高压氧配合蝮蛇抗栓酶治疗脑血栓与单用蝮蛇抗栓酶、高压氧及脉通丹参疗效对比

高压氧配合蝮蛇抗栓酶治疗脑血栓与单用蝮蛇抗栓酶、高压氧及脉通丹参疗效对比解放军第二六九医院内科金秀英,邓杏林近年来采用高压氧配合蝮蛇抗栓酶联合治疗,脑血栓１６１例,取得显著疗效。报告如下：一、临床资料：治疗组１６１例均为住院病人,其中男性１２２例,女...     

MicroRNA对多细胞动物复杂性进化的影响

MicroRNA(miRNA)是一种长度约为22个碱基的非编码单链小分子RNA。作为一类重要的转录后基因表达调控因子,miRNA参与了广泛的生物学过程,如发育时程调控、细胞分化、凋亡、肿瘤以及病毒抵抗等。然而,除了在个体发生过程中的重要功能外,越来越多的研究表明,miRNA在系统发生中也扮演着关键的角色。基因表达模式的不同被广泛地认为是物种内和物种间表型差异的根源,动物物种间miRNA的保守性和多样性研究提示miRNA对物种间表型差异以及动物进化起着重要的作用。文章介绍了miRNA产生过程和作用机制,重点探讨了miRNA在动物进化过程中的作用,从miRNA的进化速度、miRNA表达的时空特异性、miRNA作用靶位点变异以及miRNA基因的扩增与丢失4个方面论述miRNA介导的基因调控网络对多细胞动物发育复杂性进化的影响,推测miRNA在多细胞动物进化过程中驱动了复杂性的增加。     

免疫酶技术及其对副流感病毒(仙台株)抗原的定位观察

采用辣根过氧化物酶标记抗体的方法,对副流感病毒(仙台株)抗原在组织细胞内的繁殖部位进行了光学显微镜和电子显微镜的观察。在受病毒感染的小鼠肺切片上,多数细支气管上皮细胞及部分肺泡细胞胞浆内呈明显阳性;在体外实验中,受感染的单层人胚肾细胞的胞桨膜、胞浆膜表面的病毒颗粒以及部分胞浆均可见阳性反应。此外,本文还对结果的特异性,酶标记技术中抗原的固定,酶与免疫球蛋白的结合以及酶标记抗体进入组织细胞等方法学问题进行了一些探讨。     

用Epstein-Barr病毒转化技术建立分泌人单克隆抗体B淋巴细胞系的条件

用以去除T淋巴细胞的E—玫瑰花形成法中所用的羊红细胞(SRBC),其保鲜程度对EB病毒转化B淋巴细胞的结果有一定影响,用保存1天的SRBC者,转化细胞的抗体分泌时间较长(8～10周),并且能形成传代细胞系;用保存17天的SRBC,转化细胞的抗体分泌时间较短,未能无限传代。分离外周血单个核细胞时,保留自体粘附细胞作为饲养细胞,转化的细胞二个月的成活率可达75％,而不保留粘附细胞者,转化细胞成活率仅40％。能产生抗-HBc抗体的EBV转化细胞,自然分泌抗体时间一般不超过10周,高峰期在3周以内,第2周时最高。EB病毒感染后的转化细胞5天开始克隆,一般细胞难成活,在14天克隆的,成活率可达100％。21天开始克隆的转化细胞,免疫球蛋白自然分泌维持12周以上,而在35天开始克隆的细胞,维持分泌的时间都不超过10周。以未经γ线照射的小鼠腹腔渗出细胞作饲养细胞,可支持转化3周的细胞克隆扩增,克隆成活率可达100％,而对照组克隆成活率仅为64.7％。     

