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木薯磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因全长cDNA克隆及表达分析 总被引:1,自引:0,他引:1
应用巢式PCR从木薯栽培种(Manihot esculenta)Arg7和野生种W14(M.esculenta subsp.flabellifolia)叶片中克隆到磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因pepc全长cDNA,GenBank序列号为JN387052和JN387053。cDNA全长2945 bp,含1个2895 bp的开放阅读框,预测编码的蛋白含964个氨基酸,具有磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶保守结构域。木薯PEPC与麻疯树和蓖麻的PEPC氨基酸序列具有高度同源性。表达分析表明pepc在W14和Arg7叶中的表达量最高,其次是须根和块根,茎中最低。单日表达量动态分析表明,Arg7叶中pepc总体表达量高于W14,但是16∶00后W14高于Arg7,推测两种木薯pepc调控区域存在差异。 相似文献
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海南部分荔枝种质资源亲缘关系的SSR分析 总被引:4,自引:1,他引:3
利用SSR标记对22份荔枝材料进行了亲缘关系分析,从32对引物中筛选出22对多态性引物用于荔枝SSR扩增,共扩增到52条带,其中多态性条带49条,多态性百分率为94.23%。多态性条带经POPGENE32软件统计分析表明,22个位点的平均有效等位基因频率(Ne)、平均基因杂合度(H)、平均Shannon遗传多样性指数(Hi′)分别为1.364 3、0.296 0、0.417 0。通过NTSYS聚类结果显示,在相似系数为0.51处,供试材料被聚为两大类,第一类包括13份材料,又可分为两个亚类,第二类包括9份材料。 相似文献
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从甘蓝型油菜与白菜型油菜的种间杂交获得的甘蓝型油菜(Brassica napus)中发现了雄性不育单株,兄妹交株系和不育株与甘蓝型油菜常规杂交F1和F2株系的育性分离分析表明,该不育材料属于双隐性雄性核不育类型.利用育性分离株系的可育株自交和可育株与不育株间兄妹交等方法筛选出7个纯合可育株系,等位测验表明这7个纯合可育株系(B1~B7)中存在两种基因型:Ms1Ms1ms2ms2和ms1ms1Ms2MS2.该材料对油菜核不育基因定位和杂种优势利用研究有重要意义. 相似文献
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基于PCR技术的miRNA定量检测方法 总被引:3,自引:0,他引:3
microRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中,不编码蛋白质的短序列RNA,它广泛参与真核生物的生长发育、新陈代谢和应激反应等生命活动。但绝大多数miRNA的生物学功能还不清楚,通过灵敏的定量检测方法,了解miRNA在不同组织部位的时空表达,是探究其功能的重要环节。现着重介绍了2类7种基于PCR技术的miRNA定量检测方法的基本原理和实验流程,并分析了这些定量检测技术间的异同和适用范围。 相似文献
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该研究以木薯(Manihot esculenta Crantz)Ku50为实验材料,采用RT-PCR方法从叶片中克隆了1个HD-Zip基因MeHB2。MeHB2基因含有882bp的开放阅读框,编码293个氨基酸。蛋白质保守结构预测显示,MeHB2编码的蛋白含有Homeodomain、Leu zipper和HD-Zip_N等结构域,属于HD-Zip II成员。进化树分析表明,MeHB2与麻疯树、杨树和杞柳中同源基因的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析表明,低温胁迫、渗透胁迫、ABA和H2O2均可诱导MeHB2基因的表达,而盐胁迫抑制其表达。此外,MeHB2的表达量还受到遮荫胁迫的诱导。研究表明,MeHB2在木薯非生物逆境调控中扮演重要角色。 相似文献
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中国热带植物种质资源的保护与创新利用 总被引:3,自引:3,他引:0
文章通过解析中国热带植物种质资源的收集、保存、鉴定和育种利用以及存在的问题,从遗传改良角度。归纳了热带植物的4个共性特征,据此提出资源保护和创新利用的7点战略构想。包括功能基因发掘、分子标记辅助选择、体细胞再生和加倍单倍体培育4项资源利用关键技术,并强调了基于分子指纹的原位保护、建圃保护、资源网络共享以及法规建设公共教育在完善濒危植物保护中的重要作用。 相似文献
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目的:目前,关于数字化表达谱差异分析的方法及软件极少,且需懂得R语言等,操作繁琐,这给数字表达谱分析带来了不少困难,DGE-P软件针对数字化表达谱开发的差异分析软件。方法:DGE-P软件,利用倍数分析及数字化基因表达谱差异基因检测方法,对通过本软件标准化后的数据进行差异显著性分析。结果:DGE-P软件包含了丰度统计、数据标准化、求倍数分析和p-value值三个模块。可得出倍数分析与数字化基因表达谱差异基因检测方法(p-value)两个值。结论:DGE-P较以前的差异分析软件相比是一款针对数字化表达谱分析的软件,克服了其他软件在无重复实验数据时无法避免误差的缺陷。并且DGE-P较其他的软件相比使用方便,可在windows系统下运行,操作简单。 相似文献
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厌氧胁迫下芝麻不同耐渍基因型形态、生理及矿质元素变化的比较研究 总被引:10,自引:3,他引:7
在部控制氧下比较4种不同耐渍基因型芝麻的形态,生理指数及营养器官矿质元素含量变化。结果表明,耐渍品种种野芝7号与豫芝1号不定根条数增加4-5倍,净光合速率(Ph)下降幅度小,ADH活性增加约2倍,根据Ca,P含量显著升高,K降幅较小,根中其元素以及茎、叶中8种元素呈下降趋势。非耐渍品种丹巴格与遂平小籽黄,不定根条数无明显增加,Pn下降50%-60%,ADH活性可升高5-9倍;根中Ca,P含量亦增高,K下降较多,耐渍基因型有明显的结构适应特征,厌氧代谢的能量补偿作用相对次要,Ca,P在芝麻对厌氧胁迫的生理适应中起重要作用。 相似文献