面向新一代基因组测序技术的序列拼接算法

随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生。介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算法的优缺点以及适用范围。用Helicobacter acinonychis的Illumina 1G测序数据检测SSAKE,VCAKE,SHARCGS以及velvet的性能,并对未来拼接算法的研究提出展望。     

不规则抗体筛查对临床输血的意义

目的:探讨不规则抗体的筛查在临床输血中的意义。方法:对2009年5月至10月间本院6300例输血患者做不规则抗体筛查,抗体筛检阳性者做进一步鉴定,分析抗体特异性,总结各抗体出现频率。结果:半年来检测病例6300例,检测出不规则抗体阳性9例,阳性率0.14%,其中抗-D抗体2例,抗-DC抗体1例、抗-E抗体2例,抗-e抗体1例,抗-M抗体3例。还检测出自身抗体3例及高度冷凝集1例。结论:不规则抗体筛选应作为输血前检查之常规,对保障临床用血、预防溶血性输血反应具有极其重要的意义。     

一种新的人脑信息传输复杂性的研究

我们在过去的工作中曾用Ｋｏｌｍｏｇｒｏｖ复杂性（简称ＫＣ）来研究人脑信息传输的过程。但计算ＫＣ时需要对序列作粗粒化。粗粒化过程很容易丢失许多有意义的细节。为此,本文提出一种新的复杂性测度,即Ｃ０复杂性。我们认为复杂运动时间序列是由规则运动部分时间序列及随机运动部分时间序列组成的,因此Ｃ０复杂性就被定义为随机运动部分时序与时间轴所围区域的面积与整个复杂运动时序与时间轴所围区域面积之比。Ｃ０复杂性测度在计算过程中避免了粗粒化,因而较之ＫＣ等复杂性测度能更好反映序列的动力学性质。计算Ｃ０复杂性的关键是怎样从一复杂运动时序中找到规则部分时间序列。     

菘蓝特性及栽培措施的研究

板蓝根和大青叶是临床上广泛应用的两味中药,但由于市场上品种混杂,真假难辨,直接影响了疗效。为发展正品药材,作者对原植物菘蓝的特性及栽培措施进行了研究。     

引黄水库藻类变化特征及其影响因素研究

以济南鹊山引黄水库为研究对象,系统研究了2008-2012 年间其水中浮游藻类的种类和数量变化特征以及藻类细胞密度与总氮、总磷浓度的相关性,并在实验室模拟条件下分析了温度、光照、氮磷营养盐等条件对其藻类生长影响。结果表明,该水库水藻密度年际、年内变化较大,年平均值均在500 万个/L 以上,藻种共7 个门,37 个属,蓝藻和硅藻为水库的优势藻种。该水库藻类生长的最佳温度为25℃,光强为3 000 lx,氮磷营养盐对藻类生长影响排序为硝酸盐>磷酸盐>亚硝酸盐>氨氮。磷可能是藻生长的限制性因子,在夏、秋季及水库磷浓度大幅变化时易发生水华。     

玉米化感物质异羟肟酸的研究进展

介绍了异羟肟酸在玉米植株中的分布和玉米根系分泌物中异羟肟酸的分析方法．丁布(DIM-BOA)是玉米植株中含量最大的异羟肟酸．不同玉米品种之间异羟肟酸含量的差异很大．种子不含异羟肟酸;但萌发后其含量迅速增加,在萌芽几天后的幼苗植株其含量达最大值,随后逐渐下降;在玉米生长发育的不同时期,幼嫩叶片内异羟肟酸含量始终较高;地上部分异羟肟酸的浓度高于根系．植株异羟肟酸的浓度受生长环境条件影响显著,在紫外辐射、黑暗条件或水分胁迫下其含量明显增加．在各种禾谷类作物中,玉米根系分泌物内含异羟肟酸较高;铁的存在能显著增加玉米根系分泌物中异羟肟酸的含量．     

克隆选择的动力学模型

本文建立了抗原对于抗体生成的克隆选择的一个动力学模型。一种抗原虽然可能同多种抗体结合,并通过同装配在淋巴细胞膜上的抗体(即细胞表面受体)的结合促进它们的克隆,但是由于选择作用,只有一种抗体以及产生它的细胞可以同这种抗原的特定的抗原决定簇达到稳定的定态或稳定的周期状态。在我们的模型中,究竟选出哪一种抗体取决于抗体同抗原的结合常数,抗原同受体结合后促进细胞增殖的能力,以及细胞的寿命。     

以Ⅳ型胶原酶为靶点的细胞内表达单链抗体的抗肿瘤作用

Ⅳ型胶原酶(包括MMP-2和MMP-9)与肿瘤的侵袭转移和恶性进展密切相关. 通过构建可在真核细胞内质网表达抗Ⅳ型胶原酶scFv M97抗体基因的真核表达载体, 应用脂质体LipofectAMINE法对人高转移性肺巨细胞癌PG细胞系进行基因治疗. 研究结果表明, 细胞内表达scFv M97对PG细胞Ⅳ型胶原酶分泌、PG细胞生长及体外侵袭能力具有显著的抑制作用, 并能明显降低PG细胞裸鼠体内成瘤性, 延长动物存活时间. 以上结果提示胞内抗体技术可以在蛋白加工、分泌这一关键步骤从根本上抑制Ⅳ型胶原酶的活性, 在肿瘤基因治疗中具有重要的应用前景.