GoPipe: 批量序列的Gene Ontology 注释和统计分析

随着后基因组时代的到来,批量的测序,特别是 EST 的测序,逐渐成为普通实验室的日常工作 . 这些新的序列往往需要进行批量的 Gene Ontology (GO) 的注释及随后的统计分析 . 但是目前除了 Goblet 以外,并没有软件适合对未知序列进行批量的 GO 注释,而 GoBlet 因为具有上载量的限制,以及仅仅利用 BLAST 作为预测工具,所以仍有许多不足之处 . 开发了一个软件包 GoPipe ,通过整合 BLAST 和 InterProScan 的结果来进行序列注释,并提供了进一步作统计比较的工具 . 主程序接收任意个 BLAST 和 InterProScan 的结果文件,并依次进行文本分析、数据整合、去除冗余、统计分析和显示等工作 . 还提供了统计的工具来比较不同输入对 GO 的分布来挖掘生物学意义 . 另外,在交集工作模式下,程序取 InterProScan 和 BLAST 结果的交集, 在测试数据集中,其精确度达到 99.1% ,这大大超过了 InterProScan 本身对 GO 预测的精确度,而敏感度只是稍微下降 . 较高的精确度、较快的速度和较大的灵活性使它成为对未知序列进行批量 Gene Ontology 注释的理想的工具 . 上述软件包可以在网站 (http://gopipe.fishgenome.org/ ) 免费获得或者与作者联系获取 .     

水稻和其他禾本科植物基因组多倍体起源的证据

基因加倍(Gene duplication)被认为是进化的加速器。古老的基因组加倍事件已经在多个物种中被确定,包括酵母、脊椎动物以及拟南芥等。本研究发现水稻基因组同样存在全基因组加倍事件,大概发生在禾谷类作物分化之前,距今约7000万年。在水稻基因组中,共找到117个加倍区段(Duplicated block),分布在水稻的全部12条染色体,覆盖约60％的水稻基因组。在加倍区段,大约有20％的基因保留了加倍后的姊妹基因对(Duplicated pairs)。与此形成鲜明对照的是加倍区段的转录因子保留了60％的姊妹基因。禾本科植物全基因组加倍事件的确定对研究禾本科植物基因组的进化具有重要影响,暗示了多倍体化及随后的基因丢失、染色体重排等在禾谷类物种分化中扮演了重要角色。     

南极eel Pout(Lycodichthys dearborni)多聚体Ⅲ型抗冻蛋白基因的克隆及进化分析

冰冻海洋中生存的南极eelpout（Lycodichthys dearborni）体内能合成高浓度的Ⅲ型抗冻蛋白（AFPⅢ）。为了寻找新的AFPⅢ基因，构建了L．dearborni肝脏cDNA文库。通过斑点杂交筛选此文库，发现一个2．87kb的cDNA克隆，LD12。序列分析采用DNAssist2．0和ClustalX 1．8软件。结果显示，LDl2分子由12个串联重复的片段构成，每一个片段编码一个61个氨基酸（aa）的Ⅲ型抗冻蛋白分子和一个9aa的连接子。这是第一次在合成AFPⅢ的极地鱼类中发现这样的多聚蛋白结构基因。有趣的是，组成、结构和起源都不相同的抗冻糖蛋白AFGP，其基因也呈现类似的多聚蛋白结构的现象。因此，这种独特的多聚基因结构可能是鱼类基因组在适应极端寒冷的环境中采取的一种普遍方式。     

ortholog ——— 概念、生物信息预测方法和数据库

orthologs指起源于不同物种的最近的共同祖先的一些基因。orthologous的基因,具有相近甚至相同的功能,由相似的途径调控,在不同的物种中扮演相似甚至相同的角色,因此在基因组序列的注释中,是最可靠的选择。orthologs的生物信息预测方法主要有两类：系统发生方法和序列比对方法。这两类方法都是基于序列的相似性,但又各有特点。系统发生方法通过重建系统发生树来预测orthologs,因此在概念上比较精确,但难于自动化,运算量也很大。序列比对方法在概念上比较粗糙,但简单实用,运算量相对较小,因此得到了较广泛的应用。