结节性甲状腺肿circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建

基于生物信息分析筛选结节性甲状腺肿中差异表达的环状RNA(circRNA),并揭示circRNA-miRNA-mRNA调控网络在结节性甲状腺肿中的作用。从GEO数据库中检索结节性甲状腺肿组织基因芯片数据,利用R软件筛选出差异表达的circRNA。联合多个生物信息数据库预测差异表达circRNA下游的miRNA及mRNA, 并对靶mRNA进行GO及KEGG富集分析。利用STRING在线数据库及Cytoscape软件筛选核心基因。确定了2个circRNA,42个miRNA及546个mRNA。GO及KEGG富集分析表明靶mRNA主要涉及细胞生长及基因表达调控过程。基于Cytoscape软件筛选出了14个核心基因(SP1、IGF1R、RPS6KB1、SMAD2、SMAD3、SMAD4、VEGFA、CCND1、CDK2、HSPA4、HIF1A、CREB1,NR3C1和STAT5A)。最终基于2个circRNA、11个miRNA和14个核心mRNA构建了circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结节性甲状腺肿组织中异常表达的circRNA及相关的circRNA-miRNA-mRNA调控网络可能成为结节性甲状腺肿诊断与治疗的新靶点。     

甲流病毒的出现导致季节性H1N1流感病毒所受的纯化选择增强

为了探明2009年5月甲流在中国暴发几个月后,既往在人群中流行多年的季节性H1N1流感病毒流行强度突然下降,并且最后在人群中消失的原因,本文对2006～2011年中国季节性H1N1流感病毒的HA1进行测序,然后计算HA1所受选择压力,得到季节性H1N1流感病毒在不同时段的ω值。结果表明季节性流感H1N1流感病毒在甲流暴发前ω=0.36,暴发后ω=0.28。统计学分析表明暴发前和暴发后两组的ω值有显著性差异(t检验,P<0.05)。因此,中国季节性H1N1流感病毒在甲流大流行后受到更强的纯化选择,可能是导致其从人群中消失的主要原因之一。     

福尔马林灭活柱状黄杆菌对草鱼免疫相关基因表达的影响

在本研究中,将福尔马林灭活的柱状黄杆菌菌苗（FKG4）经腹腔注射免疫草鱼,以注射灭菌PBS作对照,分别在免疫后1、7、15和28d,提取受免鱼和对照鱼肝脏、脾脏和头肾3种组织中的总RNA并反转录成cDNA,利用Real-time PCR方法对不同组织中C-反应蛋白（CRP）、主要组织相容性复合体I（MHC Ⅰ）、肿瘤坏死因子（TNFα）、白介素1（IL-1β）、白介素8（IL-8）、Ⅰ型干扰素（IFN Ⅰ）等6种免疫相关基因的表达进行定量分析。结果发现CRP在受免鱼肝脏中的表达于免疫后1、7d显著性高于对照鱼,而在脾脏与头肾中的表达未出现显著性差异;MHC Ⅰ在受免鱼3种组织中的表达于免疫后1、7、15d都显著性高于对照鱼;TNFα在3种组织中的表达水平都较低,但都于免疫后1、7天显著性高于对照鱼;IL-1β在3种组织中的表达于免疫后1d都显著性高于对照鱼,但只有在头肾中的表达在免疫后7d时仍保持显著性差异;IL-8在3种组织中的表达都只是于免疫后1d显著性高于对照鱼;TNFα、IL-1β及IL-8等三种炎症因子的基因表达在免疫后15d都恢复到对照鱼的水平;而IFN Ⅰ在3种组织中的表达与对照组之间未出现显著性差异。结果表明,FKG4注射免疫可以显著提高草鱼3种组织中与抗菌免疫相关的基因表达,从而增强鱼体抵抗细菌性病原的免疫力。     

实时荧光定量PCR技术在鱼类病害研究中的应用

实时荧光定量PCR技术是一种新的核酸定量技术,通过检测PCR产物中荧光信号强度达到定量的目的,与常规PCR相比,具有无污染、特异性强、检测灵敏、定量准确等特点,该技术在分子诊断、动植物检疫等方面得到了广泛的应用.目前水产养殖业处于飞速发展时期,其中鱼类的病害问题也日益突出,为了预防和控制鱼类病害,实时荧光定量PCR技术已逐渐应用于鱼类病害的研究中.该文将从实时荧光定量PCR的技术原理、主要类型以及实时荧光定量PCR技术在鱼类病害研究的应用研究作一综述.     

