结合三代测序与二代测序技术揭示蜜蜂球囊菌孢子转录组的复杂性

【目的】蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)是一种专性侵染蜜蜂幼虫的致死性真菌病原。本研究旨在利用PacBio单分子实时(singlemoleculereal-time,SMRT)测序技术对蜜蜂球囊菌孢子(AaS)中基因的可变剪切(alternative splicing,AS)和可变多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)以及长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)进行鉴定和分析,进而揭示蜜蜂球囊菌孢子中转录组的复杂性。【方法】采用Suppa软件对蜜蜂球囊菌孢子中基因的AS事件进行鉴定。通过RT-PCR对不同类型的AS事件进行验证。采用TAPIS pipeline对蜜蜂球囊菌孢子基因的APA位点进行鉴定。利用MEME软件分析孢子全长转录本的poly(A)剪接位点上游50bp的序列特征并鉴定motif。联用CPC和CNCI软件和比对Swiss-prot数据库的方法预测lncRNA,取三者的交集作为高可信度的lncRNA集合。进一步比较lncRNA和mRNA的转录本长度,外显子数量与长度,内含子长度,GC含...     

番茄果实转录因子CNR的原核表达与纯化及其抗体的制备

转录因子CNR(Colourless non-ripening)在果实的发育和成熟过程中起重要作用。目前关于番茄转录因子CNR的研究主要集中在转录水平,然而蛋白水平才是CNR发挥作用的水平。通过对CNR进行原核表达和纯化,并制备CNR的多克隆抗体,在蛋白水平上确定番茄转录因子CNR的表达模式。结果表明:pET-CNR重组载体具有正确的读码框,且与已发表的番茄CNR编码序列完全一致,并且在27 kD处有CNR蛋白表达,证明pET-CNR原核表达载体构建成功。诱导剂IPTG的最适宜浓度为1.0mmol/L,当用咪唑浓度为500 mmol/L的洗脱缓冲液洗脱层析柱时得到单一的CNR蛋白,并以此作为抗原免疫小鼠,制得效价高且特异性好的CNR蛋白多克隆抗体。最后研究不同成熟时期番茄果实CNR蛋白的表达模式,结果发现转录因子CNR在番茄果实的破色期起重要作用。     

沙库巴曲缬沙坦钠片对高原地区慢性心力衰竭患者神经内分泌激素和心功能的影响

摘要 目的：探讨沙库巴曲缬沙坦钠片治疗高原地区慢性心力衰竭（CHF）患者的疗效及对神经内分泌激素和心功能的影响。方法：选取2017年3月~2019年6月期间我院接收的CHF患者109例。根据随机数字表法将患者随机分为对照组（n=54）和研究组（n=55）,对照组患者予以缬沙坦治疗,研究组患者则予以沙库巴曲缬沙坦钠片治疗,比较两组患者疗效、神经内分泌激素指标[去甲肾上腺素（NA）、醛固酮（ALD）、血管紧张素Ⅱ（AngⅡ）]和心功能指标[超敏心肌肌钙蛋白T（hs-cTnT）、N-末端脑钠肽前体（NT-proBNP）、左房内径（LAD）、左室舒张末期内径（LVEDD）以及左室射血分数（LVEF）]。记录两组患者心血管不良事件发生情况。结果：研究组患者治疗12周后总有效率为90.91%（50/55）,显著高于对照组患者的75.93%（41/54）（P<0.05）。两组治疗12周后ALD、NA、AngⅡ均下降,且研究组低于对照组（P<0.05）。两组治疗12周后hs-cTnT、NT-proBNP、LVEDD、LAD均下降,且研究组低于对照组（P<0.05）;LVEF升高,且研究组高于对照组（P<0.05）。两组心血管不良事件发生率对比无差异（P>0.05）。结论：沙库巴曲缬沙坦钠片治疗高原地区CHF患者,疗效显著,可有效改善神经内分泌激素水平和心功能,且不增加心血管不良事件发生率,临床应用价值较高。     

