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数据归一化技术对研究结果的分析具有重要的作用.在定量PCR实验中,通常利用稳定表达的看家基因作为实验数据归一化的内参,但最近的研究表明,这些看家基因的表达量在不同的生理病理过程中也表现出显著的变化,不适合作为数据归一化处理的基准.针对这一问题,提出一种新的数据处理技术,利用单细胞归一化方法(percellome),对定量PCR检测miRNA表达的数据进行处理,显著提高了数据处理的准确性.以8周龄/40周龄小鼠脑为实验材料,选择14种microRNA的表达情况进行了检测.在研究中,将3种不同拷贝数的人工合成的RNA片段(spike RNA)作为内参加入到样品中,用于microRNA表达检测的归一化基准.研究发现,未经处理的microRNA单细胞拷贝数的变化范围为2.0×105~4.3×105,而经单细胞归一处理,上述表达变化范围为2到26倍.该项研究还发现,看家基因U6 ncRNA和5S rRNA的表达水平存在显著的变化,在以基因组DNA为归一化基准时,其表达量变化为1.5和4.8倍,而在以RNA水平为归一化基准时,其表达量变化为5.8和3.8倍,表明这些基因不适合作为数据处理的基准.据此,为microRNA的定量研究提供了一种新的、可靠的归一化方案. 相似文献
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采用年轮分析法对岩溶区青冈栎样树年轮和生物量进行测定并对其群落生物量进行估算。研究结果显示,青冈栎平均树龄46a,平均胸径20.52cm,单位地上生物量为98.668t.hm-2。随着植株的生长,胸径越大则生物量越大,两者形成明显的幂函数关系。d、e、f、g和h样树地上生物量为2.884、22.567、108.183、134.314和379.799kg,生物量分配状况是主干>枝条>树叶,大部分的生物量分配在主干,生物量随着胸径的增大明显加大。 相似文献
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设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序。分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系。结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%~84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%~90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%~94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小。进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远。 相似文献
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采用样地调查法,对赣中南观光木种群及群落特征进行了研究。结果表明:观光木种群分布格局呈集群分布,径级结构为衰退型。观光木所在群落有维管植物60科94属112种,植物生活型以高位芽植物为主,占总种数的69.64%。植物区系起源古老,成分复杂,具有明显的热带性质。群落除Pielou指数较高外,其它各种多样性指数偏低,各样地间多样性指数有一定的差异;测度观光木所在群落物种多样性时,4种多样性指数未表现出相同的趋势,Simpson指数和Pielou指数在群落不同层次的变化规律为:灌木层>草本层>乔木层,Shannon-wiener指数和物种丰富度指数在群落不同层次的变化规律为:灌木层>乔木层>草本层。观光木本身的生物学特性和人类掠夺式的破坏是导致观光木种群濒危的主要原因。 相似文献
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以大米草的互花米草为材料,研究了不同盐浓度对其细胞膜透性、丙二醛(MDA)含量和光响应曲线的特征参数的变化情况。结果表明:盐浓度低于300mmol·L-1时,互花米草细胞膜透性和MDA含量较对照组无显著差异;其较高的最大光合速率(>30μmol·m-2·s-1),表观量子效率(>0.05mol·mol-1Photons)以及较低的暗呼吸速率(<1.5μmolCO2·m-2·s-1)和光补偿点(<20μmol·m-2·s-1)为其有机物质积累、竞争、建立种群并扩散提供条件。盐浓度高于500mmol·L-1时,互花米草膜透性和MDA含量显著上升,最大光合速率(Amax)及表观量子效率(Q)显著下降,暗呼吸速率(Rday)和光补偿点(LCP)上升。表明细胞膜和光合作用有关酶受到迫害,抑制了其正常生长。盐胁迫下互花米草光合速率降低,但蒸腾速率的显著下降提高了单叶水分利用效率,从而部分缓解了渗透势变化对细胞的迫害,为其生存和生长提供条件。 相似文献