茶渍属地衣的一个中国新记录种

INTRODUCTION The lichen genus Lecanora is characterized by asci of the Lecanora-type, colorless ascospores, and crustose thalli;     

关于高通量测序背景下生物信息学教学的一些建议

高通量数据背景下,生物信息学已成为解决生物问题一门必备知识和工具,本文从生命科学的现实背景出发,探讨了高通量测序时代关于生物信息学课程的教学内容、教学方式和教学目的方面的一些建议。期望通过现代生物信息学课程的设计和讲授,使学生及时掌握利用生物信息学处理前沿问题的能力,强化生物信息学实践教学中技能的培养,培养在获取、处理、开发和利用等方面有较强的研究能力和实践能力的生物信息技术人才,提高生命科学相关专业学生的社会就业竞争力。     

乌司他丁联合利奈唑胺对重症肺炎患者血清PCT、CRP、TNF-α及白细胞计数的影响

目的:探讨乌司他丁联合利奈唑胺对重症肺炎患者血清降钙素原(PCT)、C-反应蛋白(CRP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及白细胞计数的影响。方法:选择2014年2月-2018年2月在我院住院诊治的重症肺炎患者128例,根据治疗方法的不同分为观察组68例与对照组60例,对照组给予利奈唑胺治疗,观察组在对照组治疗的基础上给予乌司他丁治疗,两组都治疗观察2周,检测和比较两组治疗后临床疗效,治疗前后1秒钟用力呼气量占用力肺活量比值(FEV1/FVC)、血清PCT、CRP、TNF-α水平及白细胞计数的变化情况。结果:观察组与对照组的治疗总有效率分别为94.1%和76.7%,观察组的总有效率显著高于对照组(P0.05)。观察组与对照组治疗后的FEV1/FVC值、白细胞计数均显著高于治疗前(P0.05),且观察组以上指标明显高于对照组(P0.05)。观察组与对照组治疗后的血清PCT、CRP、TNF-α水平都显著低于治疗前(P0.05),且观察组以上指标均显著低于对照组(P0.05)。结论:乌司他丁联合利奈唑胺治疗重症肺炎患者能显著提高临床疗效,改善患者肺功能,可能与其降低血清PCT、CRP、TNF-α水平,提高白细胞计数有关。     

准噶尔小胸鳖甲短时低温胁迫响应的转录组分析

【目的】拟步甲科昆虫小胸鳖甲Microdera punctipennis是分布于中国新疆古尔班通古特沙漠的特有物种,具有很强的耐寒性,但其低温响应的分子机制尚不明确。本研究旨在利用转录组测序技术丰富小胸鳖甲的已知基因信息,分析在短时低温胁迫下,上调表达基因的主要类群及参与的主要代谢通路。【方法】利用Trinity软件对分别在4℃低温和25℃(对照)下处理3 h的小胸鳖甲成虫RNA-Seq数据进行从头组装,利用Blast2go软件进行基因注释。通过DESeq和GFOLD软件分析差异表达基因,并对上调表达基因进行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代谢途径富集分析。【结果】测序过滤后得到68 165 001个有效读序,51 712个平均长度为984 bp的非冗余基因,其中29 925个基因(约57.87%)有同源序列(E-value10-5),与拟步甲科的赤拟谷盗Tribolium castaneum相应基因相似性最高(核苷酸序列一致性为72.75%)。低温响应上调表达基因有514个,富集到35个GO类群,18个KEGG途径。其中胁迫响应类群、生物调节类群和免疫系统过程类群都占有重要比例,嘌呤代谢、硫胺素代谢、糖酵解/糖异生等代谢通路显著富集。在胁迫响应类群中,热激蛋白Hsp90基因、超氧化物歧化酶(SOD)基因和钙联接蛋白Calnexin基因等8个非生物胁迫相关基因显著上调表达。【结论】荒漠昆虫小胸鳖甲低温转录组揭示,在4℃冷驯化过程中,代谢过程、胁迫响应、生物调节和免疫系统等生物学过程相关基因表达显著上调,其中几个非生物胁迫响应基因提示小胸鳖甲可能从分子伴侣、细胞周期阻滞、线粒体稳定性、抗氧化胁迫等多方面应对低温胁迫。KEGG富集分析所揭示的小胸鳖甲在低温下的转录组代谢通路与其他物种有较大差异。研究结果为后续生物信息学分析及小胸鳖甲耐寒关键基因的发掘及耐寒机制的揭示提供了基础数据。     

