lBM Pc机上的核酸顺序数据库及其检索方法

我们在微型电脑IBM PC机上开发了一个核酸顺序数据库及其管理和分析系统。该库数据丰富且能更新,管理和分析软件系统功能强,结构设计合理、灵活,检索和管理比较方便。本文介绍了该库的作用及其各种检索方法。分析程序系统NASA(Nucleic Acid Sequence Analysis)将另文发表。     

检测致病基因的“探针”

你体内存在致病基因吗?如果存在的话,你有办法发现它们吗? 最近,美国加利福尼亚州的研究人员提出一种方法,可以帮助那些无家族遗传病史,但体内具有潜在遗传疾病的病人找出具有致病能力的有害基因。     

猪圆环病毒2型ORF2编码基因真核表达载体的构建及表达

根据GenBank中猪圆环病毒2型(PCV-2)ORF2基因序列,设计了1对引物,应用PCR从含有PCV-2的PK-15细胞中扩增出ORF2基因,将其克隆入pSecTag2载体中,构建了pSecORF2载体。又设计一条含信号肽序列的上游引物,以pSecORF2为模板,扩增出含信号肽序列的ORF2基因,将其克隆到pIREShyg载体上,构建了pIRESiORF2真核表达载体。然后通过磷酸钙共沉淀法转染CHO细胞,进行表达。间接免疫荧光实验(IFA)成功检测到pIRESiORF2在CHO细胞中的表达。这为进一步研究ORF2编码蛋白的生物学活性及建立PCV诊断试剂盒打下基础。     

农药污染对水稻田土壤反硝化细菌种群数量及其活性的影响

在实验室条件下,研究了农药污染对水稻田土壤反硝化细菌(Denitrfying bacteria,DNB)种群数量及其反硝化活性的影响。结果表明,紫色稻田土壤、黄松稻田土壤和红壤稻田土的DNB种群数量范围分别为59．04×10⁴～157．59×10⁴、42．89×10⁴～108．97×10⁴和32．14×10⁴～75．30×10⁴cfu·g^-1,稻田土DNB种群数量和土壤NO3^-的消耗量之间具有正相关性。在1kg干土中加入1mg丁草胺或呋喃丹,能刺激DNB的生长及其反硝化活性,在1kg干土中加入5mg多菌灵、10mg丁草胺或呋喃丹,对DNB的生长及其反硝化活性有明显的抑制作用,丁草胺和呋喃丹施后7d,多菌灵施后14d,对水稻田土壤的DNB种群数量和反硝化活性抑制作用达到最大,然后逐渐减轻,最后呈现一定的促进作用。     

中国苏云金芽孢杆菌的分布与cry基因的多样性

采集全中国27个省、自治区及4个直辖市昆虫孳生地粉尘、土壤等样品1080份,在其中的406份中分离到苏云金芽孢杆菌965株.镜检可观察到大菱形、小菱形、方形、长方形、圆形、椭圆形、镶嵌形和不规则形等8种主要形态的伴孢晶体;采用cryⅠ、cryⅡ、cryⅢ、cryⅣ和cryⅤ基因的通用引物对221株Bt分离株进行的PCR检测结果表明各类基因的含量依次为cryⅠ＞cryⅡ＞cryⅤ＞cryⅢ基因,分别占被检菌株的75.6%、67.9%、58.4%和14.5%,没有检测到cryⅣ基因,共得到10种基因组合类型.对其中含有cryⅠ基因的菌株分别以cryIAc、cryIC和cryIE基因的特异性引物进行PCR检测,得到20株同时含有cryIAc、cryIC、cryⅡ和cryⅤ优良基因组合的Bt分离株,其中菌株Bt-15A3对棉铃虫、甜菜夜蛾及小菜蛾均表现出高毒力,具有生产开发潜力.     

