基于线粒体ND2基因的直翅目部分种类分子系统学发育研究

本文的研究目的是通过对直翅目部分种类的线粒体ND2基因进行分析,重建直翅目内部昆虫的系统发育关系,并探讨分子系统发育关系和传统分类结果的异同。基于80个物种ND2基因的研究结果显示直翅目ND2基因存在碱基偏向性A T含量平均为73%,第三位点A T含量79.9%最高,推测这与氨基酸变异有关。直翅目具有单系性,而蝗亚目内部的剑角蝗科、网翅蝗科、槌角蝗科和斑腿蝗科均不是单系群,锥头蝗科和瘤锥蝗科亲缘关系较近,这与Otte分类系统相一致,建议将锥头蝗科和瘤锥蝗科合并为一个科。癞蝗科的分类地位存在争议有待进一步深入的研究。     

系统发育信息学及网络资源

系统发育信息学是近年来形成的新的学科方向,是系统学研究领域的一个新兴生长点。系统发育信息学是存贮、管理、注释、开发和加工系统树及其相关生物学信息的交叉学科。它的方法是基于计算机和网络技术,包括大型系统树及其相关生物学数据库的建立,系统树数据库网络的构架,系统树的可视化显示,小系统树的联合与超树的建立、用户查询、搜索和下载等,最终目的是要建立一个囊括地球上所有生物的系统树及其相关信息的数据库,将各种生物在树上精确定位,并进一步通过对系统发育信息的查询、搜索、联合与分析,从中获取生命进化的知识和进行生物学的预测。目前可用的系统发育网络资源主要有CIPRes和系统发育软件(PhylogenyPrograms)网站,已建立的系统发育信息学数据库包括TreeBASE,TreeofLife,Species2000,NCBITaxonomy数据库等。     

中国湖南切叶蚁属一新种(膜翅目,蚁科)

描述中国湖南省切叶蚁属Myrmecina Curtis 1新种,即少节切叶蚁M.pauca sp.nov.。新种与食草切叶蚁M.graminicola(Latreille)相似,但触角只有11节,柄节基部圆柱形,并腹胸背面及侧面纵皱纹明显较粗,背面中央有1条宽的纵沟贯穿全长。目前世界切叶蚁属所有已知种类的触角均为12节,但新种的触角只有11节,所以很容易与同属的所有种类相区别。正模工蚁,湖南省桂东县八面山自然保护区,2004-06-14,黄建华采。副模:3工蚁,与正模同巢采集;1工蚁,湖南省江永县源口自然保护区,2003-09-23,黄建华采;1工蚁,湖南省炎陵县桃源洞自然保护区,2003-09-24,黄建华采;1雌蚁,湖南省衡阳市衡山自然保护区,2003-09-08,黄建华采;1雌蚁,湖南省望城县黑麋峰森林公园,2003-09-12,黄建华采;1雌蚁,湖南省通道县木脚乡宏门冲自然保护区,2004-07-25,黄建华采。词源:新种以拉丁词"paucus"(少)命名,以显示其"触角节数比该属其它已知种少"这一重要鉴别特征。     

线粒体基因组数据的分析方法和软件

线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。本文以Staden Package软件为主介绍了拼接和注释的线粒体基因组的方法,同时介绍了其他常用的拼接软件ContigExpress、DNAMAN、DNASTAR、BioEdit和Sequencher,以及利用不同软件(包括DOGMA、MOSAS、MITOS、GOBASE、OGRe、MitoZoa、tRNAscan-SE、ARWEN、BLAST和MiTFi等)对线粒体基因组中的蛋白质编码基因、rRNA、tRNA和A+T富集区进行注释的方法,最后介绍了利用MEGA5软件分析线粒体基因组的组成、Sequin软件提交序列和线粒体基因组数据绘图工具(CG view、MTviz和OGDRAW)。     