2011～2012年度中国H3N2亚型流感病毒病原学特征分析

为了解2011～2012年监测年度我国分离的H3N2亚型流感病毒流行和变异特点,本文对2011年4月至2012年3月流感监测年度中国大陆分离的H3N2亚型流感毒株进行了抗原性和基因特性研究。结果显示,2011年我国大陆H3N2亚型流感病毒活动水平较低,2012年1月以来活动水平逐渐升高并于3月初成为流行优势株。H3N2亚型流感病毒中大部分毒株与疫苗株A/PER/16/09(87.2%)和国内代表株A/FJ/196/09(76.0%)抗原性类似,但2012年以来低反应株比例有升高趋势,基因特性分析大部分低反应株主要集中在Vic/208分支上,HA晶体结构分析发现与疫苗株相比,近期毒株在抗原决定簇A区、B区和C区均发生了氨基酸位点突变,而且在HA的45位,NA的367位各增加了一个糖基化位点。总之,虽然在此流感监测年度中我国大陆流行的大多数H3N2亚型流感病毒与疫苗株和国内代表株类似,但是随着低反应株的逐步流行,需要及时监测疫苗的保护效果并及时更换疫苗株。     

后河国家级自然保护区蝴蝶群落多样性研究

于2003～2004年对湖北省五峰后河国家级自然保护区的蝴蝶群落进行实地调查,采用α-多样性测度方法研究春、夏、秋3季蝴蝶群落的多样性,分析其物种丰富度指数,科、属和种级分类下的多样性指数(H( F)、H( G)、H( S))、均匀度指数和优势度指数.结果表明,春、夏、秋3季蝴蝶群落的物种丰富度指数以夏季最高,为92;各级多样性指数也以夏季最高,分别为1.6231、3.1254和3.7755;均匀度指数以春季最高,为2.2127;优势度指数则以夏季最高.各科蝴蝶物种丰富度指数以蛱蝶科（Nymphalidae）最高,为32.     

山羊乳上皮黏蛋白MUC1基因和蛋白多态性的研究

本研究的目的 是从基因水平上检测四川省地方山羊品种乳上皮黏蛋白MUC1的遗传多态性.根据GenBank中山羊MUC1部分基因序列设计引物,用PCR方法扩增出山羊MUC1基因的不同数目串联重复区,长度为1.7～2.2 kb.在4个地方山羊品种(品系)中共检测到3个乳MUC1等位基因和5种基因型,其中纯合型的比例高,基因型和基因频率存在品种(品系)间的差异.本研究为检测山羊乳MUC1遗传多态性提供了可靠的方法.     

Adenovirus-mediated transfer of RA538 gene and its antitumor effect

The RA538 cDNA was transferred into human ovarian cancer cell line SK-OV-3 and human melanoma cell line WM-983A by its recombinant adenoviral vector constructed through homologous recombination. It was demonstrated that the recombinant adenovirus could transfer RA538 gene with high efficiency, and could obviously inhibit tumor growth, with the inhibiting rates of 85% and 73% respectively, at the same time greatly repress the colony forming ability of the cells. The therapeutic experiments on transplanted subcutaneous tumor model in nude mice demonstrated that RA538 could significantly inhibit tumor growth. Flow cytometry and DNA fragmentation analysis indicated that RA538 could induce the cell cycle G1 arrest/apoptosis of the tumor cells. The expression of cmyc gene was found pronouncedly reduced by Western blot analysis. These results suggest that the RA538 recombinant adenovirus could be a promising drug in cancer gene therapy.     

水稻分蘖节位生产力比较

以籼型杂交稻(Oryza sativa) ‘汕优63’为供试材料, 在田间单株稀植条件下(100 cm × 50 cm)进行试验, 保留主茎1个节位、2个节位和4个节位, 其中节位处理分低节位、中节位和高节位, 每个植株通过人工去除特定节位分蘖, 都保留16个分蘖穗和相同的一次、二次和三次分蘖的构成。在此条件下研究了主茎和2-9节位一次、二次和三次分蘖的经济产量。试验结果如下: 1)主茎总叶数和穗重随分蘖节位减少和节位上移而增加。2)在相同分蘖节位条件下, 一次分蘖的平均穗重表现为高节位>中节位>低节位; 二次分蘖的平均穗重在1个节位时表现为中节位>高节位>低节位, 在2和4个节位时表现为高节位>中节位>低节位; 三次分蘖的平均穗重在1个节位时表现为中节位>高节位>低节位, 2个节位时表现为中节位>低节位>高节位, 在4个节位时表现为高节位>中节位>低节位。3)整个分蘖穗重的平均值在1个节位时和在2个节位时都表现为中节位>高节位>低节位, 在4个节位时表现为高节位>中节位>低节位。4)分蘖穗重平均值的不整齐度(占主穗的百分比)随着利用节位上升而增加, 但这种趋势随节位数的增加而变缓。上述结果表明, 低节位分蘖尽管出现的时间早, 有更多的叶片数, 但不一定比中、高节位分蘖有更高的经济产量。要正确比较低、中和高节位生产力, 必须在相同分蘖利用节位、相同的分蘖数和相同的分蘖构成前提下。