冻融季温带森林土壤真菌群落结构及功能类群对不同土壤有机碳输入的响应

根系与凋落物有机碳输入变化对土壤生物群落的影响研究是目前学术界关注的热点问题,但冻融季不同有机碳输入方式将对土壤真菌群落结构及功能类群产生何种影响尚不明确。土壤真菌群落是调节森林生态系统稳定性的重要因素,有助于维持生态系统生产力时间尺度的稳定性。为了探索冻融季温带森林土壤真菌群落对控制根系和凋落物有机碳输入方式的响应特征,通过在帽儿山生态站设置4种碳源输入控制处理植物残体添加去除(DIRT):去除凋落物仅根系输入处理、去除根系仅凋落物输入处理、无碳源输入处理和同时进行根系与凋落物输入处理,采用ITS rDNA高通量测序技术和FUNGuild功能预测平台,来分析控制根系和凋落物有机碳输入方式对温带森林土壤真菌群落结构和功能类群的影响。研究结果显示：(1)不同有机碳输入方式改变了土壤真菌类群的多度：与自然生长状态下有机碳输入方式相比,根系有机碳输入比凋落物有机碳输入对土壤真菌类群多度影响更明显,去除根系碳源输入处理使真菌群落中子囊菌门含量升高19.52%,担子菌门含量下降16.77%。(2)有机碳输入方式对土壤真菌群落功能类群产生影响：与自然生长状态下有机碳输入方式相比,去除根系碳源输入处...     

拟除虫菊酯微胶囊剂的应用研究

研究结果表明,应用二氯苯醚菊酯、氯氰菊酯和氰戊菊酯的3种微胶囊剂对赤拟谷盗、豆蚜、小菜粉蝶和粘虫室内测定及大田试验药效均为显著。处理后6天,死亡率90％左右,各天药效相当或略高于乳油。其残效期对赤拟谷盗24天,对其他3种试虫15天左右,相当于该类药剂乳油残效期的2倍。3种微胶囊剂的药效高低顺序依次为氯氰菊酯>二氯苯醚菊酯>氰戊菊酯,和其乳油效果高低的顺序基本相同。     

血清CD163、AFU、miR202在原发性肝癌诊断中的作用及在介入治疗前后的变化

摘要 目的：探讨血清CD163、α-L-岩藻糖苷酶（AFU）、微小核糖核酸202（miR202）在原发性肝癌诊断中的作用及在介入治疗前后的变化。方法：选择本院2018年5月~2020年6月收治的106例原发性肝癌患者，均予以肝动脉化疗栓塞术（TACE）治疗，同期选择本院收治的94例肝硬化患者纳入疾病对照组，门诊健康体检者113例纳入健康对照组。对比三组血清CD163、AFU、miR202，原发性肝癌患者治疗前后CD163、AFU、miR202。结果：原发性肝癌组血清CD163、AFU高于疾病对照组及健康对照组，差异有统计学意义（P<0.05），miR202低于对照组及健康对照组（P<0.05）；疾病对照组血清CD163、AFU高于健康对照组（P<0.05），miR202低于健康对照组（P<0.05）。原发性肝癌患者治疗后血清CD163、AFU低于治疗前，差异有统计学意义（P<0.05）；miR202高于治疗前，差异有统计学意义（P<0.05）。治疗前及治疗后，好转组血清CD163、AFU水平均低于无效组，差异有统计学意义（P<0.05），miR202高于无效组，差异有统计学意义（P<0.05）；治疗后，好转组血清CD163、AFU水平低于治疗前（P<0.05），miR202高于治疗前（P<0.05），无效组治疗前后血清CD163、AFU、miR202差异无统计学意义（P>0.05）。结论：血清CD163、AFU、miR202能够辅助原发性肝癌的诊断，又可为TACE的疗效评价提供参考依据。     

