日本扁柏核基因组微卫星的分离与鉴定

以日本扁柏4个种源的DNA样品为材料,经NdeⅡ酶切并电泳后回收300～1000bp DNA片段,与含有生物素标记的(CT)15探针杂交,再用磁珠(Dynabeads M280 streptavitin beads)固定杂交产物,成功地实现了日本扁柏核基因组微卫星的高效分离。以pUC118 BamH Ⅰ／BAP为载体,E．coli如为寄主,构建了日本扁柏2个富含微卫星的基因组文库,共获得2200多个阳性克隆。从构建的基因组文库中,随机挑选480个阳性克隆进行测序,发现含有微卫星的克隆比例高达65．6％,其中215个非同源性克隆共含有380个微卫星位点,平均每个克隆含1．7个。微卫星种类以与探针(CT)15互补的(GA／CT)。为主,占86．1％,同时还存在(TG／AC)。和3～4个碱基为单元构成的微卫星,如(ATAG)n、(CAGA)n、(TGA)n、(ACG)n、(TCA)n、(TCT)n等。利用Oligo5．1软件为114个含有微卫星的克隆共128个微卫星位点设计出了PCR扩增引物。     

一种切口平移法制备生物素标记核酸探针的简便方法

用切口平移法制备生物素标记的核酸探针,其所用试剂质量稳定、可靠,标记重复性好,且制备的探针易长期保存.我们在制备人IL-6 cDNA等基因探针的实验中,对常规的切口平移法制备生物素标记核酸探针的方法作了简化改进,省略了分离步骤,经斑点杂交试验证明效果良好.     

白细胞介素的分子生物学研究

现代生化技术和分子克隆技术使白细胞介素(Interleukine,IL)的研究进入黄金时代。已经阐明六种IL的生物学功能和生化特性并建立了基因无性繁殖系。这些工作对于从理论上寻求免疫活性细胞相互调控的分子机制和探索自身免疫性疾病、免疫缺陷病和恶性肿瘤等难症的发病机理具有极大促进作用。基因重组白细胞介素(rIL)将成为前程无量的临床治疗用生物制剂。     

猫儿山不同海拔植被带土壤微生物群落功能多样性

为研究中亚热带森林土壤微生物群落功能多样性特征及其随海拔梯度的变化,应用Biolog微平板技术,对猫儿山不同海拔植被带(常绿阔叶林(EBF)、落叶阔叶混交林(DBF)、针阔混交林(CBF))土壤微生物群落功能多样性差异进行了比较。结果表明,不同海拔植被带土壤微生物群落功能多样性差异显著。土壤平均颜色变化率(AWCD)随培养时间延长而逐渐增加,随着海拔升高,土壤AWCD值逐渐降低,大小顺序为EBFDBFCBF。土壤微生物群落Shannon指数和丰富度指数的总体趋势为EBF最高,DBF次之,CBF最低。不同海拔植被带土壤微生物群落均匀度指数之间差异不显著。不同海拔植被带土壤微生物对不同碳源的利用能力存在差异,其中EBF利用率最高,CBF利用率最低,氨基酸类、胺类和酯类碳源为各海拔植被带土壤微生物利用的主要碳源。主成分分析结果表明,主成分1和主成分2分别能解释变量方差的40.42%和15.97%,在主成分分离中起主要贡献作用的是酯类、胺类和氨基酸类碳源。土壤理化性质与土壤微生物群落功能多样性之间的相关性分析结果表明,微生物群落多样性的Shannon指数与全钾(TK)呈极显著正相关(P0.01),与含水量呈极显著负相关(P0.01),与总有机碳(TOC)、全氮(TN)、速效氮(AN)、有效P(AP)之间的相关性显著(P0.05)或极显著(P0.01),且为负相关。土壤TK含量和含水量可能是造成不同海拔土壤微生物群落功能多样性差异的主要原因。     

原发性及狼疮性肾病综合征患者血清PAI-1、Lp(a)水平变化及其临床价值探讨

目的:探讨原发性及狼疮性肾病综合征患者纤溶酶原激活物抑制因子1(PAI-1)和血清脂蛋白a[Lp(a)]的水平变化及其检测的临床应用价值。方法:选取病理类型明确,临床初诊为肾病综合征的患者138例。其中原发性肾病综合征70例,为PNS组;系统性红斑狼疮继发性肾病综合征患者68例,为LNS组。同期选取本院健康体检正常者64例,为正常对照NC组。全自动生化分析仪检测各组血清Lp(a)和血脂等指标;酶联免疫吸附(Elisa)法测定血清PAI-1水平。结果:1与NC组比较,血清Lp(a)和PAI-1水平在PNS和LNS两组中均显著升高(P0.05),PNS组比LNS组升高更为明显,差异有统计学意义(P0.05);2LP(a)与PAI-1秩相关系数(rs)分析,在PNS组中r_s=0.328,P=0.006,LNS组中r_s=0.439,P=0.006;3二元logistic回归分析表明,LP(a)和PAI-1均是PNS和LNS的危险因素;4ROC曲线分析表明,血清Lp(a)、PAI-1对PNS和LNS诊断的ROC曲线下面积(AUC~(ROC))分别为0.895、0.874和0.848、0.813,两者联合检测对PNS和LNS诊断的AUC~(ROC)分别为0.947和0.919。结论:血清Lp(a)与PAI-1水平在PNS和LNS患者体内均明显升高,PNS患者升高更为显著;Lp(a)与PAI-1水平在PNS和LNS患者中均显著正相关;LP(a)和PAI-1均是PNS和LNS的危险因素,两者水平的变化与PNS和LNS的发生相关。联合检测Lp(a)与PAI-1水平对PNS和LNS的诊治具有一定的临床应用价值。     

