粪肠球菌噬菌体vB_EfaP_IME195的生物学特性及其全基因组分析

【目的】以粪肠球菌为宿主菌,从医院的污水中筛选出相应的粪肠球菌噬菌体v B_Efa P_IME195,简称IME195,研究其生物学特性;并通过高通量测序得到其全基因组,深入研究其基因组学特征。【方法】以临床的耐药粪肠球菌为宿主菌,利用医院污水筛选噬菌体并纯化;对噬菌体IME195生物学特性进行了深入研究,包括电镜观察噬菌体形态、最佳感染复数、一步生长曲线、噬菌体IME195对紫外线的敏感度、对温度的耐受程度、对p H的耐受程度、对氯仿是否敏感;通过蛋白酶K/SDS法提取噬菌体IME195全基因组;Ion Torrent高通量测序;测序后进行噬菌体全基因组序列组装、注释、进化分析和比较分析。【结果】通过噬菌体梯度稀释,双层培养基平板法得到噬菌斑边缘分明、斑体透明的裂解性噬菌体IME195,最佳感染复数为0.01,一步生长曲线显示IME195的潜伏期为30 min,暴发量为11。该噬菌体对紫外线比较敏感,对5%浓度的氯仿不敏感,噬菌体对高温比较敏感,该噬菌体在p H 6.0-8.0范围内具有良好的裂解活性;电镜观察结果显示该噬菌体属于尾病毒目短尾噬菌体科;全基因组分析表明:噬菌体IME195基因组大小只有18 607 bp(Gen Bank登录号为KT932700),G+C含量仅为33%。BLASTn比对结果表明,该噬菌体和Gen Bank中的噬菌体v B_Efae230P-4只有82%的相似性。对噬菌体IME195进行了全基因组功能注释和进化分析。【结论】分离鉴定了一株粪肠球菌噬菌体,进行了生物学特性、全基因组测序和生物信息学深入分析,为噬菌体治疗多重耐药细菌奠定了基础。     

气候变化对海洋病毒生态特性及其生物地球化学效应的影响

摘要:病毒作为海洋中丰度最高的生命粒子,通过侵染和裂解宿主细胞影响宿主生理生态特性,改变海洋食物网的物质循环和能量流动,在海洋生物地球化学过程中扮演着重要角色。全球气候变化导致海面升温、海洋酸化、营养盐和海水盐度变化、低氧区扩大等海洋环境问题,对海洋病毒生理生态特性产生直接或间接的影响。本文从海洋病毒的生态功能和生物地球化学效应出发,概述了气候变化因子对病毒分布、丰度、生命策略以及与宿主之间相互作用等的影响,提出海洋病毒是全球气候变化研究中不可或缺的对象。     

剖宫产术中行子宫肌瘤剔除术可行性探讨

目的:观察剖宫产术中行子宫肌瘤剔除术的安全性及可行性。方法:将我院2010年1月-2012年1月入诊的90例子宫肌瘤的妊娠期孕妇,行剖宫产术同时行子宫肌瘤剔除术的患者,与同期83例单纯剖宫产手术患者对比研究,观察两种手术方式的临床疗效及其疾病预后分析。其主要比较的指标是平均手术时间、术中出血量、术后24h出血量、手术前后血红蛋白差值、平均住院时间、产褥病率及并发症等,记录并观察两组患者的上述指标,进行比较分析。结果:两组观察指标比较除剖宫产术中行子宫肌瘤剔除术平均手术时间(77.1±8.5)明显高于单纯剖宫产术(33.7±7.9),(t=34.70,P<0.05)外,其他各项测量术中出血量(t=0.09,P>0.05)、术后24h出血量(t=0.61,P>0.05)、手术前后血红蛋白差值(t=1.57,P>0.05)、住院时间(t=1.05,P>0.05)及产褥病率(x2=0.077,P>0.05),其他并发症发生率(x2=0.246,P>0.05)指标均无明显差异(P>0.05)。结论:对于有手术适应症的妊娠期子宫肌瘤孕妇,可根据患者及其家属医院选择剖宫产术同时行子宫肌瘤剔除术,该手术安全可靠,能避免二次手术或子宫切除等,临床上值得推广应用。     

龙须草种质资源生境特征与主要经济性状比较

龙须草(Eulaliopsis binata)是一种特色野生生物资源, 是优质造纸原料和防止水土流失的优良草种。以往针对龙须草种质资源收集和评价研究近于空白。本文通过对中国内陆龙须草种质资源集中分布的9省20县的实地考察, 收集了20个居群的龙须草样本, 分析了龙须草种质资源生境的主要特征, 并对龙须草种质资源主要经济性状进行比较。结果表明: 收集的龙须草种质资源集中分布于22°-34° N、101°-114° E, 海拔集中在100-1,000 m, 年平均气温在14-22℃, 年日照时数在1,112-2,624 h, 年平均降水量在642-2,330 mm之间。气候因子主成分分析显示, 龙须草分布受温度与降水量影响较大, 其次为海拔和日照时数。不同龙须草种质资源叶长、胞壁厚度、腔径、壁径比、产量等主要经济性状呈现出极显著差异。主要经济性状ward聚类可将收集的龙须草种质资源分为3类, 其中9个种质资源可优先作为优良龙须草筛选育种的参考对象。     

北京市海淀区部分快餐店套餐营养环境调查

利用研制的快餐店营养环境评价方案对海淀区内10个品牌、20家快餐店的42个套餐进行调查。结果显示：西式快餐的营养质量和烹调方法虽不如中式快餐,但可调整服务措施和营养信息较为丰富。日式盖饭及中式米饭类快餐的营养环境质量较为相似,中式面食类快餐的整体营养环境质量最高。     

非洲狼尾草珠心细胞核穿壁运动超微结构研究

用透射电子显微镜观察了非洲狼尾草珠心组织中细胞核穿壁运动。一个细胞核向相邻细胞转移时,可以进入一个或多个孔道：孔道直径0.33～0.68 μm。处于穿壁状态的细胞核染色质不正常地浓缩,电子密度大。     

生物序列拼接及其算法

生物序列拼接是鸟枪法(shotgun)测序中的一个重要环节.主要介绍了生物序列拼接及其研究中所涉及的一些基本问题,概述了两类主要的生物序列拼接算法,分析了其各自的特点,并对其进行了比较.     

野生紫果西番莲的开发利用

云南野杂果资源丰富,品种繁多。通过对野生紫果西番莲果实的营养成分分析和果实加工利用的研究,其营养丰富、味道鲜美,食疗效果显著,是高级天然饮料的理想原料,值得综合开发利用。     

植物生长物质在水稻生长发育研究中的应用

概述了主要植物生长物质在水稻生长发育中的作用机理及应用情况,对使用植物生长物质存在的问题进行了讨论和展望．     

反义RNA技术在花色育种中的应用

反义RNA技术是用反义RNA链去抑制靶基因的活性,从而达到对目的基因调控的一项分子生物学技术.该项技术应用于观赏植物的花色育种已有16年的历史并且取得了一定的成就.到目前为止,已经利用该技术对14种花卉花色形成过程中的3大类基因进行了正义和反义导入,获得了花色改变的转基因植株.本文简要回顾了反义RNA技术的产生与发展,并在介绍花色形成的分子生物学的基础上,综述了国际园艺育种中利用反义RNA技术调控花色基因表达的研究进展,以期为花色改良的分子育种提供参考资料.