基于土壤异质背景的玉米秸秆覆盖度遥感反演

玉米秸秆覆盖还田是东北平原当前大力推广的一种保护性耕作方式。区域作物秸秆覆盖度(CRC)的遥感估算可大范围快速获取耕地秸秆覆盖还田信息,对于政府监测和推广秸秆覆盖还田工作有重要作用。本研究以吉林省梨树县为研究区,基于Sentinel-2A卫星影像,选取归一化耕作指数(NDTI)、归一化秸秆指数(NDRI)、简单耕作指数(STI)和归一化差值指数(NDI7)4种光谱指数,建立光谱指数与玉米秸秆覆盖度的线性回归模型,进行秸秆覆盖度反演。结果表明: 研究区土壤背景空间异质性较强,对光谱指数回归模型影响显著,采用土壤质地分类(分区)分别建立回归模型的方法可提高反演精度。土壤背景空间异质性会增大模型估算误差;4种光谱指数与玉米秸秆覆盖度均有较强相关性,其中,NDTI和STI模型表现更好;基于NDTI和STI的分区线性回归模型验证R²为0.84、RMSE为13.3%,优于不分区的模型(R²为0.75,RMSE为16.5%),有效提升了反演精度。     

高温对西花蓟马卵巢发育及卵黄蛋白含量的影响

【目的】为探明短时高温热激后西花蓟马 Frankliniella occidentalis (Pergande)生殖力和卵巢发育的相互关系。【方法】选择1龄、2龄若虫,预蛹,蛹和1日龄成虫,采用不同高温（41和45℃）短时（2 h）处理,观察卵巢发育及卵黄蛋白相对含量的变化。【结果】高温热激主要抑制了西花蓟马生殖器官和胚胎的正常发育,导致卵巢管数量减少,卵巢管和胚胎发育畸形;电泳结合不同的染色方法证明西花蓟马的卵黄蛋白为一种磷酸化、糖基化的脂蛋白,由3个亚基组成,分子量分别为116,70和47 kDa。除热激蛹期外,热激其他龄期的若虫对其当代成虫卵黄蛋白合成都起到抑制作用,且45℃热激1龄或2龄若虫后,其对卵黄蛋白相对含量的影响持续到了F₁代。【结论】温度对雌虫生殖力的影响是由于其对生殖器官发育和卵黄蛋白合成的影响引起的。本研究为西花蓟马的卵黄蛋白和卵黄发生的进一步研究奠定了基础。     

过表达和敲减ace-miR-3720对中华蜜蜂工蜂幼虫肠道的靶基因表达和重量的影响

【目的】本研究旨在明确ace-miR-3720在中华蜜蜂Apis cerana cerana工蜂幼虫肠道发育中的功能,并为进一步探究ace-miR-3720调控肠道发育的分子机理提供理论和实验依据。【方法】根据ace-miR-3720的核苷酸序列设计合成相应的模拟物mimic-miR-3720和抑制物inhibitor-miR-3720,通过饲喂中华蜜蜂工蜂幼虫对ace-miR-3720分别进行过表达和敲减。采用RT-qPCR检测过表达和敲减ace-miR-3720后4-6日龄幼虫肠道内ace-miR-3720及其靶基因CKⅠ,MAPK1和βGBP1的相对表达量;使用分析天平称重过表达和敲减ace-miR-3720后的幼虫肠道重量。【结果】相较于无义模拟物(nonsense mimic, mimic-NC)组,mimic-miR-3720组中ace-miR-3720表达量在中华蜜蜂4和5日龄幼虫肠道中均极显著上调,在6日龄幼虫肠道中显著上调;相较于无义抑制物(nonsense inhibitor, inhibitor-NC)组,inhibitor-miR-3720组中ace-miR-3...     

水稻种子耐淹特性研究

水稻直播的面积虽然呈逐年增加的趋势,但产量不稳定,其主要原因是水稻种子不耐淹导致直播种子成苗率低.本研究以445份水稻种子为材料,通过大田淹水和量筒淹深水两种模式开展水稻种子发芽和苗期的耐淹特性比较,筛选耐淹水稻品种.结果 表明,在大田淹水处理条件下,不同水稻种子耐淹特性差异明显,根据相对成苗率可分为耐淹、较耐淹、较敏...