色彩对茶园昆虫的引诱力

为评估色板用于监测和诱捕茶园害虫的可能性,于10月份茶园昆虫盛发期在绍兴和杭州分别选有机、无公害茶园,同时使用10种粘性色板大面积诱捕茶园昆虫和蜘蛛.每种色彩重复10次.结果表明:(1)在两片供试茶园捕获的目、科和种类基本相同.蜘蛛很少.24 h后,绍兴茶园中10种色板共捕获9目53科10200个昆虫和蜘蛛;72 h 后杭州茶园中捕获10目63科21526个昆虫和蜘蛛.(2)同翅目为优势类群.绍兴茶园中,纯白色板诱捕的同翅目种数占该色板捕获的总物种数的15.2%、同翅目个体数占该色板捕获的总个体数的34.1%;其它9种色板诱捕同翅目种数占各自捕获总种数的21.2%～31.0%、同翅目个体数占各自捕获总个体数的45.8%～75.4%.杭州茶园中,纯白、湖蓝和天蓝色板诱捕同翅目种数小于各自捕获的总种数的20%、同翅目个体数小于各自捕获的总个体数的51%;其它7种色板诱捕同翅目种数大于各自捕获的总种数的22.7%,果绿和墨绿诱捕的同翅目个体数占各自诱捕的总个体数的48.6%和49.8%,桃红、素馨黄、土黄、芽绿和桔黄诱捕的同翅目个体数占各自诱捕的总个体数的55.5%～78.1%.绍兴茶园中,素馨黄和芽绿诱捕的粉虱、假眼小绿叶蝉和广翅蜡蝉分别占两种色板诱捕的总个体数的67.7%和50.1%;杭州茶园中,素馨黄和芽绿诱捕的这几种害虫总数分别占二者诱捕的总个体数的70.7% 和59.2%.(3) 捕获的主要是害虫,绍兴茶园中诱捕的害虫数是天敌的1.63倍,杭州茶园中诱捕的害虫数是天敌的2.23倍.(4)色板之间引诱的种数和个体数差异显著.素馨黄和芽绿诱捕的种数和个体数最多、被捕昆虫的群落多样性指数很小,对叶蝉、粉虱和蜡蝉的引诱力最强;土黄和桔黄诱捕的种数和个体数较多、多样性指数较小,对同翅目昆虫的引诱力较强;纯白色诱捕的种数和个体数居中、多样性指数最大,即诱捕的各种昆虫的个体数差别小;果绿、桃红、墨绿和湖蓝诱捕的种数和个体数明显较少、多样性指数也较小;天蓝色诱捕的种数和个体数最少.(5) 寄生蝇类偏嗜蓝色,缨小蜂类、茧蜂类和小蜂类偏嗜芽绿色.建议将素馨黄和芽绿色板与信息素组合,分别用于监测和诱捕叶蝉和粉虱.     

中国二叉蚜属研究及三新种记述(同翅目：蚜科)

本文记述中国二叉蚜属Schizaphis Borner 6种,其中包括3新种：贴梗海棠二叉蚜Schizaphis(Schizaphis)chaenometicola Zhang,sp.nov.,香草二叉蚜Schizaphis(Schizaphis)hierochlophaga Zhanget Chen,sp.nov.和长管二叉蚜Schizaphis(Schizaphis)longituberclata Zhang et Qiao,sp.nov.,并附亚属、种检索表。模式标本存放中国科学院动物研究所标本馆。     

人分裂细胞核抗原基因片段的筛选、测序及对启动子的分析

经６．６×１０５个克隆筛选,从装在λ噬菌体载体Ｃｈａｒｏｎ３０中的人基因库中筛选到了一个含人分裂细胞核抗原（ＰＣＮＡ）基因的克隆。经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析插入基因长约１４ｋｂ,有较长的５＇上游区,但３＇端缺少一部分。经亚克隆和测序已确定从５＇上游１２６３ｂｐ到３＇端与λ载体接点共４９６９ｂｐＰＣＮＡ基因片段的核苷酸序列。将ＰＣＮＡ基因启动子核苷酸序列与ＤＮＡ聚合酶α,拓扑异构酶Ⅱα,胸苷酸激酶基因的启动子进行比较有３０％以上同源性,具有“看家基因”特征。在转录起始点的５＇上游几百ｂｐ的范围内都有与ＣＡＴ,ＳＰ１,Ｅ２Ｆ,ＮＦＨＢ,Ｏｃｔ１和ＡＴＦ等转录因子的结合位点相似的核苷酸序列。     

直距翠雀花中的降二萜生物碱

从直距翟雀花（Ｄｅｌｈｉｎｉｕｍ ｏｒｔｈｏｃｅｎｔｒｕｎ Ｆｒａｎｃｈ．）全草的甲醇提取物中分离得到了３个降二萜生物碱,通过ＮＭＲ,ＭＳ等波谱分析将其结构鉴定为７,１０－二羟基８,１、４,１６三甲氧基１９,２０－二去氢乌头烷（７β,８β,１４α,１６β）（１）,２０－乙基－２,３－二去氢－６,１０二羟基－７,８－二氧亚甲菜－１,１４,１６－三甲氧基乌头烷（１α,６β,１４α,１６β）（２）和翼北