烟草脉扭病毒基因组部分序列的克隆和分析

烟草脉扭病毒(Tobacco vein distorting virus,TVDV)是引起烟草丛顶病的两种病毒之一.TVDV被归为黄症病毒科的暂定成员.应用黄症病毒科的通用引物和根据马铃薯卷叶病毒属成员核酸序列设计的简并引物,通过RT-PCR从烟草丛顶病烟株总RNA中扩增到了TVDV基因组的部分序列.序列分析获得了长度为1654 bp的序列,编码推测的TVDV复制酶基因的部分序列、外壳蛋白基因及运动蛋白基因的全部序列.根据这三个基因编码的氨基酸序列构建的分子进化树分析表明,TVDV为黄症病毒科的确定成员.根据其基因间隔区的长度特征和各ORF编码的氨基酸的分子进化分析,我们推测TVDV应当是马铃薯卷叶病毒属的一个新成员.这是TVDV的分子生物学特征的首次报道.     

侵染菊花的番茄不孕病毒的鉴定及其外壳蛋白基因的克隆

从菊花花叶病标样中分离到一球形病毒分离物,直径25～29 nm,与TAV抗血清反应呈阳性.根据英国报道的番茄不孕病毒(TAV-En)CP基因序列,设计合成一对引物,对该病毒RNA进行RT-PCR扩增,得到与预期大小相符的特异扩增带.将其克隆到pGEM-T easy中,经酶切和序列分析表明所克隆的是TAV CP基因,与已知的6个株系相应序列同源性均在96.4%以上.     

Dicer结构和功能研究进展

摘要: Dicer蛋白是RNA干扰机制的关键组分, 负责siRNA和miRNA的产生。它主要由RNA解旋酶结构域、PAZ结构域、RNaseⅢ结构域和双链RNA结合结构域构成。Dicer的结构特点决定了它所产生的小RNA的结构特点。不同生物体具有不同数量的Dicer, 各Dicer既有功能上各自独立的特点, 同时又有功能的冗余和交叉, 而在进化过程中, Dicer的数量逐渐减少, 功能却逐步整合从而表现出多功能的特点。对Dicer结构和功能进行深入研究, 有助于了解Dicer乃至整个RNAi及相关途径的作用机制, 也有助于揭示它们在进化过程中所表现出的规律和特点。文章对上述Dicer结构及功能特点作简要综述。     

仙人掌丛枝病植原体CWB1株系16SrRNA基因克隆及序列分析

对表现丛枝症状的仙人掌植株总DNA进行植原体 1 6SrRNA基因PCR扩增 ,得到一条约 1 5kb的特异片段 ,表明植株中有植原体存在 ,将此植原体株系命名为CWB1。把此特异片段与pGEM Teasy载体连接并转化到大肠杆菌JM1 0 9感受态细胞中 ,通过PCR鉴定、限制性内切酶 (EcoRI)酶切分析及核苷酸序列分析 ,均表明克隆成功。序列分析结果显示 ,此株系的 1 6SrRNA基因全长 1 489个碱基 ,与属于植原体 1 6SrⅡ C亚组的Fababeanphyllody植原体同源率最高 ,为 99 7%。通过 1 6SrRNA基因核酸序列同源性比较 ,认为该株系属于 1 6SrⅡ C亚组 ,基本确定了其分类地位。     

病毒的侵染策略和植物的防卫反策略

病毒对植物的侵染及植物对病毒侵染的抵抗实际上是病毒与寄主植物之间相互作用的结果,病毒和寄主植物共同参与调控植物的亲和反应及防卫反应。     

水稻谷胱甘肽磷脂氢过氧化物酶的热稳定性研究

谷胱甘肽磷脂氢过氧化物酶是唯一能够直接还原生物膜上脂类过氧化物的过氧化物酶．本文利用圆二色光谱（CD）、内源荧光光谱和差示扫描量热仪（DSC）研究了温度对谷胱甘肽磷脂氢过氧化物酶（OsPHGPx）活性及其构象变化的影响．在温度为 20－27.5℃ 期间,随着温度的逐渐升高,OsPHGPx 的活性逐渐上升,到 27.5℃ 时达到最大值;在 27.5－45℃ 时,随着温度逐渐升高,其活性迅速下降;当温度超过45℃时,其活性完全尚失. 在20－40℃,CD 光谱、内源荧光光谱和 DSC 均没有发生明显变化,暗示OsPHGPx 的结构基本保持完整;在 40－55℃,CD 光谱显示该酶二级结构发生去折叠;内源荧光光谱的变化暗示该酶三级结构发生去折叠．其中在40－45℃,DSC显示该酶可能存在两个去折叠中间体．当温度超过 55℃ 时,整个酶的构象不再发生变化,呈现去折叠状态．     

长春花黄化植原体核糖体蛋白基因片段序列分析*

对自然表现典型黄化症的长春花植株总RNA进行植原体核糖体蛋白基因（ribosomal protein gene,rp gene）PCR扩增,得到约1.3kb的特异片段。将此特异片段与pGEM-T Easy载体连接并转化到大肠杆菌JM109感受态细胞中,通过PCR鉴定、限制性内切酶(EcoRI)酶切分析、核苷酸序列测定及分析,结果表明该株系核糖体蛋白基因片段长1,44bp,包含rp122、rps3基因,分别编码129和252个氨基酸,且这两个基因为重叠基因。该植原体核糖体蛋白基因特性与其它植原体相似。     

幽影病毒属病毒的研究现状与展望

幽影病毒是一类较为特殊的植物病毒,其基因组不编码外壳蛋白,因此不形成通常的病毒粒体结构。这类病毒可以通过机械摩擦方式传播,在黄症病毒的帮助下也可以通过蚜虫传播。幽影病毒属病毒由7个确定种和3个暂定成员组成,烟草丛顶病毒是目前国内发现的幽影病毒属唯一成员。幽影病毒的寄主范围较窄,体外抗性也较差。幽影病毒感病组织中含有大量dsRNA。有些病毒还含有卫星RNA。幽影病毒的基因组为单分体的 ssRNA,编码4个非结构蛋白,其中的ORF3蛋白在病毒RNA的稳定性及寄主体内的长距离运输中起到非常重要的作用。文章综述了国内外幽影病毒的研究现状,并对未来的相关研究趋势和研究领域进行了展望。