高通量测序技术分析新疆新源县过度放牧土壤细菌多样性

【目的】利用新疆伊犁州新源县过度放牧导致的退化草原土壤样品,揭示其细菌的菌群多样性。【方法】通过Illumina Hi Seq 2500测序技术,分析6个退化草原土壤细菌的菌群结构及多样性。【结果】细菌群落Chao1指数平均值为2 118.28,Shannon指数平均值为8.84。细菌群落主要属于Actinobacteria、Proteobacteria、Firmicutes、Gemmatimonadetes等35个门,Phingomonadaceae、Gemmatimonadaceae等220个科,Sphingomonas、Rubrobacter等329个属,在科属水平上未知菌类分别占31%和56.1%。固氮细菌共有9个属,自生固氮菌中Arthrobacter和Methylobacterium的丰度最高,而根瘤菌中Bradyrhizobium和Rhizobacter的丰度较高。【结论】虽然6个退化草原土壤样品中细菌类群具有丰富的多样性,但很多种类丰度特别低,可能正趋向灭绝。     

肠道菌群与抗生素相关性腹泻的关系

肠道菌群作为分布在人体肠道内的微生物菌群,对发挥肠道正常生理功能起到了至关重要的作用。临床研究表明,大量使用广谱性抗菌药物会打破肠道菌群的平衡,导致抗生素相关性腹泻(Antibiotic-associated diarrhea,AAD)。然而,不同的肠道菌群与AAD的关系不尽相同。本文分别从致病菌导致AAD的机制、益生菌预防和治疗AAD的原理,以及条件致病菌与AAD的关系等方面进行综述,旨在为肠道菌群与AAD的研究提供理论依据,同时为临床上更精准地预防、诊断和治疗AAD提供参考。     

从不同地区网柄菌中分离和纯培养的共生放线菌

收集从采自中国甘肃省、贵州省和吉林省不同环境土壤中分离得到的网柄菌菌株,并从网柄菌中分离与其共生的放线菌。采用放线菌选择培养基(改良高氏1号),通过平板划线法分离放线菌;利用16S rRNA基因序列同源性分析确定培养的放线菌的分类学地位。结果显示：3个省的网柄菌中共分离到放线菌3种55株;从甘肃省的6种网柄菌的20个菌株中纯化培养出28株放线菌,分属为2目3科3属3种,其中微杆菌属为优势属,占89%;从贵州省的6种网柄菌的10个菌株中纯化培养出17株放线菌,皆为氧化微杆菌Microbacterium oxydans;从吉林省的8种网柄菌的8个菌株中纯化培养出10株放线菌,分属于2目2科2属2种,微杆菌属为优势属,占90%。结果表明,环境因素对网柄菌携带共生放线菌种类的影响大于网柄菌物种差异的影响,从碱性土壤的网柄菌中更容易分离得到与其共生的放线菌菌株。     

聚己内酯静电纺丝纳米纤维支架用于小鼠诱导多能干细胞培养

干细胞联合生物支架材料体外构建功能性组织与器官,成为当前组织再生研究的重要策略,而探求具有良好生物相容性的支架材料是其关键.本研究采用扫描电镜、噻唑蓝（MTT）法、荧光显微染色等方法检测小鼠诱导多能干细胞（murine induced pluripotent stem cells, miPSCs）在聚己内酯（poly ε-caprolactone, PCL）静电纺丝纳米纤维支架上的粘附、增殖等生物学特性,探究聚己内酯纳米纤维支架与miPSCs的生物相容性. 结果显示,miPSC在PCL纳米纤维支架上具有良好粘附性并呈集落样生长,其增殖能力及干性标记物（Oct4-GFP+）的表达均不亚于标准对照组;扫描电镜显示,miPSC在PCL纳米纤维支架材料上呈现出绒毛状突起的表面结构.上述结果表明,PCL纳米纤维支架可促进miPSCs的粘附、自我增殖以及干性维持,两者具有良好的生物相容性,为下一步联合生物支架材料与干细胞构建功能性组织奠定了基础.     

