抗体信息数据库北大核心CSCD

抗体是介导体液免疫的重要效应分子。近年来,随着治疗性抗体药物不断上市及其临床应用范围不断拓宽,治疗性抗体已成为生物制药的产业支柱。另一方面,随着抗体相关的基础研究日益深入和抗体序列、结构、功能表位等相关数据大量涌现,作为抗体数据管理、搜索与利用的重要工具,抗体资源库也层出不穷并得到长足发展,在相关的研究、开发、生产与销售中发挥日益重要的作用。本文对包括Kabat、IMGT、ab Ysis等在内抗体信息数据库进行介绍。     

应用KV-CBCT分析鼻咽癌调强放射治疗的摆位误差

目的:应用KV-CBCT分析鼻咽癌调强放射治疗时的摆位误差,为鼻咽癌调强放射治疗计划设计时CTV外扩PTV边界的大小提供参考。方法:选取30例IMRT的鼻咽癌患者,治疗过程中每周一次应用KV-CBCT采集患者治疗前的CT图像,将所得图像与定位CT图像进行匹配,分别测定X、Y、Z轴三个方向的摆位误差。结果:30例患者共拍摄168次KV-CBCT,获得168组摆位误差结果,群体摆位误差分别为X轴-0.15±1.43 mm,Y轴0.20±1.58 mm,Z轴-0.21±1.65 mm;根据Van Herk公式计算得到各方向的CTV-PTV外放边界值X、Y、Z轴分别为3.1 mm、3.3 mm和3.4 mm。结论:应用KV-CBCT影像系统可实时测量摆位误差并在线进行纠正,减小摆位误差,为CTV-PTV外放边界提供参考。     

加工方法对毛豆中大豆异黄酮苷元含量的影响及其对糖尿病小鼠的降血糖降血脂活性研究

本文比较不同处理方式下毛豆中大豆异黄酮苷元的含量,继而对冻干条件下处理的毛豆样品进行降血糖降血脂活性的研究。采用高效液相色谱(HPLC)法测定通过热烫、煮沸、冷冻、冻干、烘干从毛豆中提取出的大豆异黄酮苷元的含量。HPLC测定条件如下:色谱柱:Hypersil C18(250 mm×4.6 mm,5μm),流动相:甲醇-0.3%磷酸溶液(48∶52),流速:0.7 mL/min,测定波长:260 nm,柱温:25℃,进样量:20μL。留一组健康小鼠作为空白,将造模成功的ICR小鼠随机分为3组,分别用生理盐水,消渴丸,冻干毛豆,对其连续灌胃4周,4周后处死,测定其血糖和血脂指标。结果显示,冻干条件下,大豆异黄酮苷元含量最多(115.45μg/g),并且冻干的毛豆能够显著改善糖尿病小鼠的血糖和血脂水平。     

稻-鸭农作系统对稻田生物种群的影响

通过田间试验,研究了稻-鸭农作系统对稻田有关生物种群的影响.结果表明：稻鸭共育对稻田相关昆虫、杂草、病原菌等有害生物的发生和危害及天敌数量具有较大影响.与不养鸭相比,稻鸭共育后12 d和42 d, 水稻基部害虫飞虱及叶蝉的数量平均减少64.8%和78.5%;稻鸭共育后15 d和45 d,稻田杂草平均减少67.7%和98.1%;水稻分蘖高峰期和齐穗期的纹枯病病情指数分别降低了40.4%和62.0%.稻鸭共育还增加了稻田害虫天敌蜘蛛的数量,抑制了水稻害虫的危害.     

hIL-6·hIL-6Rα·gp130三元复合物的结构预测

通过Ｄｅｌｐｈｉ方法分析人白介素６（ｈｕｍａｎ ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ－６,ｈＩＬ－６）／人白介素６受体α亚基（ｈｕｍａｎ ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ－６ ｒｅｃｅｐｔｏｒ α ｓｕｂｕｎｉｔ,ｈＩＬ－６Ｒα）复合物、ｇｐ１３０（βｓｕｂｕｎｉｔ）的空间构象的表现静电分布,利用分子对接方法研究ｇｐ１３０和ｈＩＬ－６／ｈＩＬ－６Ｒα复合物作用成三元复合物的空间构象,经过分子力学优化、分子动力学常温动态模     

Three-dimensional structure and function study on the active region in the extracellular ligand-binding domain of human IL-6 receptor

