不动杆菌属中aidE基因编码高丝氨酸内酯酶

群体感应(Quorum sensing,QS)是细菌在进化过程中形成的依赖于群体密度的细菌间交流方式。许多革兰氏阴性细菌以N-酰基高丝氨酸内酯(AHL)为信号分子,感应自身群体密度并调控致病基因表达。因此,淬灭AHLs信号分子可防治此类细菌引起的植物病害。本实验室前期已筛选得到了一株具有AHLs信号降解能力的不动杆菌菌株Acinetobacter sp.77,本研究通过基因组文库筛选,自菌株77中克隆得到具有AHLs降解活性的基因aidE。该基因编码268个氨基酸。序列一致性比较发现aidE的氨基酸序列与吉伦伯不动杆菌Acinetobacter gyllenbergii CIP110306中β-内酰胺酶一致性高达95%,但与已知的AHLs降解酶序列一致性较低,最高为缓黄分支杆菌Mycobacterium lentiflavum中AHL内酯酶Att M/Aii B家族蛋白(CQD23908.1),一致性仅为33%。通过高压液相色谱(HPLC)分析Aid E蛋白处理N-己酰基高丝氨酸内酯(C6-HSL)的反应产物,证明aidE为AHL内酯酶。序列比对研究发现,aidE基因在不动杆菌属中并不保守,其在菌株77基因组中的上下游的基因排列存在菌株水平的特异性,且aidE基因下游存在疑似IS插入序列,上述证据表明aidE基因有可能是通过水平转移进入Acinetobacter sp.77基因组中,或其在基因组中的位置发生过重排。表达aidE的软腐果胶杆菌Z3-3中完全检测不到AHLs信号产生,且致病力明显降低。综上所述,aidE为新发现的AHL内酯酶。在防治依赖QS系统表达致病性的细菌病害中具有应用潜力。     

扁桃休眠期前后结果枝内碳水化合物代谢特征及其与坐果的关系

选取连续3年持续低产和高产的2个果园作为研究对象,以新疆主栽品种‘纸皮’扁桃为试材,分析在休眠期前后结果枝韧皮部和花芽中碳水化合物组分及代谢过程中的相关酶活性变化差异,同时统计2个果园当年坐果和产量情况,探讨扁桃结果枝休眠期前后碳水化合物及相关酶活性代谢变化及其对坐果、产量的影响,为低产果园改造提供理论依据。结果显示:(1)休眠期扁桃结果枝中可溶性糖的积累以蔗糖和山梨醇为主。(2)休眠期前后高产和低产果园内扁桃结果枝中的碳水化合物与其代谢相关酶(酸性转化酶、中性转化酶、蔗糖合成酶、蔗糖磷酸合成酶等)活性变化趋势基本一致。(3)扁桃休眠期结果枝韧皮部和花芽中的碳水化合物含量和代谢相关酶活性基本表现为高产园大于低产园。研究表明,扁桃休眠期结果枝碳水化合物的积累以蔗糖和山梨醇为主,其含量与相关代谢酶活性密切相关,其积累水平直接影响着翌年扁桃的座果和产量。     

线粒体损伤相关模式分子与宿主免疫调节北大核心CSCD

线粒体是真核细胞至关重要的细胞器,参与机体细胞能量代谢和细胞凋亡等多种生物学过程。线粒体还参与机体的天然免疫反应的调节。线粒体不仅可以作为病毒免疫反应的载体,还可以通过产生ROS参与抗菌反应。线粒体受到损伤、刺激后,可释放mt DNA,TFAM,ROS,ATP,心磷脂和甲酰肽等内容物。这些分子可以作为损伤相关模式分子(damage-associated molecular patterns,DAMPs)被模式识别受体识别,从而参与宿主的免疫调节。研究表明,线粒体已成为内源性DAMPs的重要来源,在先天性免疫应答以及疾病进展过程中发挥着重要的作用。本文就线粒体来源的损伤相关模式分子在机体免疫调节中的作用进行综述。     

抓住机遇迎头赶上

四年前,中国生物工程学会曾组织过一次生物工程学术和产业开发研讨会,纯属短期行为,目的仅在于尽所能在学术与产业之间搭过桥,加速产业化进程。而这次有关人类后基因组与中国基因工程产业化的研讨则带有长久战略性目标的探讨。关于后基因组的问题去年９月在张家界学会...     

基于生态系统服务价值变化的焉耆盆地环境与经济协调发展

运用土地利用/覆被生态系统服务价值估算模型并结合生态与经济协调度,定量分析焉耆盆地1985、1990、1996、2000、2005和2011年土地利用/覆被变化引起的生态系统服务价值变化,并对研究区环境与经济协调发展的水平及区域差异进行评估.结果表明: 1985-2011年,焉耆盆地的湿地、水域、建设用地、耕地和沙地面积均增加;而草地、盐碱地和林地面积均减少;焉耆盆地的生态系统服务总价值呈逐渐增加趋势.其中,水域和耕地对生态系统服务总价值的贡献率最大,草地和林地对生态系统服务总价值的贡献呈明显下降.研究区生态经济的发展总体上处于低度冲突和低度协调水平的状态,对区域水土资源实行合理与有效的利用是实现焉耆盆地生态系统服务功能维持、发展与经济可持续、协调发展的关键.
     