一个新的Br蛋白基因部分序列测定及分析

从新疆北部艾比湖分离纯化到极端嗜盐古生菌AB1,采用PCR方法扩增了其16S rRNA基因（16S rDNA）和编码螺旋C至螺旋G的细菌视紫红质（bacteriorhodopsin,Br）蛋白基因片段,并测定了基因的核苷酸序列。基于16S rDNA序列的同源性比较及系统发育学研究表明,AB1是Natronococcus属中新成员。通过对菌株AB1的Br蛋白亲水性分析表明,AB1的Br蛋白与已报道Br蛋白有类似的超二级结构,进一步的蛋白质序列聚合比对结果表明,AB1中Br蛋白螺旋C至螺旋G的氨基酸序列与其他菌株差异明显。研究结果表明菌株AB1的Br蛋白是一种新的Br蛋白。Abstract: A strain of halophilic archaeum AB1 was isolated and purified from Aibi Lake located in the north of Xinjiang Uygur Autonomous Region. Partial DNA fragment encoding a bateriorhodopsin (Br) protein as well as 16S rRNA of AB1 was amplified by PCR, and their nucleotide sequences were determined subsequently. On the basis of homology and phylognetic analysis about 16S rRNA gene (16S rDNA), it could be speculated that the strain AB1 is a novel member of the genus Natronococcus. The hydrophathy analysis of Br fragment revealed that the AB1 Br had a transmembrane heptahelical structure similar to that of other Brs. On the other hand, homology alignment using the deduced partial amino acid sequence of Br protein of AB1 with other Br proteins showed that AB1 Br protein is obviously different to others. These facts indicated that the Br in halophilic archaeum AB1 is a new Br protein.     

基于16S rRNA测序技术分析乳源性复合益生菌对糖尿病小鼠肠道菌群的影响

该研究旨在从肠道菌群角度研究乳源性复合益生菌对db/db糖尿病小鼠的作用机理。将32只db/db糖尿病小鼠分为模型组,阳性药(二甲双胍)组,复合益生菌高、低剂量组,8只db/m鼠作为正常对照组。采用ELISA法测定糖化血红蛋白(glycosylated hemoglobin,type A1C,HbA1c)、血清总胆汁酸(total bile acid,TBA)、血清胰高血糖素样肽1(glucagon-like peptide 1,GLP-1)水平,采用16S rRNA测序技术分析各组小鼠肠道菌群变化情况。结果显示与模型组相比,高、低剂量复合益生菌均能显著降低HbA1c、血清TBA水平,升高血清GLP-1水平;模型组小鼠肠道菌群结构较正常组发生变化,复合益生菌组小鼠肠道菌群结构较模型组发生变化;在菌属水平,模型组Proteobacteria、Enterobacteriaceae等富集,复合益生菌低剂量组norank＿f＿＿Lachnospiraceae、Lachnospiraceae＿UCG-006、Butyricicoccus、Anaerotruncus等富集,复合益生菌高剂量组Esc...     

在猫听分析器周緣部分噪音对短声的掩盖作用的数量特性

声音掩盖現象(即对某一声音的听敏度由于另一声舌的干扰而降低)在听觉生理学上是較被注意的問題。这一方面因为在声音掩盖的条件下,可引起一些类似在听觉器官某些病理状态吋发生的功能变化,因此声音掩盖可作为研究听觉器官这些病理状态的实驗     

抗氧化系统研究新进展

氧化还原系统主要由活性氧、自由基、活性氧生成系统和抗氧化系统组成。大量的研究表明,氧化还原系统在机体多种生物学功能中发挥关键的调节作用。抗氧化系统主要包括酶类抗氧化剂和非酶类抗氧化剂。抗氧化系统一方面可以通过调节活性氧的水平影响各种生物学功能,另一方面各种酶类抗氧化剂和非酶类抗氧化剂本身也可以参与多种生化反应,调节机体功能。近年来的研究表明,机体内除了典型的抗氧化酶,如超氧化物歧化酶和过氧化氢酶等,还存在多种抗氧化新型抗氧化酶,如硫氧还蛋白、谷氧还蛋白和金属基质蛋白酶等。在本文中,我们将回顾近年来的一些文献,综述抗氧化系统的研究新进展,旨在为抗氧化系统的深入研究提供理论基础。     

不同种植年限薰衣草根际土壤真菌群落结构的演变

土壤真菌群落结构和多样性对植物生长起着重要作用,了解种植年限对薰衣草根际土壤真菌群落结构的影响对薰衣草病害防治和增产的研究具有重要意义。探究不同种植年限薰衣草根际土壤真菌群落结构和多样性特征,及其随种植年限的演变规律。采集新疆伊犁霍城县种植年限1、3、5 a,以及未种植薰衣草土壤,对ITS序列进行Illumina高通量测序。对测序结果进行分析,比较各样品组真菌多样性和群落分布规律及与种植年限的关联。结果表明,Alpha多样性分析显示随着种植年限的增加Shannon指数逐渐降低,而Chao1指数先降低后增高。在种植薰衣草土壤中共检测到12个门,28个纲,72个目,146个科,236个属。在门水平上,子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、球囊菌门(Glomeromycota)为优势菌门。随着种植年限的增加,子囊菌门相对丰度逐渐降低,担子菌门逐渐增高,而球囊菌门先增加后降低。在属水平上优势菌属为Xylodon、锐孔菌属(Oxyporus)、镰刀菌属(Fusarium)、枝孢属(Cladosporium),均属于植物致病菌。随着种植年限的增加,Xylodon...