In this study the three-dimensional (3-D) model of the ligand-binding domain (V106-P322) of human interleukin-6 receptor (hlL-6 R) was constructed by computer-guided ho-mology modeling technique using the crystal structure of the ligand-binding domain (K52-L251) of human growth hormone receptor (hGHR) as templet. Furthermore, the active binding region of the 3-D model of hlL-6R with the ligand (hlL-6) was predicted. In light of the structural characteristics of the active region, a hydrophobic pocket shielded by two hydrophilic residues (E115 and E505) of the region was identified by a combination of molecular modelling and the site-directed or double-site mutation of the twelve crucial residues in the ligand-binding domain of hIL-6R (V106-P322). We observed and analyzed the effects of these mutants on the spatial conformation of the pocket-like region of hlL-6 R. The results indicated that any site-directed mutation of the five Cys residues (four conservative Cys residues: Cyst 21, Cys132, Cys165, Cys1     

锰矿修复区植物生态系统自由能与化学势分析

基于热力学理论建立了生态系统Gibbs自由能方程,用以计算湘潭锰矿生态修复区植被系统的自由能(G)和物种化学势(μ)。生态修复区(及对照区)以泡桐(Paulownia fortunei)和栾树(Koelreuteria bipinnata)作为建群植物,总面积为4 hm~2,修复区泡桐和栾树的根际施用了含有自试验点废弃矿渣中筛选出的耐性菌株的有机菌肥,目的是为植物生长提供必要养分和降低根际土壤重金属毒性,对照区泡桐和栾树的根际施用了等量的化肥。泡桐和栾树种植后5 a期间,修复区与对照区均自然萌发生长了许多本土植物种类。试验结果表明,修复区植物种类数达到48,为对照区的3.7倍;修复区的总生物量、锰吸收量分别达到23324 kg/hm~2和4280 g/hm~2,为对照区对应值的20.6和2.6倍;修复区系统自由能G远远大于对照区的值,说明有机菌肥具有显著的改良污染土壤根际环境的效果。修复区和对照区植物种类之间的化学势μ均存在显著差异(P0.001),μ值差异范围分别为-3.79—6.76和-3.42—3.59,该一差异反映不同物种适应和修复锰污染环境的能力。G和μ值包含了生态系统生产力、生物多样性,植物种类生长势、重金属富集能力、生态学行为等综合信息,能反映生态系统与立地环境的关系和修复植物的生态学特性,可作为重金属污染区植被修复效果评价和修复植物筛选的重要指标。     

Hsp70-NP融合蛋白增强诱导HTNV NP特异性CTL的实验研究

本文采用纯化蛋白Hsp70-NP,NP,Hsp70分别免疫C57/BL6小鼠,取各组小鼠脾淋巴细胞进行淋巴细胞增殖试验和细胞毒试验.此外,为了获得细胞毒实验的靶细胞,本文还采用脂质体介导质粒pcDNA3.1/S转染黑色素瘤细胞B16,通过G418筛选稳定克隆,并用RT-PCR,Western blots以及免疫荧光染色证实N蛋白在胞浆中表达.淋巴细胞增殖实验表明,Hsp70-NP,NP组小鼠脾淋巴细胞均能够对体外抗原刺激产生增殖反应,而Hsp70-NP组的增殖指数明显高于NP免疫组.细胞毒实验结果表明,LDH的释放具有效应细胞依赖性,Hsp70-NP,NP免疫组脾淋巴细胞均可以特异性杀伤靶细胞B16-N,而Hsp70-NP免疫组的杀伤率显著高于NP免疫组.实验结果显示,Hsp70可以增强NP诱导产生特异性CTL的能力.本研究结果为进一步设计基于NP的合成肽疫苗或基因疫苗提供了重要实验依据.     

枯草芽孢杆菌中一种新型双向启动子的功能鉴定

本研究旨在通过转录组分析预测的方法,由地衣芽孢杆菌中筛选获得一种新型双向启动子,鉴定其启动强度。以已知强组成型启动子pShuttle-09为对照,检测其对克劳氏芽孢杆菌碱性蛋白酶基因的表达活性。成功构建了3种重组碱性蛋白酶表达载体及对应的工程菌株。在新型启动子pLA和其反向启动子pLB调控转录下,克劳氏芽孢杆菌碱性蛋白酶表达活性达到164 U/mL和111 U/mL。结果表明,pLA的启动强度明显高于pShuttle-09和pLB,pLA启动子与pLB启动子均可表达碱性蛋白酶。从而为枯草芽孢杆菌表达系统中异源基因的表达提供一个新的方向,也为原核生物中共同表达两种基因提供了新的思路。     

伴刀豆球蛋白A对培养静止软骨细胞形态和DNA合成的影响

培养的静止软骨细胞用ConA处理后,细胞形态从扁平形变成多角形、圆形与球形,同时可以观察到细胞周边存在大量的具有折光特点的细胞外基质。ConA能够完全抑制软骨细胞DNA的合成,LD_(50)为0.4—1.0μg/ml。ConA抑制DNA合成的作用是可逆的。20mmol/L的MeMan能够完全阻断其对软骨细胞形态和DNA合成的影响。