雪花莲外源凝集素基因转化番茄

将含有雪花莲外源凝集素基因（ＧＮＡ）的质粒ｐＲＳＳＧＮＡ１通过冻融法转化到根癌土壤杆菌９Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓ（Ｓｍｉｔｈ ｅｔ Ｔｏｗｎｓｅｎｄ）Ｃｏｎｎ）菌株ＬＢＡ４４０４中。采用叶盘法转化番茄（Ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｏｎ ｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ Ｍｉｌｌ．）栽培品种“Ｃ８”、“Ａ３９”和“Ａ５３”,获得了含ＧＮＡ基因的４３株转化植物株。通过卡那霉素抗性鉴定、ＮＰＴⅡ基     

大丽轮枝菌的含钼协同因子基因位点*

含银协同因子在一些真菌中是硝酸还原酶和黄瞟吟脱氨酶1和11的辅助因子;在用KO03为诱变剂以获得n人突变体的试验中,nljB型突变体就是由于该辅酶的基因位点发生突变所致（luf,1981）。利用nitB突变体测定含铜协同因子的基因位点,在不同的真菌中得到的结果不同。Coye（197）测出的ASpeFgillusnidulansWint含钻协同因子有五个基因位点,Newton（1988）测定脚lorianodorumBerk的结果是四个。作者在做营养体亲和性分析时,观察到大丽轮技菌（Verticilliu。山hliaekleb．）的nitB突变体可以互补。但迄今为止,有关此菌的含银协同因子的…     

赤霉菌原生质体DNA转化*

Methods for the protoplast preparation and DNA transformation of Gibberella fujikuroi were established. The protoplasts were transformed with plasmid pAN7-1, which carries hygromycin B resistant gene (hPh), and the transformation frequency was about 10. Some transformants grew vigorously on the selectivemedium containing 400μg / ml of hygromycin B, while the minimum inhibitory concentration (MIC) of the antibiotic to the recipient strain was oniy 20μg / ml. Southern hybridization showed that the hph gene ha…     

新定量PCR数据处理方法的理论探讨

日新月异的生命科学技术的发展及临床医学科学研究的需求,一般的PCR技术已远远不能满足工作的需要。PE公司在进行了大量的PCR动力学研究的基础上,发现了利用荧光标记探针在PCR循环过程中积累的荧光强度达到仪器捡出阈值时,系统的初始模板数量与循环次数之间有线性关系,据此建立了目前的PE 7700 、PE 5700仪器的定量PCR技术,开创了PCR技术的新局面。但是由于这一技术的误差较大,尚不能满足生命科学及临床医学科学研究的需求,因此需要继续研究新的定量PCR技术。PCR动力学数学模型是根据PCR 技术的原理提出的,能够准确描述PCR反应产物分子数量积累规律的动力学方程,给出了PCR产物数量或者荧光强度与初始模板数量及其他反应条件间的函数关系。利用这一关系,根据PCR反应已积累的产物数量,可以实现准确的定量PCR分析,得到初始模板数量达到定量PCR的目的。使用动力学数学模型做定量PCR分析,其结果的误差仅与使用的荧光强度数值的精确度相关。使用精确到6位数的荧光强度数据,模板数自100~1 000 000区间定量结果的准确性可达99%以上。本文根据模拟实验数据进行了初步的定量PCR分析,结果提示,目前的定量PCR仪器使用PCR动力学模型理论处理分析数据,定量分析的结果会比目前的CT值方法在准确性方面提高几十倍以上,可以满足各方面研究工作误差水平的需要。 Abstract:Today standard PCR can't satisfy the need of biotechnique development and clinical research any more.After numerous dynamic research,PE company found there is a linear relation between initial template number and cycling time when the accumulating fluorescent product is detectable.Therefore,they developed a quantitative PCR technique to be used in PE7700 and PE5700.But the error of this technique is too great to satisfy the need of biotechnique development and clinical research.A better quantitative PCR technique is needed.The mathematical model submitted here is combined with the achievement of relative science,and based on the PCR principle and careful analysis of molecular relationship of main members in PCR reaction system.This model describes the function relation between product quantity or fluorescence intensity and initial template number and other reaction conditions,and can reflect the accumulating rule of PCR product molecule accurately.Accurate quantitative PCR analysis can be made use this function relation.Accumulated PCR product quantity can be obtained from initial template number.Using this model to do quantitative PCR analysis,result error is only related to the accuracy of fluorescence intensity or the instrument used.For an example,when the fluorescence intensity is accurate to 6 digits and the template size is between 100 to 1 000 000,the quantitative result accuracy will be more than 99%.The difference of result error is distinct using same condition,same instrument but different analysis method.Moreover,if the PCR quantitative analysis system is used to process data,it will get result 80 times of accuracy than using CT method.     

植物基因工程进展

一、植物基因工程的回顾和展望 从1974研究Ti质粒开始至今已15年,这期间植物基因工程取得了比预期要快得多的进展,重要的突破集中在以下两方面: 1.外源基因转入植物体内的方法不断改进: 1983年整合型的Ti质粒和双元型Ti质粒转化系统的建立,使外源基因可高频率地整合至受体染色体中并获高效表达 1985-1986利用PEG。