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利用支持向量机预测II类MHC分子结合多肽 总被引:4,自引:0,他引:4
抗原多肽序列与主要组织相容性复合体(MHC)分子的结合是引起T细胞免疫应答的先决条件。对结合多肽序列的预测可以大大减少实验所需的费用和时间。我们用支持向量机(SVM)对HLA-DR4(B1*0401)编码的Ⅱ类MHC分子结合多肽进行了预测,将650个已知结合能力的多肽序列,按3:1的比例分成训练组和测试组进行训练和测试。对结合多肽,预测的准确率达到77.62%,对不结合多肽,准确率达到71.79%。这表明SVM方法鉴定用于免疫疗法的多肽片段是可行的。 相似文献
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从拟南芥幼苗中提取RNA,通过RT-PCR克隆得到海藻糖酶基因后,将其构建到原核高效表达载体pET30a( )上并在大肠杆菌BL21菌株中进行高效诱导表达,继而对纯化得到的海藻糖酶蛋白进行活性检测和酶学特性研究.实验结果表明,植物源的海藻糖酶基因在异体大肠杆菌中能够高效表达,纯化获得的海藻糖酶蛋白在试管条件下具有较高的海藻糖水解活性,其活性最适温度为45℃.通过GC-MS分离检测,可以明显地看到酶反应过程中底物海藻糖和产物葡萄糖的含量随反应时间变化的消长关系,这充分证明克隆基因在大肠杆菌中的表达产物具有海藻糖酶的功能. 相似文献
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赛罕乌拉国家级自然保护区红角鸮(Otus scops)的繁殖生态观察 总被引:1,自引:0,他引:1
为了解红角鸮(Otus scops)的繁殖状态,2009年5~8月,在内蒙古赛罕乌拉国家级自然保护区,以直接观察法对红角鸮的繁殖生态进行了研究。结果表明,所观察的4个巢址全部是以柳树为主干的树洞巢,巢内铺垫物较少或无铺垫,巢距地面的平均高度为91.3cm,巢内径平均为13.5cm,巢外径平均为15.0cm,巢深平均32.0cm(n=4)。平均窝卵数为3.75,对其中一窝进行测量,4枚卵平均量度是28.9mm×24.6mm,重量9.5g。雏鸟孵出后,雌性亲鸟承担主要育雏任务,雄性亲鸟日间停歇于离巢不远的树上负责警戒工作,夜间与雌鸟共同哺育雏鸟。小型鼬科动物的捕食可能是干扰红角鸮繁殖成功率的主要因素。 相似文献