猫儿山铁杉相邻植株冠层机械磨损对枝叶性状的影响

机械磨损是邻体植物冠层接壤区域的重要生态过程之一, 对枝叶生理和形态特征具有重要影响。但是, 当前非常缺乏邻体植物冠层机械磨损对枝叶功能性状影响特征和权衡机制的深入研究。该研究以广西猫儿山的铁杉(Tsuga chinensis)为对象, 通过比较邻体冠层间机械磨损区优势枝、劣势枝与非机械磨损区的叶面积、叶长、叶宽、叶厚、比叶面积、叶干物质含量、叶干质量、末端枝含水率和枝直径的差异, 分析枝叶功能性状在机械磨损影响下的变异和权衡关系。结果显示: 机械磨损显著影响邻体冠层叶干物质含量、比叶面积和叶干质量。具体而言, 机械磨损区优势枝叶干物质含量显著大于劣势枝和非机械磨损区, 优势枝比叶面积显著低于劣势枝和非机械磨损区, 劣势枝叶干质量显著低于优势枝和非机械磨损区。其次, 机械磨损对枝叶性状关系的影响格局不同。叶面积-叶长在机械磨损区优势枝、劣势枝和非机械磨损区间表现出一致的正向关系; 叶面积-叶宽、叶面积-叶干质量、叶宽-叶厚、叶厚-末端枝直径和叶长-叶宽仅在机械磨损区优势枝显著正相关; 叶面积-末端枝直径和末端枝直径-末端枝含水率仅在劣势枝显著负相关; 叶干物质含量-叶厚仅在劣势枝显著正相关。其余性状关系在机械磨损区优势枝、劣势枝和非机械磨损区均不显著。以上结果表明, 森林植物邻体间的冠层机械磨损可显著改变枝叶功能性状的权衡关系。     

小麦HMW-GSIDx5基因在小麦不同发育阶段表达的研究(英文)

小麦面粉的烘烤品质与其高分子量谷蛋白5亚基（HMW－GSIDx5）基因的表达有关。本文从该基因的组织、器官特异性和特定发育阶段的表达特性等方面,对其在小麦发育过程中表达的变化规律进行了研究,从分子水平为小麦的栽培和育种提供依据。显微切割普通小麦钢82－122的ID染色体长臂为模板,扩增该基因400bp的片段为探针（Fig．1）,并经重组后测序（Fig．2）确认扩增无误。小麦苗期、生长期、开花期及成熟期分别取样、分离总RNA、做斑点（Fig．3,4＆5）或Northern杂交（Fig．6）、并扫描足量（Fig．7）。结果表明：该基因只在籽粒中表达（Fig．3,4＆5）,从开花15天起（Fig．4）,逐渐增加,至腊熟期达最高,以后渐次降低（Fig．6＆7）,有趣的是：在干种子和萌发种子亦有少量表达（Fig．1）。Cressey和陈和等方曾报告在开花15天可检测到HMW－GS蛋白。     

微泡菌属菌株YPW1和YPW16多糖降解特性分析

【背景】海洋环境中分离到的微泡菌属菌株具有多糖降解能力,在环境中可以作为糖类代谢的重要执行者参与海洋碳循环过程。【目的】测定2株微泡菌属菌株的多糖降解活性,通过与微泡菌属其他菌株基因组比较分析2株菌的多糖降解基因特征。【方法】通过3,5-dinitrosalicylicacid(DNS)定糖法测定多糖降解活性,同时利用高通量测序技术对菌株基因组序列进行测定与组装,并与其他基因组注释结果进行比较分析。【结果】分离得到2株微泡菌属菌株YPW1和YPW16,二者均为潜在新种。结果表明,菌株YPW1能够降解琼胶、褐藻胶、果胶、几丁质、木聚糖、淀粉、普鲁兰等7种多糖,而菌株YPW16仅可降解淀粉和普鲁兰。基因组分析表明,YPW1具有上述7种多糖的降解酶基因,但菌株YPW16只具有淀粉酶与普鲁兰酶降解基因。相较于其他微泡菌属菌株,菌株YPW1多糖降解范围、多糖降解酶基因种类与丰度较高,但菌株YPW16多糖降解范围却较为狭窄。由此可知,多糖降解酶基因在微泡菌属基因组中的分布差异性较大。【结论】本研究为微泡菌属提供了2株潜在的新型菌株资源,为生物多糖降解提供了生化工具,也为研究微泡菌属菌株中多糖降解基...     

抗氧化酶过表达对趋磁螺菌MSR-1耐氧性的影响

在格瑞斯瓦尔德磁螺菌(Magnetospirillum gryphiswa ldense)MSR-1中分别过量表达3种抗氧化酶Fe-超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶和过氧化氢酶HPII,并分析过量表达这3种酶对趋磁螺菌MSR-1耐氧性的影响。通过PCR分别扩增大肠杆菌DH5α的Fe-超氧化物歧化酶(sodB)、谷胱甘肽过氧化物酶(btuE)、过氧化氢酶HPⅡ(katE)基因序列,将前两个片段分别连接到广宿主质粒pBBR1MCS-2上,后一个片段连接到广宿主质粒pBBR1MCS-5上,构建成表达质粒pBBR1MCS-sodB,pBBR1MCS-btuE和pBBR1MCS-katE,将3个质粒通过双亲接合转移的方法分别转入趋磁螺菌MSR-1。3种抗氧化酶过表达对趋磁螺菌MSR-1耐氧性影响的试验结果为过量表达Fe-超氧化物歧化酶对菌体生长影响不明显;过量表达谷胱甘肽过氧化物酶、过氧化氢酶HPII使趋磁螺菌MSR-1致死。上述试验结果表明抗氧化酶系在菌体耐氧过程中的全局协调调控的重要性。