新疆平茶渍属地衣生态分布与地理区系成分分析

根据多年的实地调查资料和前人研究资料,对新疆平茶渍属（Aspicilia）地衣的种类以及它们的分布区、区系特征进行了初步研究。结果表明,分布在新疆的平茶渍属地衣共有33种,主要分布在天山、阿勒泰山、昆仑山和准噶尔盆地。根据它们对环境的适应特征和选择性,将新疆平茶渍属地衣的地理区系划分为广布种、环极北极高山种、环极低北极及北方种、北美东部种、中亚种、中国特有种、分布范围不清楚的种等7种类型。同时把新疆平茶渍属地衣的地理分布区域划分为欧亚森林植物亚区、亚洲荒漠植物亚区、青藏高原亚区等三种分布区域。研究还发现分布在阿勒泰山、天山、昆仑山和准噶尔盆地的平茶渍属主要生长在岩石上面,生长基物比较单一。     

用支持向量机预测人类基因5'/3'选择性剪切位点

选择性剪切是调解基因表达的重要机制.识别选择性剪切位点是后基因组时代的一个重要工作.本文从最新的EBI人类基因选择性剪切数据库中,选取5＇/3＇选择性剪切位点作为正集,选取在剪切位点附近的假剪切位点作为负集,并把所有的选择性剪切位点和假剪切位点随机分成训练集和测试集.本文选用的预测选择性剪切位点的方法是基于位置权重矩阵和离散增量的支持向量机方法.此方法仅基于训练集,以不同位点的单碱基概率和序列片断的三联体频数作为信息参数,利用位置权重矩阵和离散增量算法结合支持向量机,得到了选择性供体位点和受体位点的分类器,并用此分类器对测试集中的选择性供体位点和受体位点进行预测.对独立测试集中的选择性供体位点和选择性受体位点的预测成功率分别为88.74%和90.86%,特异性分别为85.62%和81.19%.本文预测选择性剪切位点的方法成功率高于其它选择性剪切位点预测方法预测成功率,此预测方法进一步提高了对选择性剪切位点的理论预测能力.     

乌鲁木齐南部山区地生地衣群落分布格局

为了查明乌鲁木齐南部山区地生地衣群落分布格局,作者选取了24个样点(20 m×20 m),设置了240个50cm×50 cm样方,调查地生地衣的种类及盖度,分析其分布格局及其与环境因子的关系.结果表明,乌鲁木齐南部山区共有地生地衣17种,隶属于2目5科10属.聚类分析和DCA排序将该地区的地生地衣分为4个主要样点组,分...     

乌鲁木齐市小型兽类群落特征与分布格局初步研究

根据2002年7月的调查资料对乌鲁木齐市养禽场鼠类群落进行了研究。结果表明：该地区分布的鼠类可划分为2种群落,(1)褐家鼠 小家鼠群落;(2)小家鼠 灰仓鼠群落。同时对鼠类群落的多样性,均匀度等进行了初步研究。     

新疆维、哈、乌族中多指(趾)与否等4对遗传性状基因频率的分布

遗传学研究证明 ,多指 (趾 )与否 ,身体大部分多毛与否 ,棕色粘湿耳垢或灰色干燥耳垢和头发中有一绺白发与否等都是人类重要遗传性状。研究证明 ,以上 4对遗传性状的基因都分布于常染色体上 ,这些性状 (身体特征 )分别都由一对等位基因所控制[1] 。新疆维吾尔、哈萨克、乌孜别克族人群中以上 4对遗传性状及其基因频率的分布未见报道 ,因此 ,我们在 1998年分别对上述 3个民族的以上 4对遗传性状进行了调查。1　调查对象和方法1998年 2～ 6月对乌鲁木齐市、伊宁市、塔城地区的维吾尔、哈萨克、乌孜别克族男女进行以上 4对遗传性状调查。被调查…     

托木尔峰国家级自然保护区岩生地衣群落生态位研究

为了查明托木尔峰国家级自然保护区岩面生地衣对资源的利用和环境梯度分布规律, 采用样方法进行不同资源位群落调查, 利用生态位宽度、生态位相似性和生态位重叠指数测试了12 个岩面生地衣优势种群的生态位。结果表明, 丽石黄衣(B_i=0.6057; B_a=0.5804)、包氏微孢衣(B_i=0.5488;B_a=0.5374)、硬袋衣(B_i=0.4825;B_a=0.3825)、双缘衣(B_i=0.4615;B_a=0.3756)、皮果衣(B_i=0.4302;B_a=0.2682)等5 个种群的Shannon-Wiener 和Levins 生态位宽度最大, 广泛的分布在托木尔峰国家级自然保护区不同海拔的各个样点, 地衣种群的生态位相似性随着生态位宽度的增加而上升。从生态位重叠指数可知, 优势种群间生态位重叠现象较普遍, 但重叠值较低。说明在托木尔峰国家级然保护区岩面生地衣优势种群间因利用相同资源而产生的种间竞争较低, 群落稳定性较高。