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几种分子生物学方法在菌种鉴定中的应用 总被引:17,自引:1,他引:17
REP-PCR指纹法、PCR-RFLP分析法、16S rDNA序列分析法在生物多样性研究、菌种鉴定、及微生物资源的开发应用中得到了广泛的应用,但最高分辩能力及适用性各不相同。该文采用上述方法对从厦门温泉分离刊的嗜热菌进行了鉴定分析,并对GeneBank数据库中的同源性较近的细菌16S rDNA序列进行比较,结果发现:在这三种鉴定方法中,REP-PCR法最简单,分辨能力最强,可鉴别16S rDNA序列同源性大于99.5%甚至完全相同的不同菌株;16S rDNA分析能快速准确地对微生物进行分类鉴定,它在分类学中的核心地位不可替代,但当16S rDNA序列同源性大干99.5%时难以获得准确的鉴定结果;PCR-RFLP法分辨力弱,可用于种到属水平的研究,16S rDNA序列相似性在96%以上,酶切图谱就难以区分了,但在不经过微生物分离培养的原位微生物多样性的研究中仍具有重要的作用。 相似文献
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大黄鱼虹彩病毒腺苷三磷酸酶(ATPase)基因的克隆与表达 总被引:1,自引:0,他引:1
虹彩病毒(iridovirus)是一类对鱼类、两栖类和爬行类水生动物具有广泛感染性的致病病原,由虹彩病毒所致疾病给世界水产养殖业造成了巨大的经济损失.近年来,许多国家相继报道了在患病鱼、蛙和龟等水生经济动物中分离到虹彩病毒[1-4]. 相似文献
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应用噬菌体随机肽库技术筛选丙肝病毒NS3抗原模拟表位 总被引:7,自引:0,他引:7
以抗-HCV NS3的单克隆抗体作为固相筛选分子,对人工合成的噬菌体随机12肽库进行5轮"吸附-洗脱-扩增"的筛选过程,随机挑取42个克隆,经噬菌 体酶联免疫吸附法(ELISA)鉴定并进行交叉反应实验以及竞争抑制性结合实验,最后对所选克隆进行DNA序列分析,以确定HCV NS3抗原的模拟表位.经噬菌体富集后,从随机筛选的 42个克隆中得到11个阳性克隆,确定氨基酸序列XXIXXXXMSNXX为HCV NS3的模拟表位.我们用噬菌体12肽库成功筛选得到HCV NS3的模拟表位,为开展用HCV模拟表位探索HCV的防治研究创造了条件. 相似文献