基因间的同源关系

同源是指从共同祖先的特性遗传下来的通常带有分歧的两个特征之间的关系。同源概念组成了进化基因组学的基础并对功能基因组学有巨大作用,但基于对同源概念的不准确理解,当前对其有诸多模糊表述,因此了解其确切含义具有重要意义。本文就同源、直系同源和旁系同源的概念和性质进行综述。     

节肢动物线粒体基因组研究进展与基因顺序分析

在总结了68种节肢动物线粒体基因组的测序种类、基因组组成、结构及基因排序情况的基础上,特别对节肢动物线粒体基因组基因排列顺序数据进行了详细的分析。线粒体基因组基因排列顺序数据显示六足动物与甲壳动物之间相似,螯肢动物与多足动物相似,这个结果和以前Boore(1998)对节肢动物线粒体基因组顺序分析结果不同,却和核rRNA数据的分析结果一致。     

无齿稻蝗和黄翅踵蝗线粒体基因组与系统发育分析

为了研究无齿稻蝗和黄翅踵蝗在蝗总科的系统发育地位,本研究采用基于长PCR的二次PCR方法对这两种蝗虫的线粒体基因组进行了测定和系统发育分析。结构显示:无齿稻蝗和黄翅踵蝗线粒体基因组全长分别是15 447 bp和15 598 bp,均含有典型的37个基因以及一个控制区,基因排序和数量与其他已知近缘昆虫相同;线粒体基因组A+T含量分别是75.4%、75.4%。两种蝗虫的蛋白质编码基因中均是除了COX1的起始密码子是ACC,其他都是典型的起始密码子ATN;所有蛋白质编码基因的终止密码子都是典型的TAA或TAG;两种蝗虫t RNA基因中,21个能形成三叶草结构,只有trn~(SAGN)缺少DHU臂;黄翅踵蝗控制区的N链出现一个tRNA-like的结构。由两个外群和24个蝗总科物种构建的系统树结果显示无齿稻蝗与小稻蝗为姐妹群,黄翅踵蝗与飞蝗属和车蝗属与小车蝗属组成的分支为姐妹群。     

元江埃及金钢钻的生活习性观察

埃及金钢钻Earias insulana(Boisd.),是棉花蕾铃的危险害虫。1957年以后在云南棉区普遍发生为害,造成严重损失。本文是作者1957—1960年在云南元江地区研究工作的一部分。 一、成虫习性 1.羽化:以20—24时羽化最盛,夜1时后渐稀少,自天羽化数量最少。成虫从茧末端裂缝处爬出,经10—20分钟开始爬行,伸展翅膀,片刻即可飞行。 2.交配:清晨5—7时30分常在叶背面、嫩芽上交配,亦有少数延迟到9时30分交尾的。交配时雄虫与雌虫并列,将抱握器握住雌虫生殖器后,把身体反     

棉铃虫、金钢钻的产卵习性及卵期防治的一种试探方法

棉铃虫Chloridea obsoleta及3种金钢钻——斑纹金钢钻Earias insulana,翠纹金钢钻E.fabia,鼎点金钢钻E.cupreoviridis.——是云南棉区较严重的蕾铃害虫。在几年来的饲养及防治中观察到它们的产卵习性与棉株顶部叶片多毛及分泌有机酸的理化性状有密切关系,可利用此特点进行卵期防治。     

应用长PCR扩增蝗虫线粒体全基因组

介绍了用两对长PCR引物扩增蝗虫(Acridoidea)线粒体全基因组的方法。从NCBI的核酸数据库下载得到36种已测昆虫线粒体全基因组,选取cytochromeb(Cytb)c、ytochrome oxidase subunitⅡ(COⅡ)、cytochrome oxidase subunitⅠ(COⅠ)基因的保守区域设计两对引物。其中引物LP03和LP04从COⅠ向Cytb扩增;引物LPCytb和LPCOⅡ从Cytb向COⅡ扩增,两对引物扩增的片段之间有大约1 kb的重叠。应用这两对引物成功扩增出10种蝗虫的线粒体基因组。考虑到在设计引物过程中所选序列在其他昆虫中的保守性,它们应能在大部分昆虫线粒体基因组扩增中发挥作用。