电荷转移,进而揭示蛋白质在电荷转移过程中所起的作用。实验观察到细菌叶绿素B850在LH2/TiO2中的基态漂白恢复的时间常数明显地比在LH2中短,应用长程电荷转移模型。将蛋白质视为普通介电媒体。由电荷转移速率推算得到细菌叶绿素与TiO2纳米颗粒最近表面的距离为0.6nm。表明TiO2纳米颗粒已经成功地部分装入光合细菌天线分子的空腔中。     

油田注入水中硫酸盐还原菌计数的最佳生长期

通过对５个采油厂１４个不同水样中硫酸盐还原菌的培养观察,结果表明,在适宜条件下,培养７ｄ可达到计量此菌的最大菌数。比原观察时间缩短８ｄ,提高了工作效率。     

香蕉基因组SRAP反应体系的建立和优化

为建立并优化适于香蕉（Musa spp.）SRAP分析的扩增体系,对影响香蕉SRAP反应的dNTP、Mg²⁺、模板DNA、引物浓度和Taq酶用量等因素进行优化。确定的优化扩增体系为Mg²⁺ 2.5 mmol·L^-1,dNTP 250 μmol·L^-1,Taq酶1.0 U,引物0.5 μmol·L^-1,模板DNA 20 ng,10×PCR buffer 2.5 μL,在此条件下SRAP扩增香蕉基因组DNA条带清晰,多态性丰富。该体系在29个香蕉基因组中获得较好的扩增结果,可望在香蕉植物起源和进化研究中应用。     

分子系统学的发展及其现状

分子系统学在生物研究中的地位日益显得重要,本文概述了分子系统学的形成以及常用的研究方法。介绍了该学科的应用和研究中存在的一些争议。