细胞穿膜肽的穿膜活性与序列特征的关系

细胞穿膜肽(cell penetrating peptides,CPPs)是一种小分子多肽,能够容易地穿过细胞膜.这类分子,尤其是具有靶向功能的CPPs为高效率投送药物到靶细胞带来希望.因此,对其展开研究对于生物医学有着一定的意义.本工作主要从序列水平对具有不同穿膜活性的CPPs进行研究,试图找出影响CPPs穿膜活性的因素,以及不同活性CPPs与非穿膜肽(Non CPPs)序列上的差异,并引入一种分析生物序列的方法.我们基于CPPsite数据库和不同的文献获取CPPs和Non CPPs序列,并进一步从CPPs序列中提取具有高、中、低穿膜活性的穿膜肽(HCPPs、MCPPs、LCPPs)用于构建数据集.基于这些数据集,开展了以下研究:首先,利用方差分析的方法,对不同活性的CPPs以及Non CPPs的氨基酸及二级结构组成进行分析,发现氨基酸的静电与疏水相互作用对CPPs的穿膜活性起到了重要影响,同时螺旋结构和无规卷曲也会影响CPPs的穿膜活性;其次,使用理化性质与长度将不同活性的CPPs展示在二维平面上,发现在某些特殊的性质下不同活性的CPPs与Non CPPs可以产生聚簇现象,HCPPs、MCPPs以及LCPPs和Non CPPs被分成了三簇,这种现象显示了它们之间的差异;最后,本文引入了生物序列理化质心的概念,将组成序列的残基看作质点,进而把序列抽象成质点系进行研究,并将此方法应用到CPPs的分析中,通过PCA方法将不同活性的CPPs投射到三维平面上,结果发现绝大部分CPPs聚在一起,部分LCPPs与Non CPPs聚在一起.此工作对于CPPs的设计,以及理解不同活性CPPs序列上的差异具有一定的意义.另外,本文引入的生物序列理化质心的分析方法也可以用于其他生物问题的分析,同时它们可以作为某些生物分类问题的输入参数,在模式识别中起到一定的作用.     

CSE1L在绝经后女性骨关节炎滑膜细胞中的作用探究

目的:探讨CSE1L在绝经后女性骨关节炎滑膜细胞中的表达及其作用和机制。方法:通过RT-PCR、Western blot以及免疫组化的实验方法检测和比较CSE1L在绝经后女性骨关节炎和创伤截肢患者关节滑膜细胞中的表达,不同浓度TNF-α或TNF-α抗体处理的关节炎滑膜细胞中CSE1L的表达;采用si RNA干预其骨关节炎滑膜细胞中CSE1L的表达后,通过RT-PCR、ELISA以及Western blot检测其TNF-α的表达和分泌情况。结果:RT-PCR以及Western blot结果均提示绝经后女性骨关节炎滑膜细胞中CSE1L的表达较创伤截肢患者关节滑膜细胞显著增高(P0.01,P0.001)。对CSE1L进行si RNA干预降低其表达水平后,CSE1L表现出与TNF-α浓度呈正相关的变化趋势;此外,在对CSE1L进行敲减以降低其表达水平后,绝经后女性骨关节炎滑膜细胞中TNF-α的表达水平变化提示其受到CSE1L调节。结论:CSE1L可能通过调节TNF-α的表达促进绝经后女性骨关节炎的发展。