双序列比对基础和应用实例

首先介绍序列比对的分子生物学基础,即核酸序列基本单元核苷酸和蛋白质序列基本单元氨基酸。文中以精心设计的图表列出四种核苷酸和二十种氨基酸的名称、性质和分类。第2节简述序列比对基础,包括相似性和同源性基本概念、整体比对和局部比对、点阵图方法、动态规划和启发式算法、计分矩阵和空位罚分,以及常用软件和分析平台。第3节介绍核酸序列比对中常用计分矩阵DNAfull,蛋白质序列比对中常用计分矩阵BLOSUM62和PAM250。第4-8节则以血红蛋白、多肽毒素、植物转录因子、癌胚抗原和唾液酸酶为例,介绍双序列比对的具体应用。通过这些实例,说明如何选择分析平台和比对程序、如何设置计分矩阵和空位罚分,如何分析比对结果及其生物学意义。文末进行简要总结。     

椪柑营养诊断的DRIS初步标准

自1973年Beaufils提出综合诊断施肥法(Diagnosis and Recommendation Integrated System,简称DRIS)^[1]后,Sumner等人相继制订了大豆^[2]、玉米^[3]、甘蔗^[4]、马铃薯^[5]和小麦^[6]等农作物的DRIS标准,并在生产中获得了广泛的应用。但在柑桔生产中,直到1984年Beverly等人才建立伏令夏橙的DRIS标准^[7]。而对椪柑的DRIS标准则至今尚未见报道。本文根据庄伊美等报道的福建省24个高产(亩产2000-5000公斤)椪柑园的资料^[8],试图制订椪柑的DRIS初步标准,以供生产上应用之参考。     

分子生物学数据库及相关软件的开发利用

生物大分子序列和结构测定技术的完善和应用,使核酸及蛋白质序列数据库及蛋白质结构数据库迅速增长。面对不断增长的分子生物信息,很多生物学工作者又在此基础上构建了具有特殊生物学意义和专门用途的二次数据库,使得数据库的内容和种类更加丰富和具体,为生物学各个领域的深入研究提供了坚实的信息基础。由法国生物信息研究中心Ｉｎｆｏｂｉｏｇｅｎ提供的生物数据库目录ｄｂｃａｔ〔１〕可以使用户对目前世界各地提供的分子生物信息数据库有一个详尽的了解。ｄｂｃａｔ本身也是一个具有一定数据格式的数据库,按ＤＮＡ、ＲＮＡ、蛋白质…     

矮樱桃果实发育的解剖学研究

利用石蜡制片法解剖研究魏樱桃果实的发育过程,将其发育过程分为３个时期：（１）果实细胞旺盛分裂和增大期：外果皮细胞垂周分裂,以增加果实表面积;中果皮和内果皮主要进行平周分裂３以增加细胞层数,同时３层果皮的细胞体积也增大。（２）内果皮细胞硬化期：外果皮和中果皮的细胞停止分裂,体积增大也不明显,内果皮细胞壁逐渐加厚、硬化。９３）中果皮细胞显著增大期：中果皮的细胞的体积弦向增大的同时,径向延长更明显。其成     

α-淀粉酶抑制剂AAI的核磁共振氢谱谱峰归属及结构分析

α－淀粉酶抑制剂ＡＡＩ（α－Ａｍｙｌａｓｅ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）是从墨西哥苋属植物Ａｍａｒａｎｔｈｕｓ ｈｙｐｏｃｈｏｎｄｒｉａｃｕｓ种子中提取的由３２个氨基酸残基组成的多肽。它能强烈地抑制几种昆虫幼虫的α－淀粉酶活性,而不抑制人及哺乳类动物的α－淀粉酶活性。使用核磁共振方法收集了ＡＡＩ的二维氢谱谱图,完成了全部主链和绝大部分侧链质子共振峰的序列归属,并利用Ｘ－ＰＬＯＲ软件计算出ＡＡＩ的三维结构。     

诺卡氏菌属中的两个新种

由土壤中分离的两株诺卡氏菌形放线菌A-100菌株和186菌株．经鉴定,其形态和细胞壁化学组分均属诺卡氏菌属,但培养特征和生理生化特性与该属中的已知种不同。因此认为这两株菌是诺卡氏菌属中的两个新种,并分别命名为鲜黄诺卡氏菌Nocardia galba n.sp和绛红色诺卡氏菌Nocardia purpurea n. sp.。     

放线菌目中的一个新属

自我国云南省热带植物园的土壤中,分离到一株好气中温放线菌Y388。该菌株气丝蓝灰色,粉状,形成直形或柔曲气生孢子丝,孢子卵圆或短杆状,表面光滑或略粗糙。基丝深灰至黑棕,分隔井有断裂和自溶。产生淡紫色至青灰色可溶性色素。细胞壁为“型+赖氨酸,全细胞水解液含半乳糖。DNA中G+c含量为69 54克分子％。根据该菌株的形态和细胞壁化学组分与现有放线菌目中已知属的不同,因此成立新属——异壁放线菌属Actinoalloteichusgen．N．。典型种为蓝灰色异壁放线菌Actinoalloterichus cyanogriseus n. sp.。典型菌株为Y388。     

大黄鱼卵母细胞发生的研究

大黄鱼(Pseudosciaena crocea)是我国黄海南部、东海和南海的主要经济鱼类之一。关于大黄鱼生物学方面的研究,其种族问题已有记载;另外对大黄鱼性成熟的特性、性成熟与生长的关系,个体生殖力及卵子和稚鱼的形态特征等方面都作了研究(徐恭昭等,1962;郑文莲等,1962;沙学绅,1962)。然而,对大黄鱼性腺发育往往仅从外形上加以描述,缺乏卵母细胞发生方面的组织学研究。本文主要为这一内容提供些资料。